More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3250 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3250  ABC transporter related  100 
 
 		 313 aa  620  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.811224  normal  0.498578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0716  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, ATPase subunit  92.38 
 
 		 315 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.905635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0486  ABC transporter related  84.39 
 
 		 309 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0680006  hitchhiker  0.00154743 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0073  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  85.43 
 
 		 286 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0327  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  85.43 
 
 		 286 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2625  ABC transporter related  81.72 
 
 		 296 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1991  ABC transporter related  82.09 
 
 		 296 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2601  ABC transporter related  82.09 
 
 		 296 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908339  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0696  ABC transporter related  83.21 
 
 		 295 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.638855 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0625  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  85.43 
 
 		 286 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2459  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  85.43 
 
 		 286 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5932  ABC heavy metal transporter, ATPase subunit  81.75 
 
 		 296 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2517  ABC transporter related  82.51 
 
 		 296 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.328547 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2649  ABC transporter related  82.51 
 
 		 296 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1028  ABC transporter, ATP-binding protein  85.83 
 
 		 290 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0822349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0869  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  85.83 
 
 		 286 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0689  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  85.83 
 
 		 302 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0865  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  85.83 
 
 		 286 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1957  ABC transporter related  56.3 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2375  ABC transporter related  44.11 
 
 		 271 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000193813 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2640  ABC transporter related  44.44 
 
 		 278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0238  ABC transporter related  46.8 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.904203  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3196  ABC transporter related  45.72 
 
 		 350 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35290  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  45.93 
 
 		 271 aa  208  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393367  normal  0.462856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0353  ABC transporter related  44.12 
 
 		 280 aa  206  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  42.02 
 
 		 273 aa  203  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2368  ABC transporter related  45.34 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.457154  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1455  ABC transporter related  43.14 
 
 		 259 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4922  ABC transporter related  42.28 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0293  ABC transporter related  43.73 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5319  ABC transporter-related protein  40.87 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256722 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2087  ABC transporter related  41.84 
 
 		 282 aa  195  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0610  ABC transporter related protein  43.7 
 
 		 248 aa  189  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.594594  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5103  ABC transporter related  42.68 
 
 		 257 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4718  ABC transporter related  42.68 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4804  ABC transporter related  42.68 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.298512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0985  ABC transporter related protein  42.29 
 
 		 263 aa  182  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1168  ABC transporter related  39.51 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.463795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0755  ABC transporter related  41.45 
 
 		 274 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.20195 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0603  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.45 
 
 		 274 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2478  ABC transporter related  43.75 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0748  Mn2+/Zn2+ ABC transporter ATPase  32.86 
 
 		 296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.966679  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  34.5 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3889  ABC transporter related  32.37 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3939  ABC transporter related  32.37 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  34.66 
 
 		 258 aa  139  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  32.63 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  34.85 
 
 		 249 aa  135  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  33.91 
 
 		 246 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  37.3 
 
 		 490 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  31.23 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2087  ABC transporter related  33.61 
 
 		 258 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.454279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  34 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  28.46 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  31.9 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  31.9 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  33.07 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  31.9 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0815  ABC transporter-related protein  33.06 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  29.88 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0125  ABC transporter related protein  29.92 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  33.05 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  28.51 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1122  ABC transporter related  36 
 
 		 427 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.672598  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2148  ABC transporter related  32.13 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  36.25 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  31.33 
 
 		 258 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  34.6 
 
 		 239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  36.36 
 
 		 490 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  29.15 
 
 		 252 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  36.67 
 
 		 256 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  32.4 
 
 		 288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  28.57 
 
 		 249 aa  126  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2999  ABC transporter related  32.91 
 
 		 251 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000922039  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  35.56 
 
 		 260 aa  126  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  34.66 
 
 		 252 aa  125  7e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  30.64 
 
 		 252 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  33.76 
 
 		 262 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  35.35 
 
 		 257 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  29.46 
 
 		 258 aa  125  8.000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  28.52 
 
 		 264 aa  125  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  30.45 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  38.19 
 
 		 253 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  32.4 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  33.74 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  29.74 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  34.63 
 
 		 271 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  30.6 
 
 		 252 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  30.64 
 
 		 252 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  39 
 
 		 258 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2133  ABC transporter related  33.86 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  28.97 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  33.75 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  34.39 
 
 		 247 aa  123  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  33.87 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0275  ABC transporter related  29.8 
 
 		 254 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2553  ABC transporter related  37.22 
 
 		 254 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.758455  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  36.03 
 
 		 260 aa  123  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  32.35 
 
 		 251 aa  123  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  28.94 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>