More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4138 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  505  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  67.4 
 
 		 244 aa  293  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  66.96 
 
 		 243 aa  292  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  66.96 
 
 		 243 aa  292  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  60.79 
 
 		 249 aa  276  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  58.59 
 
 		 243 aa  264  8e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1702  zinc import ATP-binding protein  60.35 
 
 		 247 aa  262  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00101285  normal  0.0355653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  51.68 
 
 		 252 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  56.09 
 
 		 256 aa  241  9e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  54.09 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  51.68 
 
 		 253 aa  236  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  51.68 
 
 		 253 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  51.68 
 
 		 253 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  50 
 
 		 252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  50 
 
 		 252 aa  231  7.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4177  ABC transporter related  50.92 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.788551  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  51.26 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  48.74 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2717  ABC transporter related  48.51 
 
 		 304 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2383  ABC transporter related  48.09 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1696  ABC transporter related  48.73 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  50.42 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  50.42 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  50.42 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  50.42 
 
 		 251 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  50.42 
 
 		 251 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  50.42 
 
 		 251 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  50.42 
 
 		 251 aa  226  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  50.42 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  50 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  48.32 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  50.42 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  50.42 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  50.42 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  50.42 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1028  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 		 298 aa  222  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1123  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  52.86 
 
 		 260 aa  218  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  49.38 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  51.43 
 
 		 264 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  41.57 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  48.85 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  50.8 
 
 		 269 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  48.12 
 
 		 269 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1668  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  48.82 
 
 		 262 aa  208  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  50.39 
 
 		 257 aa  207  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  46.35 
 
 		 261 aa  207  9e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  50.39 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2185  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (zinc)  45.59 
 
 		 316 aa  206  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.287969  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  50 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  45.85 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1196  ABC transporter related  50.64 
 
 		 259 aa  205  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.769825  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  50 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  49.61 
 
 		 257 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4005  ABC transporter related  51.46 
 
 		 283 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.694858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  50 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  48.7 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004107  zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC  45.71 
 
 		 262 aa  195  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01360  hypothetical protein  45.24 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3776  ABC transporter related  46.7 
 
 		 257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1037  high-affinity zinc uptake system, ATP-binding protein  42.73 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  43.27 
 
 		 260 aa  182  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0183  ABC transporter related  42.6 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00385632  hitchhiker  0.00108332 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2034  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  45.15 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  42.48 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  38.26 
 
 		 240 aa  162  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  38.26 
 
 		 240 aa  162  6e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  37.38 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 242 aa  156  4e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0938  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.11 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  37.5 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0859  ABC transporter related  34.6 
 
 		 251 aa  142  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0141336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4438  ABC transporter-like  34.23 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3928  ABC transporter-like  40.52 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4569  ABC transporter-like protein protein  36.26 
 
 		 267 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198016  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  32.13 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  38.57 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  31.15 
 
 		 240 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  35.91 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  30.9 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  31.38 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  41.28 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3802  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.71 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299186  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1967  ABC transporter related  42.71 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842507  normal  0.0685395 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  34.26 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2389  ABC transporter component  41.77 
 
 		 243 aa  131  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1192  ABC transporter related  37.4 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000837637  hitchhiker  0.00000450172 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  37.44 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2114  ABC transporter related  42.71 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.745156  normal  0.0880231 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  39.34 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  38.22 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2569  ABC transporter related  35 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.630319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  37 
 
 		 244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  31.43 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  36.44 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  37.13 
 
 		 250 aa  128  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1950  ABC transporter  42.38 
 
 		 254 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>