More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5167 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_5973  ABC transporter related  70.06 
 
 		 516 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5167  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  100 
 
 		 517 aa  1030    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6460  ABC transporter related  70.16 
 
 		 516 aa  681    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121658  normal  0.108747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2759  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.31 
 
 		 512 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2994  ABC transporter related  56.31 
 
 		 512 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2876  ABC transporter  58.01 
 
 		 523 aa  548  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43610  ABC transporter  55.8 
 
 		 516 aa  540  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00213135  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2995  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.88 
 
 		 522 aa  535  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4172  ABC transporter related  51.22 
 
 		 504 aa  512  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1027  ABC transporter related  52.72 
 
 		 502 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2366  ABC sugar (ribose) transporter, fused ATPase subunits  52.72 
 
 		 502 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  41.18 
 
 		 496 aa  402  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.78 
 
 		 497 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 		 494 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  40.57 
 
 		 494 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 		 494 aa  395  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 		 494 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 		 494 aa  395  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  40.16 
 
 		 496 aa  398  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 		 494 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  40.08 
 
 		 505 aa  394  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  43.38 
 
 		 504 aa  393  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.16 
 
 		 494 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.96 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  43.56 
 
 		 514 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0023  ABC transporter ATP-binding protein  43.67 
 
 		 875 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1165  ribose transport ATP-binding protein RbsA  43.78 
 
 		 605 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.20892  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1425  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.11 
 
 		 601 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148525  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2723  ABC transporter related  45.08 
 
 		 515 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  41.87 
 
 		 517 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0415  ribose transport ATP-binding protein rbsA  43.78 
 
 		 605 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150209  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1512  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.78 
 
 		 605 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  43.56 
 
 		 508 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  42.6 
 
 		 499 aa  382  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  42.22 
 
 		 522 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  41.63 
 
 		 515 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0136  ribose transport ATP-binding protein RbsA  43.6 
 
 		 605 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.155752  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1060  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.9 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  41.13 
 
 		 520 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  38.83 
 
 		 496 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  40.98 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1509  ABC transporter related protein  39.8 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521077  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 		 492 aa  373  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1499  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.8 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0667  ribose ABC transporter ATP-binding protein  40.69 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  39.1 
 
 		 493 aa  374  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.8 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  40.16 
 
 		 513 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  41.96 
 
 		 519 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  43.36 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.8 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.6 
 
 		 506 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  41.57 
 
 		 507 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2283  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.8 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  39.6 
 
 		 506 aa  372  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2996  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.08 
 
 		 506 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  38.39 
 
 		 524 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  41.83 
 
 		 516 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  39.2 
 
 		 508 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  41.99 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  39.6 
 
 		 506 aa  372  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  40.97 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  38.6 
 
 		 495 aa  371  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  41.65 
 
 		 519 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1338  ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 		 497 aa  372  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.375231 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  38.79 
 
 		 503 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  40.16 
 
 		 525 aa  367  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.99 
 
 		 512 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  40.2 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2379  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.4 
 
 		 506 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  42.77 
 
 		 511 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2749  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.15 
 
 		 506 aa  365  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  41.38 
 
 		 513 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2428  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.6 
 
 		 506 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1564  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.55 
 
 		 502 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  39.52 
 
 		 500 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  43 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2335  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.4 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.728797  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2424  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.4 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  41.04 
 
 		 513 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  38.72 
 
 		 494 aa  362  6e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  41.06 
 
 		 514 aa  363  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  37.1 
 
 		 506 aa  362  6e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  40.85 
 
 		 512 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  40.85 
 
 		 512 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  38.49 
 
 		 494 aa  362  1e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  39.76 
 
 		 504 aa  361  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  40.84 
 
 		 514 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  36.97 
 
 		 498 aa  361  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  36.78 
 
 		 501 aa  361  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  39.63 
 
 		 500 aa  360  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  42.18 
 
 		 525 aa  360  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3018  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38 
 
 		 506 aa  360  4e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2565  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38 
 
 		 506 aa  360  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  38.82 
 
 		 499 aa  360  4e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  40.64 
 
 		 514 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  40.64 
 
 		 514 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2466  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38 
 
 		 506 aa  360  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  39.84 
 
 		 501 aa  359  5e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.78 
 
 		 501 aa  360  5e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>