More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1135 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2423  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  68.32 
 
 
513 aa  697    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2520  ABC transporter related  67.65 
 
 
518 aa  695    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.265677  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2415  ABC transporter related  71.23 
 
 
503 aa  734    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.543063  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1662  ABC transporter related  70.42 
 
 
503 aa  716    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0101569  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2315  ABC transporter related  70.42 
 
 
503 aa  716    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0829639  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1135  ABC transporter related  100 
 
 
500 aa  1014    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1933  ABC transporter related protein  70.82 
 
 
503 aa  724    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0512785  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3218  ABC transporter-related protein  70.42 
 
 
503 aa  710    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0134521 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0637  ABC transporter related  46.56 
 
 
498 aa  473  1e-132  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.011918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0844  ABC transporter related  40.32 
 
 
515 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1739  ABC transporter related protein  42.91 
 
 
516 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  37.98 
 
 
501 aa  368  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  36.69 
 
 
504 aa  363  6e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  37.6 
 
 
496 aa  360  3e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  39.36 
 
 
497 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  37.68 
 
 
515 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  38.88 
 
 
504 aa  349  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0372  ABC transporter related  40.56 
 
 
509 aa  348  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  37.47 
 
 
520 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1859  ABC transporter related  36.66 
 
 
499 aa  346  6e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  37.32 
 
 
517 aa  346  6e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  37.18 
 
 
510 aa  344  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  38.71 
 
 
519 aa  343  4e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  36.92 
 
 
506 aa  342  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1865  ABC transporter related  38.98 
 
 
508 aa  342  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251568  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  37.15 
 
 
499 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  38.83 
 
 
501 aa  340  2.9999999999999998e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  37.15 
 
 
499 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  38.08 
 
 
513 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  37.88 
 
 
513 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  39.08 
 
 
500 aa  340  4e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  37.15 
 
 
512 aa  339  5e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.63 
 
 
512 aa  340  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  37.98 
 
 
503 aa  339  8e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  38.88 
 
 
501 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  37.4 
 
 
514 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  37.4 
 
 
514 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  37.55 
 
 
503 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  36.67 
 
 
503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  39.39 
 
 
501 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  38.4 
 
 
514 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  39.03 
 
 
499 aa  336  5e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  35.43 
 
 
492 aa  336  5e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  39.51 
 
 
508 aa  336  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  37.9 
 
 
494 aa  336  7e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  37.42 
 
 
512 aa  335  9e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  38.2 
 
 
512 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  38.2 
 
 
512 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  37.65 
 
 
509 aa  335  9e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  37.2 
 
 
514 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  36.57 
 
 
500 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  38.35 
 
 
505 aa  335  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  36.29 
 
 
517 aa  334  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  37.42 
 
 
508 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  36.84 
 
 
506 aa  334  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  36.45 
 
 
505 aa  333  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  37.65 
 
 
516 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  38.85 
 
 
506 aa  334  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  37.52 
 
 
505 aa  334  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  38.01 
 
 
494 aa  333  4e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  37.2 
 
 
513 aa  333  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  38.05 
 
 
507 aa  333  5e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  38.57 
 
 
514 aa  332  7.000000000000001e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  38.45 
 
 
506 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  36.36 
 
 
507 aa  332  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  35.54 
 
 
499 aa  331  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  38.37 
 
 
500 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  35.98 
 
 
513 aa  331  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  37 
 
 
497 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  38.49 
 
 
495 aa  330  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1549  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  36.47 
 
 
515 aa  331  2e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178403  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  38.79 
 
 
505 aa  330  3e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
507 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  37.12 
 
 
500 aa  330  3e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  36.16 
 
 
507 aa  330  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  36.99 
 
 
495 aa  330  4e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1016  ABC transporter ATP-binding protein  41.24 
 
 
523 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.339278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  38.15 
 
 
519 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  38.28 
 
 
515 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.15 
 
 
496 aa  329  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  37.15 
 
 
496 aa  329  6e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0906  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.02 
 
 
517 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0350072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1046  ABC transporter related  38.45 
 
 
521 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  35.14 
 
 
501 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  37.15 
 
 
496 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  36.64 
 
 
499 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  39.12 
 
 
502 aa  328  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  36.2 
 
 
524 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6621  ABC transporter related protein  37.6 
 
 
525 aa  327  2.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823555 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  38.71 
 
 
519 aa  327  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.19 
 
 
517 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1342  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 
515 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.172168  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  36.65 
 
 
508 aa  326  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7365  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  36.14 
 
 
506 aa  326  6e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.568459  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  34.01 
 
 
492 aa  326  7e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  36.49 
 
 
497 aa  325  9e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  37.47 
 
 
506 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  36.38 
 
 
494 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0908  methylthioribose transport ATP-binding protein  39.71 
 
 
494 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0800  ABC transporter related  37.39 
 
 
509 aa  325  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>