More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3058 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3058  ABC transporter related  100 
 
 
502 aa  1005    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00083367  normal  0.295827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 
494 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 
494 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.53 
 
 
494 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.53 
 
 
494 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.33 
 
 
494 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 
494 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.33 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 
494 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  45.89 
 
 
499 aa  418  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.65 
 
 
525 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  44.09 
 
 
501 aa  415  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  44.2 
 
 
525 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3088  ABC transporter related  46.41 
 
 
512 aa  410  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0116674  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  42.42 
 
 
513 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  40.04 
 
 
504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  40.61 
 
 
496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  43.82 
 
 
501 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  41.38 
 
 
501 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  44.29 
 
 
503 aa  408  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  43.12 
 
 
496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  42.74 
 
 
496 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  43.63 
 
 
501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  43.57 
 
 
497 aa  402  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  43.55 
 
 
503 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  43.71 
 
 
501 aa  402  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  42.89 
 
 
500 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  43.2 
 
 
514 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  42.86 
 
 
495 aa  404  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 
523 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  42.71 
 
 
501 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  44.25 
 
 
505 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6154  putative sugar (D-ribose) ABC transporter ATP-binding protein  43.6 
 
 
500 aa  402  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0328934 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  43.29 
 
 
501 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  45.47 
 
 
495 aa  401  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  44.76 
 
 
861 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1060  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  41.05 
 
 
506 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  42.28 
 
 
501 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  42.83 
 
 
501 aa  398  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  45.06 
 
 
517 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  43.55 
 
 
516 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0667  ribose ABC transporter ATP-binding protein  45.36 
 
 
461 aa  397  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  43.79 
 
 
514 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  43.55 
 
 
514 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  43.09 
 
 
504 aa  397  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  42.94 
 
 
514 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  43.55 
 
 
514 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  42.08 
 
 
501 aa  395  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  42.08 
 
 
501 aa  395  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  42.08 
 
 
501 aa  395  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  43.2 
 
 
516 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  41.01 
 
 
494 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 
517 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  45.06 
 
 
517 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  42.22 
 
 
516 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2996  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.69 
 
 
506 aa  393  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0211  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.6 
 
 
517 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40873  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  42.17 
 
 
501 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40.52 
 
 
497 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.66 
 
 
516 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  44.58 
 
 
513 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  44.86 
 
 
517 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  42.08 
 
 
501 aa  394  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  42.22 
 
 
516 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  42.08 
 
 
501 aa  395  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  43.89 
 
 
515 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  41.35 
 
 
524 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  42.22 
 
 
516 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  42.08 
 
 
501 aa  395  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  42 
 
 
516 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  44.86 
 
 
517 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  41.87 
 
 
503 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  41.78 
 
 
511 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  42.8 
 
 
520 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  42.71 
 
 
512 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  43.15 
 
 
509 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  42.14 
 
 
501 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  43.46 
 
 
509 aa  395  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  41.67 
 
 
511 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.4 
 
 
517 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.4 
 
 
517 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  41.78 
 
 
506 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2466  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 
506 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  44.02 
 
 
528 aa  391  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3125  ABC transporter related  44.33 
 
 
495 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1964  ABC transporter related  44.07 
 
 
513 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.962291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  44.88 
 
 
508 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  44.87 
 
 
500 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  41.92 
 
 
513 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  41.78 
 
 
503 aa  389  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 
501 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3018  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 
506 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  40.72 
 
 
501 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  41.72 
 
 
513 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  44.27 
 
 
517 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1519  ABC transporter related  44.66 
 
 
517 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0747025  normal  0.022294 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2565  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  40.52 
 
 
506 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  43.35 
 
 
514 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  43.66 
 
 
504 aa  385  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  43.55 
 
 
512 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>