More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1675 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1675  ATPase  100 
 
 
233 aa  477  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000905168  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  62.86 
 
 
222 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  55.36 
 
 
254 aa  260  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  53.65 
 
 
251 aa  250  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  54.75 
 
 
251 aa  246  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  55.19 
 
 
243 aa  240  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  56.34 
 
 
252 aa  239  2e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  50.72 
 
 
254 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  49.76 
 
 
254 aa  204  9e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  50.24 
 
 
254 aa  202  2e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  47.62 
 
 
257 aa  198  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  48.57 
 
 
262 aa  195  6e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  44.44 
 
 
258 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  44.44 
 
 
258 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2422  ABC transporter, ATPase subunit  45.12 
 
 
243 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  47.6 
 
 
257 aa  188  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  43 
 
 
249 aa  187  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  45.45 
 
 
250 aa  184  7e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  42.11 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0995  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  47.42 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.597516  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  41.59 
 
 
287 aa  178  5.999999999999999e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  42.99 
 
 
258 aa  178  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0026  ABC transporter related  47.98 
 
 
273 aa  177  9e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  40.87 
 
 
255 aa  175  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0130  ABC transporter related protein  38.57 
 
 
253 aa  170  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  42.17 
 
 
250 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  39.44 
 
 
255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  41.51 
 
 
281 aa  164  9e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1729  ABC transporter ATP-binding protein  44 
 
 
251 aa  164  9e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  41.98 
 
 
256 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 
256 aa  162  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.98 
 
 
256 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  41.98 
 
 
256 aa  162  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.51 
 
 
256 aa  161  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.51 
 
 
256 aa  161  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.51 
 
 
256 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  42.11 
 
 
250 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 
256 aa  158  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 
256 aa  158  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  39.72 
 
 
240 aa  158  9e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  41.51 
 
 
256 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  39.15 
 
 
294 aa  157  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  39.3 
 
 
273 aa  157  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1726  ABC transporter related  45.02 
 
 
268 aa  157  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  38.6 
 
 
250 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  38.57 
 
 
249 aa  156  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 
260 aa  156  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  43.18 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  38.94 
 
 
250 aa  155  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  38.21 
 
 
254 aa  154  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1791  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.23 
 
 
260 aa  154  8e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  43.01 
 
 
256 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  39.15 
 
 
249 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  37.68 
 
 
230 aa  153  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  40.55 
 
 
257 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  39.52 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  39.53 
 
 
250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  36.16 
 
 
262 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  40.45 
 
 
258 aa  152  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  40 
 
 
250 aa  152  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3806  ABC transporter related protein  36.5 
 
 
221 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000628307  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1192  ABC transporter related  45.02 
 
 
259 aa  151  8.999999999999999e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000837637  hitchhiker  0.00000450172 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  36 
 
 
256 aa  150  1e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  34.93 
 
 
263 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  36.61 
 
 
278 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  35.04 
 
 
254 aa  149  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  38.71 
 
 
252 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  39.34 
 
 
259 aa  149  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  37.74 
 
 
240 aa  149  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  37.74 
 
 
240 aa  149  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  40.76 
 
 
250 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  40.93 
 
 
246 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  36.7 
 
 
264 aa  148  6e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  38.16 
 
 
249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  39.52 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0439  ABC transporter related  37.21 
 
 
237 aa  145  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0164474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  37.04 
 
 
255 aa  145  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  38.16 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  36.45 
 
 
247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  37.04 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  36.94 
 
 
251 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  37.33 
 
 
251 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  35.19 
 
 
249 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  33.18 
 
 
252 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  35.68 
 
 
288 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  39.17 
 
 
250 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  38.78 
 
 
255 aa  143  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  36.67 
 
 
249 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  37.68 
 
 
271 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0118  ABC transporter related  42.86 
 
 
308 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.4303 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  37.55 
 
 
260 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  41.63 
 
 
247 aa  143  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  37.99 
 
 
262 aa  143  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  36.82 
 
 
265 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  36.06 
 
 
249 aa  142  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  33.64 
 
 
249 aa  142  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  36.32 
 
 
257 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
247 aa  141  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1536  ABC transporter related  43.28 
 
 
257 aa  141  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.591155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>