More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1662 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1933  ABC transporter related protein  95.83 
 
 		 503 aa  993    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0512785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2315  ABC transporter related  79.13 
 
 		 503 aa  815    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0829639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1662  ABC transporter related  100 
 
 		 503 aa  1026    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0101569  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2520  ABC transporter related  74.95 
 
 		 518 aa  795    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.265677  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2423  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  75.69 
 
 		 513 aa  797    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1135  ABC transporter related  70.42 
 
 		 500 aa  716    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2415  ABC transporter related  78.53 
 
 		 503 aa  820    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.543063  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3218  ABC transporter-related protein  74.55 
 
 		 503 aa  779    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0134521 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0637  ABC transporter related  47.38 
 
 		 498 aa  491  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.011918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0844  ABC transporter related  43.37 
 
 		 515 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  37.98 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  39.51 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 506 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  38.66 
 
 		 496 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1739  ABC transporter related protein  43.52 
 
 		 516 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  41.05 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.76 
 
 		 499 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  39.76 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  39.24 
 
 		 515 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 		 507 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  39.43 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  39.08 
 
 		 517 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  39.15 
 
 		 507 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  39.51 
 
 		 506 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  39.39 
 
 		 497 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  40.16 
 
 		 514 aa  372  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  38.68 
 
 		 514 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  38.68 
 
 		 514 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  40.12 
 
 		 516 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  38.91 
 
 		 514 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  38.95 
 
 		 507 aa  375  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  38.99 
 
 		 520 aa  369  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  39.33 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39 
 
 		 503 aa  368  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  38.92 
 
 		 517 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  35.43 
 
 		 504 aa  369  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.52 
 
 		 517 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  39.39 
 
 		 504 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  38.23 
 
 		 524 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  39.15 
 
 		 503 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  36.38 
 
 		 505 aa  364  3e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  38.89 
 
 		 513 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  37.6 
 
 		 495 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  38.83 
 
 		 503 aa  362  8e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  37.78 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  39.11 
 
 		 512 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  39.88 
 
 		 515 aa  360  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  38.71 
 
 		 513 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0711  ABC transporter related  39.35 
 
 		 495 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  39.11 
 
 		 497 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  37.87 
 
 		 505 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  38.32 
 
 		 512 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  38.06 
 
 		 506 aa  358  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  38.32 
 
 		 512 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  37.78 
 
 		 512 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  36.03 
 
 		 499 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  40.08 
 
 		 509 aa  358  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  38.51 
 
 		 514 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  38.21 
 
 		 509 aa  357  2.9999999999999997e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.71 
 
 		 512 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0318  ABC transporter related protein  36.66 
 
 		 498 aa  357  3.9999999999999996e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  38 
 
 		 497 aa  356  5.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.82 
 
 		 506 aa  355  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  38.8 
 
 		 500 aa  355  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  38.82 
 
 		 506 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.82 
 
 		 506 aa  354  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  38.82 
 
 		 506 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1509  ABC transporter related protein  38.82 
 
 		 506 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.521077  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2283  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.82 
 
 		 506 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1564  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.22 
 
 		 502 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1499  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.82 
 
 		 506 aa  354  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1060  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.24 
 
 		 506 aa  353  4e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.65 
 
 		 515 aa  353  4e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2379  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.92 
 
 		 506 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2466  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  36.47 
 
 		 506 aa  353  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3174  ABC transporter related  38.28 
 
 		 512 aa  353  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3018  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  36.47 
 
 		 506 aa  353  5e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2565  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  36.47 
 
 		 506 aa  353  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  38.74 
 
 		 525 aa  353  5e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  37.42 
 
 		 494 aa  353  5.9999999999999994e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  38.28 
 
 		 512 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.61 
 
 		 506 aa  352  8e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2335  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.92 
 
 		 506 aa  352  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.728797  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2424  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.92 
 
 		 506 aa  352  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6193  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  36.97 
 
 		 494 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 		 494 aa  352  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 494 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 		 517 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 		 494 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  36.23 
 
 		 501 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  37.8 
 
 		 499 aa  352  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 		 494 aa  352  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  38.65 
 
 		 507 aa  352  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  38.72 
 
 		 517 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  38.72 
 
 		 517 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.65 
 
 		 515 aa  351  2e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2749  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.42 
 
 		 506 aa  351  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  37.8 
 
 		 508 aa  351  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 494 aa  350  3e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>