More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0486 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0486  ABC transporter related  100 
 
 
309 aa  616  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0680006  hitchhiker  0.00154743 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0716  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, ATPase subunit  81.37 
 
 
315 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.905635  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3250  ABC transporter related  82.27 
 
 
313 aa  454  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.811224  normal  0.498578 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2517  ABC transporter related  82.16 
 
 
296 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.328547 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1991  ABC transporter related  82.16 
 
 
296 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2649  ABC transporter related  82.16 
 
 
296 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2601  ABC transporter related  82.16 
 
 
296 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908339  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2625  ABC transporter related  81.78 
 
 
296 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5932  ABC heavy metal transporter, ATPase subunit  82.51 
 
 
296 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0696  ABC transporter related  83.59 
 
 
295 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.638855 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0327  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  84.65 
 
 
286 aa  407  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0073  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  84.65 
 
 
286 aa  407  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2459  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  84.65 
 
 
286 aa  407  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0625  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  84.65 
 
 
286 aa  407  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0865  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  85.04 
 
 
286 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1028  ABC transporter, ATP-binding protein  85.04 
 
 
290 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0822349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0869  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  85.04 
 
 
286 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0689  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  84.25 
 
 
302 aa  391  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1957  ABC transporter related  56.99 
 
 
281 aa  253  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2375  ABC transporter related  44.12 
 
 
271 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000193813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2640  ABC transporter related  46.3 
 
 
278 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3196  ABC transporter related  45.62 
 
 
350 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0238  ABC transporter related  48.4 
 
 
268 aa  218  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.904203  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0353  ABC transporter related  45.29 
 
 
280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35290  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  45.93 
 
 
271 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393367  normal  0.462856 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  43.02 
 
 
273 aa  202  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5319  ABC transporter-related protein  42.23 
 
 
262 aa  202  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.256722 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  45.34 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0293  ABC transporter related  42.8 
 
 
273 aa  199  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1455  ABC transporter related  42.57 
 
 
259 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2087  ABC transporter related  42.81 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5103  ABC transporter related  44.44 
 
 
257 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4718  ABC transporter related  44.44 
 
 
257 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4804  ABC transporter related  44.44 
 
 
257 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4922  ABC transporter related  41.67 
 
 
303 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0610  ABC transporter related protein  44.49 
 
 
248 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.594594  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0985  ABC transporter related protein  44.66 
 
 
263 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1168  ABC transporter related  38.46 
 
 
265 aa  176  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463795  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0603  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.98 
 
 
274 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0755  ABC transporter related  41.98 
 
 
274 aa  176  6e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.20195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2478  ABC transporter related  42.12 
 
 
302 aa  166  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0748  Mn2+/Zn2+ ABC transporter ATPase  33.73 
 
 
296 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.966679  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  32.6 
 
 
255 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  36.36 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  36.36 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  33.19 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  33.05 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  31.33 
 
 
255 aa  133  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  36.13 
 
 
258 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1122  ABC transporter related  35.34 
 
 
427 aa  132  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.672598  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  36.89 
 
 
490 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  31.97 
 
 
261 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1031  ABC transport system, ATP-binding protein  32.47 
 
 
339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  32.21 
 
 
253 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  39.37 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  32.21 
 
 
253 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  32.21 
 
 
253 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  34.4 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  31.58 
 
 
288 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  31.64 
 
 
286 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  37.96 
 
 
260 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  30.68 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  35.71 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  32.38 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3438  ABC transporter related  39.3 
 
 
253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.824241  normal  0.104948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  37.92 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  36.67 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  28.93 
 
 
259 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  34.51 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000665  spermidine putrescine transport ATP-binding protein PotA  34.08 
 
 
339 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.518175  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.71 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  32.51 
 
 
249 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  33.05 
 
 
243 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  33.76 
 
 
251 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2133  ABC transporter related  33.87 
 
 
256 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  30.08 
 
 
418 aa  125  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1512  ABC transporter-related protein  30.23 
 
 
419 aa  125  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  31.5 
 
 
258 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2029  ABC transporter related  35.42 
 
 
250 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8475  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  35.02 
 
 
257 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  35.18 
 
 
289 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  33.63 
 
 
247 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  33.18 
 
 
239 aa  123  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 
258 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  32.24 
 
 
269 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  30.54 
 
 
263 aa  123  4e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  32.05 
 
 
262 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  29.84 
 
 
258 aa  123  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  36.98 
 
 
222 aa  122  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  27.5 
 
 
258 aa  122  7e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  33.74 
 
 
256 aa  122  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  33.33 
 
 
254 aa  122  8e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  31.05 
 
 
259 aa  122  9e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  31.73 
 
 
271 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  33.75 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1071  ABC transporter related  33.06 
 
 
427 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  30.99 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  32.3 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1890  ABC-type zinc transport system ATP-binding protein  32.86 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  28.99 
 
 
249 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>