More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0610 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0610  ABC transporter related protein  100 
 
 		 248 aa  482  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.594594  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0353  ABC transporter related  67.73 
 
 		 280 aa  304  9.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0985  ABC transporter related protein  63.82 
 
 		 263 aa  302  4.0000000000000003e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2375  ABC transporter related  58.57 
 
 		 271 aa  276  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000193813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35290  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  62.9 
 
 		 271 aa  274  8e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393367  normal  0.462856 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2640  ABC transporter related  58.57 
 
 		 278 aa  271  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0238  ABC transporter related  59.52 
 
 		 268 aa  269  4e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.904203  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4922  ABC transporter related  54.4 
 
 		 303 aa  237  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3196  ABC transporter related  50.39 
 
 		 350 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  45.53 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  43.65 
 
 		 273 aa  191  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2087  ABC transporter related  45.31 
 
 		 282 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0486  ABC transporter related  44.49 
 
 		 309 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0680006  hitchhiker  0.00154743 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1168  ABC transporter related  40.32 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0293  ABC transporter related  42.45 
 
 		 273 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0716  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, ATPase subunit  43.7 
 
 		 315 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.905635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2625  ABC transporter related  45.38 
 
 		 296 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5932  ABC heavy metal transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 		 296 aa  178  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3250  ABC transporter related  43.7 
 
 		 313 aa  177  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.811224  normal  0.498578 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1991  ABC transporter related  45.38 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2601  ABC transporter related  45.38 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908339  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0696  ABC transporter related  44.12 
 
 		 295 aa  175  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.638855 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0327  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.86 
 
 		 286 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2517  ABC transporter related  44.54 
 
 		 296 aa  174  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.328547 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0073  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 286 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0625  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 286 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2459  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 286 aa  174  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2649  ABC transporter related  44.54 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0689  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.08 
 
 		 302 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1028  ABC transporter, ATP-binding protein  43.97 
 
 		 290 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0822349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2478  ABC transporter related  47.64 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0865  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0869  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0603  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.46 
 
 		 274 aa  162  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0755  ABC transporter related  42.46 
 
 		 274 aa  162  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.20195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5103  ABC transporter related  40.91 
 
 		 257 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4718  ABC transporter related  40.91 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4804  ABC transporter related  40.91 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1455  ABC transporter related  41.67 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5319  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256722 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  33.88 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1957  ABC transporter related  42.52 
 
 		 281 aa  132  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  31.7 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  32.14 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  32.14 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  27.87 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  28.81 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1610  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  34.68 
 
 		 234 aa  129  6e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  30.95 
 
 		 288 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1374  ABC transporter-related protein  37.13 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  32.34 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  35.39 
 
 		 255 aa  126  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0988  ABC transporter related  26.21 
 
 		 249 aa  125  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  30.54 
 
 		 249 aa  125  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  35.89 
 
 		 262 aa  123  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  35.78 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  28.05 
 
 		 418 aa  122  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  32.38 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  26.97 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  30.92 
 
 		 258 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  28.39 
 
 		 247 aa  121  9e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  30.92 
 
 		 258 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  36.45 
 
 		 251 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  36.45 
 
 		 268 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  36.45 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  36.45 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  36.45 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  32.91 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  38.76 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  33.74 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  33.19 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  38.28 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0206  ABC transporter related  35.44 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  34.69 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  30.67 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  26.53 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2049  putative Fe3+-siderophores transport system ATPase  40.72 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.428685  normal  0.435436 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  28.76 
 
 		 249 aa  119  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  33.2 
 
 		 245 aa  118  7e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  29.75 
 
 		 261 aa  118  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1150  ABC transporter related  34.8 
 
 		 272 aa  118  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.660003  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  34.58 
 
 		 490 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0748  Mn2+/Zn2+ ABC transporter ATPase  31.02 
 
 		 296 aa  117  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.966679  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  37.56 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  32.8 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2307  ABC transporter related protein  35.1 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  31.67 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  34.93 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  33.94 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  33.94 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1176  iron ABC transporter ATP-binding protein  28.79 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  33.94 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  33.94 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  33.94 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  31.71 
 
 		 424 aa  116  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  33.94 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  34.05 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  33.94 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  33.94 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>