More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0238 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0238  ABC transporter related  100 
 
 		 268 aa  526  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.904203  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2375  ABC transporter related  64.15 
 
 		 271 aa  341  8e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000193813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2640  ABC transporter related  60.07 
 
 		 278 aa  321  9.000000000000001e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0353  ABC transporter related  58.87 
 
 		 280 aa  294  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35290  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  62.65 
 
 		 271 aa  287  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393367  normal  0.462856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4922  ABC transporter related  53.76 
 
 		 303 aa  275  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0610  ABC transporter related protein  59.52 
 
 		 248 aa  268  5.9999999999999995e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.594594  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0985  ABC transporter related protein  56.92 
 
 		 263 aa  255  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3196  ABC transporter related  51.49 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  48.51 
 
 		 273 aa  226  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2087  ABC transporter related  47.92 
 
 		 282 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0716  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, ATPase subunit  46.62 
 
 		 315 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.905635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3250  ABC transporter related  46.79 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.811224  normal  0.498578 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1991  ABC transporter related  48.3 
 
 		 296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2601  ABC transporter related  48.3 
 
 		 296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908339  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2625  ABC transporter related  47.92 
 
 		 296 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0696  ABC transporter related  47.15 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.638855 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2649  ABC transporter related  46.77 
 
 		 296 aa  208  8e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5932  ABC heavy metal transporter, ATPase subunit  47.55 
 
 		 296 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  46.34 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2517  ABC transporter related  46.39 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.328547 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0486  ABC transporter related  48.4 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0680006  hitchhiker  0.00154743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2478  ABC transporter related  50.75 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0293  ABC transporter related  42.42 
 
 		 273 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0327  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.64 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0625  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2459  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0073  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0689  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.45 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0865  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0869  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1028  ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 		 290 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0822349  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1957  ABC transporter related  48.66 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1168  ABC transporter related  39.53 
 
 		 265 aa  188  9e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0755  ABC transporter related  44.44 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.20195 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0603  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.44 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4718  ABC transporter related  43.98 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4804  ABC transporter related  43.98 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5103  ABC transporter related  43.57 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5319  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1455  ABC transporter related  39.24 
 
 		 259 aa  161  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  34.96 
 
 		 490 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1054  ABC transporter related  35.77 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  36.33 
 
 		 262 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  33.8 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  34.3 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  30.42 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  35.6 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0748  Mn2+/Zn2+ ABC transporter ATPase  30.96 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.966679  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  34.6 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  29.26 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  35.14 
 
 		 252 aa  133  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  36.48 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  28.5 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  35.74 
 
 		 251 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  35.74 
 
 		 251 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  35.74 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  35.74 
 
 		 251 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  33.64 
 
 		 247 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  35.74 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  30.45 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  32.62 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1610  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  34.74 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  29.46 
 
 		 254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1821  ABC transporter related  36.94 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77339  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3013  ABC transporter related  35.04 
 
 		 259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101596  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1596  ABC transporter-like protein  36.78 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309069  normal  0.368038 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  34.89 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  34.89 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  34.89 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1150  ABC transporter related  35.46 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660003  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  34.89 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  31.85 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  34.89 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  33.63 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  34.89 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  34.89 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  34.89 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3228  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 262 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0605029  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  29.96 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  38.01 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  29.54 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  29.96 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  38.01 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  35.17 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4029  ABC transporter related  32.9 
 
 		 248 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.218483  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  38.01 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  34.21 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  34.21 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  34.21 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  34.35 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  33.47 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  31.92 
 
 		 255 aa  126  5e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2065  ABC transporter related  33.91 
 
 		 258 aa  125  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  28.4 
 
 		 258 aa  125  6e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  26.97 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  31.74 
 
 		 249 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  33.61 
 
 		 243 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  34.47 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  34.04 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>