More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5925 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5925  ABC transporter related  100 
 
 		 504 aa  1008    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737944  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5517  ABC transporter related  78.44 
 
 		 516 aa  783    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422457  normal  0.0683787 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2343  ATP binding protein of ABC transporter  89.09 
 
 		 502 aa  868    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4809  ABC transporter related  73.91 
 
 		 549 aa  722    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173038  hitchhiker  0.00297179 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  93.45 
 
 		 504 aa  942    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6194  ABC transporter related  99.21 
 
 		 504 aa  1000    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  93.45 
 
 		 504 aa  941    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  93.45 
 
 		 504 aa  942    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5962  ABC transporter related  92.26 
 
 		 503 aa  913    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0248969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  63.78 
 
 		 525 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  63.78 
 
 		 525 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  60.36 
 
 		 511 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  58.33 
 
 		 506 aa  561  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  53.59 
 
 		 510 aa  556  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  57.08 
 
 		 503 aa  525  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  51.6 
 
 		 500 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  51.7 
 
 		 499 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  52.09 
 
 		 526 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  55.24 
 
 		 529 aa  514  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  51.5 
 
 		 499 aa  513  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  50.7 
 
 		 499 aa  513  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  57.83 
 
 		 505 aa  513  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  54.64 
 
 		 504 aa  511  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  50.3 
 
 		 499 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  53.74 
 
 		 505 aa  508  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01030  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 522 aa  498  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  54.04 
 
 		 507 aa  496  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  54.28 
 
 		 507 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  52.64 
 
 		 507 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  47.9 
 
 		 513 aa  488  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  55.01 
 
 		 516 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.43 
 
 		 500 aa  481  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  51.22 
 
 		 500 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  51.22 
 
 		 500 aa  482  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  51.22 
 
 		 500 aa  481  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  51.22 
 
 		 500 aa  481  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.22 
 
 		 500 aa  480  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  51.22 
 
 		 500 aa  480  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  47.98 
 
 		 523 aa  478  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  49.09 
 
 		 501 aa  472  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  49.9 
 
 		 500 aa  474  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4067  ABC transporter related  50.71 
 
 		 496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0148  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  50.51 
 
 		 496 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0476  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  50.71 
 
 		 496 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4228  ABC transporter related protein  50.6 
 
 		 506 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  50.2 
 
 		 506 aa  462  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0767  putative sugar uptake ABC transporter ATP-binding protein  49.6 
 
 		 501 aa  464  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162932 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0969  ABC transporter related  49.69 
 
 		 500 aa  463  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  47.5 
 
 		 512 aa  455  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1417  ABC transporter related  48.59 
 
 		 515 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441776  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4767  ABC transporter-related protein  49.8 
 
 		 503 aa  435  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.883977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  47.84 
 
 		 544 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  46.86 
 
 		 544 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  48.29 
 
 		 526 aa  423  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.552248  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  49.5 
 
 		 519 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  42.22 
 
 		 504 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  44.58 
 
 		 497 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  41.43 
 
 		 503 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  41.4 
 
 		 497 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0277  ABC transporter related  45.09 
 
 		 511 aa  388  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.277921  normal  0.268674 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  38.65 
 
 		 504 aa  386  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  39.84 
 
 		 500 aa  385  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  43.66 
 
 		 512 aa  385  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  41.15 
 
 		 517 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43 
 
 		 512 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  40.32 
 
 		 506 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  41.05 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  42.12 
 
 		 514 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  41.4 
 
 		 508 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  41.77 
 
 		 495 aa  375  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  42.86 
 
 		 511 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.55 
 
 		 518 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.7 
 
 		 516 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  38.42 
 
 		 501 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  42.03 
 
 		 512 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  43.5 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  42.03 
 
 		 512 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  40.92 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.31 
 
 		 522 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  42.26 
 
 		 537 aa  373  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  40.24 
 
 		 520 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  43 
 
 		 508 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  41.37 
 
 		 505 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  39.6 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.77 
 
 		 515 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.77 
 
 		 515 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  39.92 
 
 		 507 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  38 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 		 507 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  41.73 
 
 		 513 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  40.72 
 
 		 513 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  38 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.77 
 
 		 515 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  41.92 
 
 		 507 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  41.06 
 
 		 510 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  39.92 
 
 		 507 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  39.52 
 
 		 506 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4133  ABC transporter related  42.2 
 
 		 502 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  41.77 
 
 		 513 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  44.69 
 
 		 525 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>