More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1042 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1042  ABC transporter related protein  100 
 
 		 499 aa  918    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.147331 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2650  ABC transporter related  48.11 
 
 		 494 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.137858  normal  0.359637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16200  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  39.45 
 
 		 532 aa  255  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.758879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5637  ABC transporter related  37.92 
 
 		 550 aa  236  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  33.76 
 
 		 545 aa  233  7.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2076  ABC transporter related  45.42 
 
 		 514 aa  231  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.586266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3071  ABC transporter related  32.72 
 
 		 613 aa  230  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580888 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2942  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  36.75 
 
 		 582 aa  229  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0252  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.12 
 
 		 613 aa  229  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2190  ABC transporter-related protein  38.05 
 
 		 546 aa  228  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0154  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  35.06 
 
 		 613 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  35.89 
 
 		 530 aa  224  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  34.75 
 
 		 543 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6588  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.03 
 
 		 611 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.414615 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6441  ABC transporter related  35.73 
 
 		 624 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6274  ABC transporter related  35.52 
 
 		 624 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.370601  normal  0.0524349 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2784  ABC transporter related  34.59 
 
 		 535 aa  219  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.026139  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6874  ABC transporter related  32.08 
 
 		 555 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6676  ABC transporter related  35.52 
 
 		 624 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0789  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  33.46 
 
 		 665 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0061  ABC transporter related  34.01 
 
 		 608 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6357  ABC transporter related  34.93 
 
 		 624 aa  217  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  34.67 
 
 		 540 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  34.54 
 
 		 543 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3819  ABC transporter related  33.79 
 
 		 551 aa  215  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0515832  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5904  ABC transporter related  31.88 
 
 		 555 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969657  normal  0.702258 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1498  ABC peptide transporter, ATPase subunit  35.06 
 
 		 614 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0723717  hitchhiker  0.00895491 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6060  ABC transporter related  34.93 
 
 		 621 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6087  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.06 
 
 		 614 aa  213  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725857 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  34.91 
 
 		 540 aa  213  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  35.48 
 
 		 552 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  35.5 
 
 		 552 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3743  ABC transporter related  33.4 
 
 		 531 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5076  ABC transporter related  33.2 
 
 		 538 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.058273  normal  0.492539 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5661  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  32.35 
 
 		 553 aa  209  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.755522  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  34.52 
 
 		 540 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  34.16 
 
 		 571 aa  208  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6327  ABC transporter related  32.99 
 
 		 551 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1496  ABC transporter related  33.67 
 
 		 532 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5301  ABC transporter related  33.88 
 
 		 551 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347719 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  31.38 
 
 		 543 aa  205  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  32.99 
 
 		 557 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5003  ABC transporter related  34.02 
 
 		 551 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.185107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0950  ABC transporter related  33.27 
 
 		 565 aa  205  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  35.31 
 
 		 550 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3166  ABC transporter related protein  40.83 
 
 		 516 aa  204  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  36.12 
 
 		 557 aa  204  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1559  ATPase  32.59 
 
 		 534 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  35.96 
 
 		 552 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1838  ABC transporter related  32.99 
 
 		 556 aa  203  7e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0423  ABC transporter related  34.58 
 
 		 554 aa  202  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4958  ABC transporter related  32.93 
 
 		 553 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.129875 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2421  ABC transporter for oligopeptide ATP binding protein  30.32 
 
 		 577 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000293811 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  32.52 
 
 		 541 aa  201  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  34.89 
 
 		 552 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  31.81 
 
 		 564 aa  201  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4725  ABC transporter related  33.91 
 
 		 588 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.90531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3776  ABC transporter-related protein  34.73 
 
 		 535 aa  200  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529237  normal  0.544592 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5591  ABC transporter related  32.39 
 
 		 551 aa  199  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.395056 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  33.13 
 
 		 553 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 539 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02681  ABC transporter ATP-binding protein  31.41 
 
 		 534 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  32.66 
 
 		 540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  34.16 
 
 		 541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0190  ABC transporter related  30.1 
 
 		 530 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5948  ABC transporter related  32.67 
 
 		 563 aa  198  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.934886  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  30.54 
 
 		 543 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1444  ABC transporter related  33.66 
 
 		 555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.132214 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0196  ABC transporter related  30.1 
 
 		 530 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2917  ABC transporter related  34.64 
 
 		 557 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1540  ABC transporter related  34.03 
 
 		 603 aa  197  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.798313 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1540  ABC transporter related  32.81 
 
 		 533 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  31.2 
 
 		 543 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3117  ABC transporter-like  32.59 
 
 		 527 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  28.18 
 
 		 522 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0842  ABC transporter related  36.49 
 
 		 593 aa  196  6e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0423448 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  31.62 
 
 		 556 aa  196  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  33.27 
 
 		 531 aa  196  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  32.73 
 
 		 552 aa  196  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0439  ABC transporter, ATP-binding protein  30.06 
 
 		 553 aa  195  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4251  ABC transporter related  34.73 
 
 		 558 aa  195  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  31.47 
 
 		 565 aa  195  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  37.37 
 
 		 543 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  37.37 
 
 		 543 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  37.37 
 
 		 543 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3076  ABC transporter-like  31.63 
 
 		 524 aa  194  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  32.72 
 
 		 550 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02101  ABC transporter, ATP binding component  31.72 
 
 		 536 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.39 
 
 		 548 aa  193  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2758  AAA ATPase  34.56 
 
 		 532 aa  193  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0451  ATPase  33.06 
 
 		 552 aa  193  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.508164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3716  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.3 
 
 		 524 aa  193  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  33.47 
 
 		 547 aa  192  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0777  ABC transporter related  33 
 
 		 527 aa  192  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.501487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1076  ABC transporter related  32.66 
 
 		 546 aa  192  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123056 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1195  Sulfate-transporting ATPase  32.52 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1925  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.06 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1182  ABC transporter related  33.54 
 
 		 569 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2435  ABC transporter related  33.33 
 
 		 530 aa  192  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  30.47 
 
 		 555 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>