More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35290 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35290  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  100 
 
 		 271 aa  535  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393367  normal  0.462856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0353  ABC transporter related  72.49 
 
 		 280 aa  371  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2375  ABC transporter related  60.15 
 
 		 271 aa  304  8.000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000193813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0985  ABC transporter related protein  64.8 
 
 		 263 aa  303  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2640  ABC transporter related  60.38 
 
 		 278 aa  302  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0238  ABC transporter related  62.65 
 
 		 268 aa  301  7.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.904203  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0610  ABC transporter related protein  62.9 
 
 		 248 aa  293  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.594594  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4922  ABC transporter related  57.03 
 
 		 303 aa  271  6e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3196  ABC transporter related  51.91 
 
 		 350 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  47.04 
 
 		 271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1168  ABC transporter related  42.75 
 
 		 265 aa  208  6e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2087  ABC transporter related  47.91 
 
 		 282 aa  205  7e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  45.97 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2625  ABC transporter related  46.83 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0716  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, ATPase subunit  47.15 
 
 		 315 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.905635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1991  ABC transporter related  46.83 
 
 		 296 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2601  ABC transporter related  46.83 
 
 		 296 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908339  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5932  ABC heavy metal transporter, ATPase subunit  44.83 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0486  ABC transporter related  46.75 
 
 		 309 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0680006  hitchhiker  0.00154743 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0073  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0327  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.37 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0625  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2459  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 286 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0696  ABC transporter related  43.23 
 
 		 295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.638855 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3250  ABC transporter related  46.34 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.811224  normal  0.498578 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0689  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.77 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2517  ABC transporter related  46.56 
 
 		 296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.328547 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2649  ABC transporter related  46.56 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0869  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 286 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0865  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 286 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1028  ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 		 290 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0822349  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5103  ABC transporter related  45.19 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4718  ABC transporter related  45.19 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4804  ABC transporter related  45.19 
 
 		 257 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5319  ABC transporter-related protein  43.7 
 
 		 262 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256722 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2478  ABC transporter related  50.83 
 
 		 302 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1455  ABC transporter related  42.44 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0293  ABC transporter related  42.17 
 
 		 273 aa  182  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1957  ABC transporter related  47.67 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0603  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.09 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0755  ABC transporter related  43.09 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.20195 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0748  Mn2+/Zn2+ ABC transporter ATPase  37.24 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.966679  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  42.79 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1936  ABC transporter related  39.11 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.681734  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  37.05 
 
 		 490 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2342  ABC transporter related protein  36.43 
 
 		 259 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2048  ABC transporter related protein  40.74 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.833471 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  41.35 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  36.89 
 
 		 244 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  39.42 
 
 		 222 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0125  ABC transporter related protein  30.83 
 
 		 250 aa  135  8e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  35 
 
 		 265 aa  135  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  37.24 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  31.91 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  30.2 
 
 		 418 aa  133  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  38.43 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  36.97 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  32.42 
 
 		 258 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  32.42 
 
 		 258 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  32.2 
 
 		 255 aa  131  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0858  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  39.35 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  31.62 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1610  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  34.53 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  35.04 
 
 		 251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  31.97 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  28.57 
 
 		 259 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  37.38 
 
 		 258 aa  128  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  32.79 
 
 		 269 aa  128  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  34.47 
 
 		 260 aa  128  9.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  34.55 
 
 		 536 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  33.2 
 
 		 490 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  34.82 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  31.67 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  38.33 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  29.23 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  35.19 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0517  manganese transport system ATP-binding protein MntA  25.87 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1389  ABC transporter related  35.8 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0369589  normal  0.478115 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  34.02 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1601  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 261 aa  126  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219906  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  35.86 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  30.68 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  35.43 
 
 		 268 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  33.9 
 
 		 251 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  34.19 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  33.9 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  34.19 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  34.19 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  39.91 
 
 		 253 aa  126  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  33.9 
 
 		 251 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  33.9 
 
 		 251 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2320  ABC transporter related protein  34.13 
 
 		 277 aa  125  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  34.48 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  34.75 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12803  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.97 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19110  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.44 
 
 		 271 aa  125  7e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0967158 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  34.19 
 
 		 249 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  36.32 
 
 		 257 aa  125  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  33.06 
 
 		 268 aa  125  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  34.53 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>