More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4228 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02439  fused predicted sugar transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  66.46 
 
 		 503 aa  657    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.978258  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1121  ABC transporter related protein  66.67 
 
 		 503 aa  659    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4228  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 512 aa  1034    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2832  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  66.87 
 
 		 503 aa  660    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02403  hypothetical protein  66.46 
 
 		 503 aa  657    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.615581  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3780  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  66.67 
 
 		 503 aa  659    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1130  ABC transporter related  66.87 
 
 		 503 aa  661    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2699  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  66.87 
 
 		 503 aa  660    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2700  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  66.87 
 
 		 503 aa  662    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6251  ABC transporter related  57.37 
 
 		 508 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1374  ABC transporter related protein  51.83 
 
 		 505 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  38.61 
 
 		 494 aa  363  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  41.88 
 
 		 514 aa  358  9.999999999999999e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  40.55 
 
 		 513 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  37.07 
 
 		 499 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7365  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  40.96 
 
 		 506 aa  354  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.568459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  37.92 
 
 		 501 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  38.9 
 
 		 501 aa  353  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  37.58 
 
 		 505 aa  350  4e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  41.83 
 
 		 499 aa  350  4e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  38.41 
 
 		 497 aa  349  6e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  37.37 
 
 		 507 aa  346  5e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3764  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 501 aa  346  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.639409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  39.67 
 
 		 512 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  39.67 
 
 		 512 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  39.17 
 
 		 503 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  38.15 
 
 		 503 aa  342  7e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3476  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.83 
 
 		 501 aa  342  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  39.62 
 
 		 495 aa  342  9e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.8 
 
 		 508 aa  342  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  39.55 
 
 		 514 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2326  ABC transporter related protein  37.86 
 
 		 501 aa  341  2e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  39.83 
 
 		 504 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 		 515 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3018  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.1 
 
 		 506 aa  339  7e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2565  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.1 
 
 		 506 aa  339  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2466  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.1 
 
 		 506 aa  339  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  39.66 
 
 		 513 aa  339  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2447  ABC transporter related protein  37.95 
 
 		 495 aa  339  8e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000548266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 		 515 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1920  ABC transporter related  39.3 
 
 		 526 aa  338  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.528555  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  38.68 
 
 		 506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.68 
 
 		 506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.68 
 
 		 506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  38.68 
 
 		 506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1509  ABC transporter related protein  38.68 
 
 		 506 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.68 
 
 		 506 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2996  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 511 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2283  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.68 
 
 		 506 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1499  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.68 
 
 		 506 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  38.45 
 
 		 524 aa  337  3.9999999999999995e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2749  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.68 
 
 		 506 aa  337  3.9999999999999995e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  36.86 
 
 		 525 aa  336  5e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  39.45 
 
 		 513 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  38.41 
 
 		 503 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2586  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.68 
 
 		 511 aa  335  9e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1020  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.6 
 
 		 497 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.537406  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  39.67 
 
 		 528 aa  335  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  38 
 
 		 499 aa  334  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  39.33 
 
 		 508 aa  335  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.34 
 
 		 512 aa  334  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  40 
 
 		 509 aa  334  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  38.05 
 
 		 503 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  39.71 
 
 		 511 aa  333  4e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  36.14 
 
 		 501 aa  333  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2428  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.25 
 
 		 506 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  37.42 
 
 		 509 aa  332  8e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2335  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.25 
 
 		 506 aa  332  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.728797  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2424  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.25 
 
 		 506 aa  332  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  38 
 
 		 517 aa  331  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2379  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.25 
 
 		 506 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  39.96 
 
 		 544 aa  331  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1060  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.76 
 
 		 506 aa  331  2e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  39.63 
 
 		 514 aa  331  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  38.3 
 
 		 497 aa  331  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  36.65 
 
 		 507 aa  330  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1564  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.54 
 
 		 502 aa  330  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  37.21 
 
 		 520 aa  330  5.0000000000000004e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  36.04 
 
 		 505 aa  329  9e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3524  ABC transporter related  38.91 
 
 		 514 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.503605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  41.01 
 
 		 519 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  38.43 
 
 		 510 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  39.83 
 
 		 502 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2996  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.54 
 
 		 506 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  36.34 
 
 		 500 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2599  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.46 
 
 		 509 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  35.46 
 
 		 504 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  37.5 
 
 		 507 aa  327  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  40.13 
 
 		 524 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  36.13 
 
 		 498 aa  327  3e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3776  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.79 
 
 		 514 aa  327  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.947339  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0318  ABC transporter related protein  37.08 
 
 		 498 aa  326  5e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  36.47 
 
 		 510 aa  326  6e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  36.97 
 
 		 495 aa  326  7e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  37.87 
 
 		 504 aa  326  7e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  36.61 
 
 		 500 aa  326  7e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  39.7 
 
 		 524 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  37.7 
 
 		 512 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2757  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.92 
 
 		 511 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.68449  normal  0.593741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  40.73 
 
 		 518 aa  325  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>