More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2876 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2759  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  65.74 
 
 		 512 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2995  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  85.66 
 
 		 522 aa  877    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43610  ABC transporter  66.6 
 
 		 516 aa  635    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00213135  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2876  ABC transporter  100 
 
 		 523 aa  1037    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2994  ABC transporter related  65.74 
 
 		 512 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5167  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  58.01 
 
 		 517 aa  548  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5973  ABC transporter related  56.86 
 
 		 516 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6460  ABC transporter related  57.68 
 
 		 516 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121658  normal  0.108747 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1027  ABC transporter related  52.14 
 
 		 502 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2366  ABC sugar (ribose) transporter, fused ATPase subunits  52.24 
 
 		 502 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4172  ABC transporter related  47.55 
 
 		 504 aa  480  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1425  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.49 
 
 		 601 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148525  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0023  ABC transporter ATP-binding protein  43.09 
 
 		 875 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0415  ribose transport ATP-binding protein rbsA  43.17 
 
 		 605 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150209  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1512  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.17 
 
 		 605 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1165  ribose transport ATP-binding protein RbsA  43.17 
 
 		 605 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.20892  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0136  ribose transport ATP-binding protein RbsA  42.99 
 
 		 605 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.155752  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  37.42 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  38.41 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  40.73 
 
 		 499 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  42.91 
 
 		 519 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  40.35 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  40.24 
 
 		 506 aa  369  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  36.57 
 
 		 496 aa  365  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  41.22 
 
 		 515 aa  369  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  39.17 
 
 		 507 aa  365  1e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  39.17 
 
 		 507 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  38.18 
 
 		 497 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.17 
 
 		 507 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  36.57 
 
 		 496 aa  364  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  42.6 
 
 		 508 aa  363  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  41.03 
 
 		 512 aa  361  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  38.45 
 
 		 517 aa  361  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  38.88 
 
 		 504 aa  361  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  40.65 
 
 		 517 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2723  ABC transporter related  41.97 
 
 		 515 aa  360  3e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  38.34 
 
 		 503 aa  360  3e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  41.77 
 
 		 504 aa  360  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  36.78 
 
 		 506 aa  360  5e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  39.51 
 
 		 501 aa  360  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  36.78 
 
 		 506 aa  359  5e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  36.78 
 
 		 506 aa  360  5e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 		 515 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  36.78 
 
 		 506 aa  359  6e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.77 
 
 		 515 aa  359  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1509  ABC transporter related protein  36.78 
 
 		 506 aa  359  8e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521077  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.3 
 
 		 522 aa  359  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1499  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  36.78 
 
 		 506 aa  359  8e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2283  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  36.78 
 
 		 506 aa  359  8e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  36.78 
 
 		 506 aa  359  8e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.73 
 
 		 515 aa  359  8e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1060  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.09 
 
 		 506 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  39.39 
 
 		 520 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 		 494 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  36.64 
 
 		 495 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.57 
 
 		 515 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  38.6 
 
 		 506 aa  358  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  36.51 
 
 		 494 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 		 494 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  36.81 
 
 		 505 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2379  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  36.35 
 
 		 506 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  37.9 
 
 		 501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 		 494 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 		 494 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 		 494 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2335  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  36.35 
 
 		 506 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.728797  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2424  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  36.35 
 
 		 506 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.31 
 
 		 494 aa  356  5e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2749  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  36.66 
 
 		 506 aa  356  5e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  39.13 
 
 		 514 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.31 
 
 		 494 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.88 
 
 		 512 aa  355  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  35.7 
 
 		 496 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.41 
 
 		 525 aa  354  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2428  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  36.24 
 
 		 506 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  36.31 
 
 		 507 aa  355  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  40.16 
 
 		 516 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.91 
 
 		 519 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  37.2 
 
 		 513 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  36.71 
 
 		 494 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  41.1 
 
 		 506 aa  353  5e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  38.51 
 
 		 506 aa  353  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  38.54 
 
 		 504 aa  352  8e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2996  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.68 
 
 		 506 aa  352  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0156  ABC transporter related  38.91 
 
 		 517 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000343593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  39.39 
 
 		 514 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  36.42 
 
 		 511 aa  351  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  39.39 
 
 		 514 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 		 492 aa  350  4e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  39.39 
 
 		 514 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1564  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.27 
 
 		 502 aa  350  4e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  39.25 
 
 		 513 aa  350  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0150  ABC transporter related  39.31 
 
 		 517 aa  349  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995169  normal  0.0204884 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  38.13 
 
 		 511 aa  349  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3961  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.31 
 
 		 515 aa  349  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2599  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.8 
 
 		 509 aa  349  9e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2340  xylose transporter ATP-binding subunit  42 
 
 		 519 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  36.59 
 
 		 494 aa  348  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  38.8 
 
 		 512 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  38.8 
 
 		 512 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>