More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5197 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7832  putative sugar ABC transporter ATP-binding protein  66.16 
 
 		 541 aa  682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5197  ABC transporter related  100 
 
 		 540 aa  1084    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1398  ABC sugar transporter, ATPase subunit  90.35 
 
 		 539 aa  966    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00538368  normal  0.128237 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  39.22 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  39.32 
 
 		 497 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  42.58 
 
 		 519 aa  382  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  37.45 
 
 		 495 aa  375  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  42.89 
 
 		 498 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  41.11 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  38.67 
 
 		 513 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  40.31 
 
 		 503 aa  362  1e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  40.58 
 
 		 511 aa  362  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  41.3 
 
 		 503 aa  362  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  39.42 
 
 		 502 aa  361  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.91 
 
 		 492 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  41.25 
 
 		 512 aa  357  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  37.89 
 
 		 497 aa  357  2.9999999999999997e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  39.65 
 
 		 503 aa  357  3.9999999999999996e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  36.5 
 
 		 495 aa  355  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  40.88 
 
 		 514 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  40.23 
 
 		 508 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.98 
 
 		 517 aa  354  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  38.88 
 
 		 525 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  40.81 
 
 		 585 aa  353  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  36.8 
 
 		 492 aa  353  5e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  37.97 
 
 		 494 aa  353  5.9999999999999994e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  39.6 
 
 		 497 aa  353  5.9999999999999994e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  41.97 
 
 		 500 aa  353  5.9999999999999994e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  40.31 
 
 		 520 aa  352  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  37 
 
 		 501 aa  352  8.999999999999999e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.11 
 
 		 512 aa  352  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  40.31 
 
 		 508 aa  352  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  39.18 
 
 		 504 aa  351  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  40.32 
 
 		 504 aa  351  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  39.81 
 
 		 503 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  39.54 
 
 		 514 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  39.54 
 
 		 514 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  39.54 
 
 		 514 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  39.11 
 
 		 512 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  39.11 
 
 		 512 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 501 aa  350  5e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  40.08 
 
 		 511 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  40 
 
 		 512 aa  349  7e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  36.63 
 
 		 501 aa  349  9e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  39.92 
 
 		 513 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  38.97 
 
 		 513 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.911905 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  38.91 
 
 		 514 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  39.28 
 
 		 513 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  39.26 
 
 		 516 aa  348  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  35.64 
 
 		 500 aa  347  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  38.87 
 
 		 514 aa  347  3e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  35.49 
 
 		 504 aa  347  3e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  38.74 
 
 		 503 aa  347  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 499 aa  347  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  37.02 
 
 		 499 aa  347  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7365  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  39.15 
 
 		 506 aa  347  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.568459  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3961  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.68 
 
 		 515 aa  346  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  35.92 
 
 		 501 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  39.16 
 
 		 495 aa  346  6e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  37.64 
 
 		 505 aa  346  6e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  37.02 
 
 		 499 aa  346  7e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.8 
 
 		 522 aa  345  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  37.11 
 
 		 496 aa  345  8e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  40.62 
 
 		 516 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.88 
 
 		 525 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 		 494 aa  345  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  37.96 
 
 		 494 aa  345  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.96 
 
 		 494 aa  345  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  39.62 
 
 		 525 aa  344  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  40.82 
 
 		 515 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  40.33 
 
 		 504 aa  344  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  36.66 
 
 		 509 aa  344  2e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  40 
 
 		 506 aa  344  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  37.88 
 
 		 505 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8259  ABC transporter-related protein  40.57 
 
 		 509 aa  344  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332477  decreased coverage  0.00989255 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.69 
 
 		 515 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4133  ABC transporter related  40.69 
 
 		 502 aa  343  4e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.69 
 
 		 515 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.69 
 
 		 515 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  36.59 
 
 		 520 aa  343  4e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.77 
 
 		 494 aa  343  5e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  37.52 
 
 		 492 aa  343  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  38.51 
 
 		 523 aa  343  7e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  39.11 
 
 		 513 aa  342  8e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.91 
 
 		 494 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  37.48 
 
 		 510 aa  342  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  40.66 
 
 		 517 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.69 
 
 		 519 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  38.45 
 
 		 528 aa  341  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.15 
 
 		 515 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  35.57 
 
 		 498 aa  341  2e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.13 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0249  ABC transporter component  41.11 
 
 		 493 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0268324  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.57 
 
 		 494 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  37.53 
 
 		 501 aa  340  4e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  38.1 
 
 		 513 aa  340  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  36.92 
 
 		 511 aa  340  5e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  37.02 
 
 		 496 aa  339  8e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  38.33 
 
 		 504 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  36.56 
 
 		 494 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>