More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1425 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0023  ABC transporter ATP-binding protein  97.27 
 
 		 875 aa  986    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0136  ribose transport ATP-binding protein RbsA  98.62 
 
 		 605 aa  964    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.155752  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0415  ribose transport ATP-binding protein rbsA  98.8 
 
 		 605 aa  967    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150209  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1512  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  97.59 
 
 		 605 aa  969    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1425  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 601 aa  1154    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148525  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1165  ribose transport ATP-binding protein RbsA  98.8 
 
 		 605 aa  967    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.20892  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2759  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.19 
 
 		 512 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6460  ABC transporter related  48.04 
 
 		 516 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121658  normal  0.108747 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2994  ABC transporter related  47.19 
 
 		 512 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43610  ABC transporter  48.92 
 
 		 516 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00213135  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5973  ABC transporter related  47.48 
 
 		 516 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2876  ABC transporter  43.66 
 
 		 523 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2995  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.77 
 
 		 522 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5167  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  43.88 
 
 		 517 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4172  ABC transporter related  39.85 
 
 		 504 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2366  ABC sugar (ribose) transporter, fused ATPase subunits  41.97 
 
 		 502 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1027  ABC transporter related  41.97 
 
 		 502 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  39.96 
 
 		 514 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  39.96 
 
 		 514 aa  348  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  39.96 
 
 		 514 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  33.95 
 
 		 495 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  38.01 
 
 		 520 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  35.19 
 
 		 509 aa  332  9e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  37.97 
 
 		 514 aa  331  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  35.19 
 
 		 520 aa  330  3e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  33.64 
 
 		 496 aa  331  3e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  40.18 
 
 		 505 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  39.82 
 
 		 503 aa  330  5.0000000000000004e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  37.48 
 
 		 515 aa  330  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  38.96 
 
 		 516 aa  329  9e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  37.34 
 
 		 517 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  36.19 
 
 		 517 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2723  ABC transporter related  38.24 
 
 		 515 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  33.65 
 
 		 498 aa  327  3e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  36.28 
 
 		 497 aa  327  5e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  36.76 
 
 		 506 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  31.42 
 
 		 504 aa  324  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  37.5 
 
 		 500 aa  324  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  39 
 
 		 497 aa  324  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  33.27 
 
 		 499 aa  322  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  33.27 
 
 		 499 aa  322  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  40.19 
 
 		 504 aa  322  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 		 499 aa  322  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  32.04 
 
 		 498 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  35.68 
 
 		 525 aa  320  3.9999999999999996e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  38.42 
 
 		 495 aa  320  6e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  40.33 
 
 		 500 aa  320  7e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  37.29 
 
 		 501 aa  319  9e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  37.86 
 
 		 512 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  39.82 
 
 		 518 aa  318  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4600  ABC transporter related  37.81 
 
 		 513 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.911905 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  39.78 
 
 		 519 aa  316  6e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  32.66 
 
 		 494 aa  316  7e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  39.23 
 
 		 508 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  37.87 
 
 		 513 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  38.39 
 
 		 513 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.13 
 
 		 492 aa  315  1.9999999999999998e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7365  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  36.48 
 
 		 506 aa  315  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.568459  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  31.73 
 
 		 499 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  30.26 
 
 		 493 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 		 501 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  32.1 
 
 		 496 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  35.91 
 
 		 507 aa  314  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 		 507 aa  314  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  35.99 
 
 		 511 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  35.6 
 
 		 506 aa  313  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  36.1 
 
 		 507 aa  313  6.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  31.99 
 
 		 507 aa  313  6.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3418  ABC transporter related  38.55 
 
 		 526 aa  313  6.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  37.3 
 
 		 525 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  37.64 
 
 		 513 aa  312  9e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  32.47 
 
 		 494 aa  312  9e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  32.47 
 
 		 494 aa  312  9e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  32.47 
 
 		 494 aa  312  9e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  34.23 
 
 		 524 aa  312  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  36.5 
 
 		 506 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  37.64 
 
 		 512 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  32.96 
 
 		 501 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  32.1 
 
 		 494 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  37.64 
 
 		 512 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  37.1 
 
 		 513 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  37.96 
 
 		 510 aa  310  4e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  32.29 
 
 		 494 aa  310  5e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  32.1 
 
 		 494 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  32.1 
 
 		 494 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  33.46 
 
 		 500 aa  310  6.999999999999999e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  37.98 
 
 		 511 aa  310  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  36.96 
 
 		 514 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2089  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 504 aa  309  9e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558184  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  32.29 
 
 		 496 aa  309  9e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 516 aa  309  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  35.01 
 
 		 513 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  36.09 
 
 		 514 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  33.39 
 
 		 499 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  34.14 
 
 		 492 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  37.52 
 
 		 504 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  33.39 
 
 		 499 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  36.91 
 
 		 510 aa  307  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  35.11 
 
 		 511 aa  307  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  32.66 
 
 		 501 aa  307  3e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>