More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2478 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2478  ABC transporter related  100 
 
 		 302 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3196  ABC transporter related  62.81 
 
 		 350 aa  341  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2087  ABC transporter related  58.89 
 
 		 282 aa  293  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0238  ABC transporter related  51.55 
 
 		 268 aa  234  9e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.904203  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2640  ABC transporter related  46.21 
 
 		 278 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2375  ABC transporter related  47.33 
 
 		 271 aa  228  9e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000193813 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  50 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35290  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  50.41 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393367  normal  0.462856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0353  ABC transporter related  48.46 
 
 		 280 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4922  ABC transporter related  46.92 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0985  ABC transporter related protein  48.08 
 
 		 263 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0610  ABC transporter related protein  48.24 
 
 		 248 aa  201  8e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.594594  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2517  ABC transporter related  44.44 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.328547 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2649  ABC transporter related  44.44 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2625  ABC transporter related  44.36 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0716  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.905635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5319  ABC transporter-related protein  44.88 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256722 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1991  ABC transporter related  44.36 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2601  ABC transporter related  44.36 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908339  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0696  ABC transporter related  43.7 
 
 		 295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.638855 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3250  ABC transporter related  43.49 
 
 		 313 aa  195  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.811224  normal  0.498578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0293  ABC transporter related  42.75 
 
 		 273 aa  195  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5932  ABC heavy metal transporter, ATPase subunit  44.36 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1168  ABC transporter related  39.69 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463795  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0327  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.63 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0073  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2459  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0625  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  44.09 
 
 		 273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1028  ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 		 290 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0822349  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0689  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.63 
 
 		 302 aa  189  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0865  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0869  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  45.63 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0486  ABC transporter related  44.71 
 
 		 309 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0680006  hitchhiker  0.00154743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5103  ABC transporter related  43.31 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4718  ABC transporter related  43.31 
 
 		 257 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4804  ABC transporter related  43.31 
 
 		 257 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1455  ABC transporter related  42.69 
 
 		 259 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0603  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.68 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0755  ABC transporter related  44.68 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.20195 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1957  ABC transporter related  46.69 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  39.27 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  37.1 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  36.52 
 
 		 239 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  32.32 
 
 		 259 aa  145  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0748  Mn2+/Zn2+ ABC transporter ATPase  33.2 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.966679  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  39.75 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  38.91 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  36.1 
 
 		 243 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  37.1 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  36.51 
 
 		 265 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  37.73 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  36.33 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  40.95 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0632  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 		 254 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  40.15 
 
 		 271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  36.6 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  32.58 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  36.14 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  39.92 
 
 		 250 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  37.6 
 
 		 259 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  34.62 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  37.66 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  34.62 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  35.29 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  31.78 
 
 		 255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  32.93 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1546  ABC transporter related  34.58 
 
 		 248 aa  132  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  35.5 
 
 		 246 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0130  ABC transporter related protein  35.82 
 
 		 253 aa  132  6.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1596  ABC transporter-like protein  38.31 
 
 		 256 aa  132  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309069  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_002620  TC0339  ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0116961  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  33.07 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  36.61 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  36.25 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  37.04 
 
 		 251 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  33.49 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  35.09 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_573  cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.41 
 
 		 254 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  39.64 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  35.71 
 
 		 251 aa  130  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  31.82 
 
 		 263 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0097  ABC transporter ATP-binding protein  34.33 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00699805  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  38.84 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  35.9 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  35.59 
 
 		 244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  35.17 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  33.07 
 
 		 262 aa  129  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  37.34 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  35.9 
 
 		 261 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  32.91 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1150  ABC transporter related  39.06 
 
 		 272 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660003  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3013  ABC transporter related  36.6 
 
 		 259 aa  129  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13670  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  37.89 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  34.27 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  40.69 
 
 		 353 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  40.1 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  32.34 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17090  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  38.71 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.469587  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0125  ABC transporter related protein  28.63 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>