More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0755 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0755  ABC transporter related  100 
 
 
274 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.20195 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0603  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  100 
 
 
274 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0293  ABC transporter related  55.87 
 
 
273 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  55.38 
 
 
271 aa  259  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  47.06 
 
 
273 aa  235  7e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3196  ABC transporter related  44.44 
 
 
350 aa  208  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2640  ABC transporter related  42.74 
 
 
278 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2375  ABC transporter related  43.48 
 
 
271 aa  205  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000193813 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2087  ABC transporter related  46 
 
 
282 aa  203  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1168  ABC transporter related  43.44 
 
 
265 aa  196  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463795  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0238  ABC transporter related  45.78 
 
 
268 aa  195  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.904203  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0073  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 
286 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0327  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.06 
 
 
286 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0625  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 
286 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2459  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 
286 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5319  ABC transporter-related protein  44.12 
 
 
262 aa  188  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.256722 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2625  ABC transporter related  43.48 
 
 
296 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5932  ABC heavy metal transporter, ATPase subunit  43.87 
 
 
296 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1991  ABC transporter related  43.48 
 
 
296 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2601  ABC transporter related  43.48 
 
 
296 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908339  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0716  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, ATPase subunit  41.88 
 
 
315 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.905635  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0696  ABC transporter related  43.08 
 
 
295 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.638855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4718  ABC transporter related  44.4 
 
 
257 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4804  ABC transporter related  44.4 
 
 
257 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1455  ABC transporter related  44.07 
 
 
259 aa  186  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5103  ABC transporter related  44.4 
 
 
257 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4922  ABC transporter related  43.5 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0689  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.45 
 
 
302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2649  ABC transporter related  43.08 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3250  ABC transporter related  43.14 
 
 
313 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.811224  normal  0.498578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0353  ABC transporter related  45.41 
 
 
280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1028  ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 
290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0822349  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2517  ABC transporter related  42.69 
 
 
296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.328547 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0869  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 
286 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0865  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 
286 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0610  ABC transporter related protein  42.46 
 
 
248 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.594594  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0486  ABC transporter related  42.4 
 
 
309 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0680006  hitchhiker  0.00154743 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35290  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  42.28 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393367  normal  0.462856 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0985  ABC transporter related protein  40.8 
 
 
263 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0748  Mn2+/Zn2+ ABC transporter ATPase  39.39 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.966679  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  35.56 
 
 
263 aa  156  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2478  ABC transporter related  44.08 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  39.06 
 
 
263 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  40.68 
 
 
250 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1957  ABC transporter related  42.42 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  36.93 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  32.05 
 
 
258 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  35.1 
 
 
258 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2618  ABC transporter related  40.68 
 
 
247 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314848  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  34.16 
 
 
252 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  32.05 
 
 
258 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  34.35 
 
 
256 aa  143  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  33.74 
 
 
252 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  40.42 
 
 
247 aa  142  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1600  ABC transporter-like  35.06 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0157688  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  35.66 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  35.12 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  35.17 
 
 
252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  32.8 
 
 
259 aa  138  7.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  36.32 
 
 
246 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  36.47 
 
 
262 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  37.24 
 
 
258 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  36.59 
 
 
251 aa  138  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0842  ABC transporter-like protein protein  34.04 
 
 
273 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4569  ABC transporter-like protein protein  35.69 
 
 
267 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198016  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  36.18 
 
 
255 aa  137  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  35.9 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  35.06 
 
 
249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  36.51 
 
 
251 aa  136  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  41.06 
 
 
262 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  37.71 
 
 
260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  37.25 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  32 
 
 
254 aa  135  8e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  31.45 
 
 
252 aa  135  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3219  ABC transporter related  31.38 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 
249 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  33.91 
 
 
248 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0858  ABC-type Mn/Zn transport systems ATPase component  36.92 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4438  ABC transporter-like  35.63 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657591  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  31.23 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  34.39 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  31.82 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0055  ABC transporter related  36.21 
 
 
266 aa  133  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00561374  normal  0.0686631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  38.99 
 
 
253 aa  133  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  35.06 
 
 
268 aa  133  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  31.78 
 
 
254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  34.85 
 
 
264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0794  ABC transporter related  38.2 
 
 
248 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  35.25 
 
 
251 aa  132  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  34.36 
 
 
249 aa  132  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  31.6 
 
 
269 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 
254 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  30.04 
 
 
254 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0736  ABC transporter related protein  38.14 
 
 
277 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1116  ABC transporter related  35.2 
 
 
307 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  29.64 
 
 
260 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2852  ABC transporter related  36.32 
 
 
271 aa  132  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0125  ABC transporter related protein  31.45 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  32.78 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>