More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1933 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2423  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  75.1 
 
 		 513 aa  792    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1933  ABC transporter related protein  100 
 
 		 503 aa  1029    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0512785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2315  ABC transporter related  78.93 
 
 		 503 aa  810    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0829639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3218  ABC transporter-related protein  74.35 
 
 		 503 aa  778    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0134521 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1135  ABC transporter related  70.82 
 
 		 500 aa  724    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2520  ABC transporter related  74.36 
 
 		 518 aa  790    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.265677  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2415  ABC transporter related  77.93 
 
 		 503 aa  818    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.543063  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1662  ABC transporter related  95.83 
 
 		 503 aa  993    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0101569  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0637  ABC transporter related  46.56 
 
 		 498 aa  490  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.011918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0844  ABC transporter related  43.15 
 
 		 515 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  37.78 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1739  ABC transporter related protein  43.26 
 
 		 516 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  38.66 
 
 		 496 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  39.51 
 
 		 506 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 506 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  41.45 
 
 		 499 aa  382  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0813  ABC transporter related  39.76 
 
 		 499 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0157  sugar ABC transporter ATP-binding protein  39.76 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000963677 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0813  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  39.35 
 
 		 507 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  39.39 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  38.63 
 
 		 515 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  39.02 
 
 		 494 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  40.96 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.35 
 
 		 507 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  40.16 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  38.48 
 
 		 517 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  39.31 
 
 		 506 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  39.15 
 
 		 507 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  36.03 
 
 		 504 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0711  ABC transporter related  39.76 
 
 		 495 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  38.31 
 
 		 514 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  39.31 
 
 		 512 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39 
 
 		 517 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  38.08 
 
 		 514 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  38.68 
 
 		 513 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  38.08 
 
 		 514 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  39.63 
 
 		 513 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  38.79 
 
 		 520 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  39.52 
 
 		 516 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  38.52 
 
 		 517 aa  365  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  38.79 
 
 		 504 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  38.8 
 
 		 503 aa  364  2e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  38.59 
 
 		 513 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  39.27 
 
 		 497 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  36.22 
 
 		 505 aa  363  4e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  38.18 
 
 		 512 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  38.54 
 
 		 503 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  38.23 
 
 		 503 aa  362  8e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  38.2 
 
 		 512 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  38.2 
 
 		 512 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  37.58 
 
 		 500 aa  361  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  38.38 
 
 		 514 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  37.2 
 
 		 495 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  38.23 
 
 		 524 aa  358  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  38.01 
 
 		 509 aa  358  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  38.97 
 
 		 506 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  38.2 
 
 		 505 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.38 
 
 		 512 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  38.68 
 
 		 515 aa  355  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  36.03 
 
 		 513 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0318  ABC transporter related protein  36.46 
 
 		 498 aa  354  2e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.15 
 
 		 515 aa  354  2e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  35.43 
 
 		 499 aa  354  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  38.49 
 
 		 495 aa  354  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  38.85 
 
 		 507 aa  353  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  37.98 
 
 		 508 aa  353  5e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1655  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 		 517 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0286  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  38.6 
 
 		 517 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0197  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  38.6 
 
 		 517 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  37.04 
 
 		 496 aa  352  8e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  37.65 
 
 		 499 aa  352  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.35 
 
 		 515 aa  352  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  38 
 
 		 501 aa  352  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  37.9 
 
 		 501 aa  351  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 494 aa  351  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  38.34 
 
 		 519 aa  351  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  36.77 
 
 		 494 aa  350  3e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 494 aa  350  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  36.55 
 
 		 497 aa  350  3e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  37.01 
 
 		 494 aa  350  3e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 494 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3048  ABC transporter related protein  35.93 
 
 		 513 aa  350  4e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182553  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  37.92 
 
 		 500 aa  350  4e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  36.45 
 
 		 513 aa  350  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 494 aa  350  5e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  35.83 
 
 		 492 aa  349  7e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  36.77 
 
 		 496 aa  348  9e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 		 494 aa  349  9e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  34.54 
 
 		 498 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 494 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.19 
 
 		 506 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1465  ABC transporter related  38.54 
 
 		 517 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.748698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  35.94 
 
 		 501 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  38.4 
 
 		 525 aa  348  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  37.07 
 
 		 495 aa  348  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1986  ABC transporter related  37.55 
 
 		 511 aa  347  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4109  ABC transporter related  36.98 
 
 		 512 aa  347  2e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000359898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1425  ABC transporter related  38.34 
 
 		 517 aa  347  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.97 
 
 		 506 aa  347  4e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>