More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6222 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 503 aa  996    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  65.45 
 
 		 505 aa  618  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  62.3 
 
 		 507 aa  615  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  59.84 
 
 		 529 aa  593  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  55.16 
 
 		 513 aa  570  1e-161  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  55.8 
 
 		 510 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01030  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  55.82 
 
 		 522 aa  555  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  56.39 
 
 		 504 aa  550  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  55.16 
 
 		 526 aa  548  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  56.25 
 
 		 525 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  56.25 
 
 		 525 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4809  ABC transporter related  55.6 
 
 		 549 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173038  hitchhiker  0.00297179 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5962  ABC transporter related  57.23 
 
 		 503 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0248969 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  56.42 
 
 		 504 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  56.42 
 
 		 504 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  56.42 
 
 		 504 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  56.26 
 
 		 505 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5517  ABC transporter related  56.91 
 
 		 516 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422457  normal  0.0683787 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5925  ABC transporter related  55.91 
 
 		 504 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737944  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6194  ABC transporter related  56.91 
 
 		 504 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  57.09 
 
 		 511 aa  520  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.47 
 
 		 516 aa  521  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0476  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  54.67 
 
 		 496 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0148  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  54.47 
 
 		 496 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4067  ABC transporter related  54.67 
 
 		 496 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  51.51 
 
 		 499 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  54.87 
 
 		 506 aa  512  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  54.16 
 
 		 507 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  55.25 
 
 		 507 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  51.91 
 
 		 499 aa  514  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  53.04 
 
 		 501 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  53.54 
 
 		 500 aa  511  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  53.13 
 
 		 500 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0969  ABC transporter related  53.24 
 
 		 500 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  53.13 
 
 		 500 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  51.51 
 
 		 500 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  51.51 
 
 		 499 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  51.71 
 
 		 499 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.18 
 
 		 500 aa  503  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  53.13 
 
 		 500 aa  504  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.13 
 
 		 500 aa  503  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2343  ATP binding protein of ABC transporter  56.43 
 
 		 502 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.13 
 
 		 500 aa  503  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  53.13 
 
 		 500 aa  504  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  51.32 
 
 		 512 aa  498  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  54.05 
 
 		 506 aa  498  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1417  ABC transporter related  52.32 
 
 		 515 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441776  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4228  ABC transporter related protein  53.46 
 
 		 506 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0767  putative sugar uptake ABC transporter ATP-binding protein  52.31 
 
 		 501 aa  488  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162932 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4767  ABC transporter-related protein  53.75 
 
 		 503 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.883977 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  48.5 
 
 		 544 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  48.3 
 
 		 544 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  46.46 
 
 		 523 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  48.69 
 
 		 526 aa  441  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.552248  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  48.61 
 
 		 519 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  48.01 
 
 		 497 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  45.57 
 
 		 585 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0277  ABC transporter related  45.49 
 
 		 511 aa  419  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.277921  normal  0.268674 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  46 
 
 		 499 aa  413  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  43.57 
 
 		 524 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.15 
 
 		 527 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.51 
 
 		 497 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  42.83 
 
 		 524 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  42.95 
 
 		 524 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  42.95 
 
 		 524 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  43.03 
 
 		 524 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  42.95 
 
 		 524 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  43.18 
 
 		 512 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.56 
 
 		 501 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  41.13 
 
 		 504 aa  397  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  44.58 
 
 		 507 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  41.75 
 
 		 494 aa  395  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.57 
 
 		 512 aa  395  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  43.75 
 
 		 508 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  43.78 
 
 		 512 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  44.91 
 
 		 514 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  43.42 
 
 		 513 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  43.65 
 
 		 523 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  43.78 
 
 		 512 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  44.91 
 
 		 514 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  43.92 
 
 		 514 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  41.72 
 
 		 513 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  46.61 
 
 		 509 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  46.61 
 
 		 504 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  42.68 
 
 		 515 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  42.77 
 
 		 513 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  42.65 
 
 		 511 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  45.03 
 
 		 519 aa  392  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  42.97 
 
 		 520 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  42.09 
 
 		 497 aa  391  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  44.91 
 
 		 514 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2808  ABC transporter ATP-binding protein  41.28 
 
 		 510 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  42.89 
 
 		 516 aa  392  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  41.79 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  41.72 
 
 		 513 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  43.61 
 
 		 519 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  43.8 
 
 		 515 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  42.39 
 
 		 503 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  43.24 
 
 		 513 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  43.67 
 
 		 504 aa  388  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>