More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0439 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0439  ABC transporter related  100 
 
 		 237 aa  481  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0164474  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  55.22 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18240  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  45.41 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  37.55 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  40.27 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  37.92 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 250 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  39.91 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  38.39 
 
 		 294 aa  154  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  37.8 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  39.25 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  38.43 
 
 		 273 aa  148  6e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  34.55 
 
 		 288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  38.07 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  37.66 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  37.61 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  36.36 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  36.29 
 
 		 250 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  35.68 
 
 		 240 aa  142  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  36.56 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  34.67 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  36.23 
 
 		 254 aa  141  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  37.72 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  37.68 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.78 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  41.5 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  37.67 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0130  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 253 aa  138  7e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  35.83 
 
 		 249 aa  138  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.32 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  35.32 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  35.32 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  39.78 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  33.96 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1536  ABC transporter related  35.47 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.591155 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  34.48 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  34.7 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3806  ABC transporter related protein  35 
 
 		 221 aa  135  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000628307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  32.91 
 
 		 259 aa  135  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  35.16 
 
 		 256 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  33.05 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  39.21 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  39.21 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  33.78 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  33.91 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1675  ATPase  37.21 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000905168  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  33.78 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2338  ABC transporter, ATPase subunit  34.05 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  35.9 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  38.14 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  35.85 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  34.58 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  37.02 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 		 249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1626  ABC transporter related  35.27 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  33.95 
 
 		 287 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0155  cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  35.71 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1531  ABC transporter-related protein  35.27 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.821466  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  35.51 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  38.95 
 
 		 252 aa  132  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  32.63 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  36.95 
 
 		 239 aa  131  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0137  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.21 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  35.43 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3679  ABC transporter related protein  34.08 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  32.61 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  35.89 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  31.49 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  32.61 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0178  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  31.76 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  31.42 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  36.65 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  36.04 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2418  zinc ABC transporter ATP-binding protein  34.11 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  34.2 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  32.22 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  35.78 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  32.5 
 
 		 248 aa  129  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  35.98 
 
 		 271 aa  128  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3530  ABC transporter related  33.94 
 
 		 236 aa  128  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  34.78 
 
 		 265 aa  128  9.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1791  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.71 
 
 		 260 aa  128  9.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  37.5 
 
 		 625 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1546  ABC transporter related  33.8 
 
 		 248 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  38.54 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0995  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  36.53 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  37.11 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  34.5 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0155  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 		 236 aa  126  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0247418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>