More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2252 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2252  ABC transporter related  100 
 
 
252 aa  507  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0584903  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2143  ABC transporter related  89.29 
 
 
252 aa  454  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00407664  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1826  high-affinity zinc transporter ATPase  86.51 
 
 
252 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11011  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2110  high-affinity zinc transporter ATPase  85.71 
 
 
252 aa  435  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.03365  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  79.76 
 
 
252 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01829  high-affinity zinc transporter ATPase  77.64 
 
 
251 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1782  ABC transporter related protein  78.05 
 
 
251 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959495  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2427  high-affinity zinc transporter ATPase  76.4 
 
 
251 aa  394  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000130602  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1328  high-affinity zinc transporter ATPase  78.05 
 
 
251 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0117105  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2088  high-affinity zinc transporter ATPase  78.05 
 
 
251 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000249071  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  79.18 
 
 
253 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0954  high-affinity zinc transporter ATPase  77.64 
 
 
251 aa  394  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00228329  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  79.18 
 
 
253 aa  395  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2594  high-affinity zinc transporter ATPase  78.05 
 
 
251 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000469162  normal  0.96409 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  79.18 
 
 
253 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01817  hypothetical protein  77.64 
 
 
251 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0235132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1774  high-affinity zinc transporter ATPase  77.64 
 
 
251 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000214201  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1950  high-affinity zinc transporter ATPase  77.64 
 
 
251 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00957136  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1356  high-affinity zinc transporter ATPase  76 
 
 
268 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420991 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2051  high-affinity zinc transporter ATPase  76 
 
 
251 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00817466  normal  0.126914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1232  high-affinity zinc transporter ATPase  76 
 
 
251 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00921374  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2106  high-affinity zinc transporter ATPase  76 
 
 
251 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2046  high-affinity zinc transporter ATPase  75.6 
 
 
251 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0293  ABC transporter related  58.06 
 
 
258 aa  300  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.380852  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0851  high-affinity zinc uptake system atp-binding protein ZnuC  58.77 
 
 
256 aa  286  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.726383  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004107  zinc ABC transporter ATP-binding protein ZnuC  58.33 
 
 
262 aa  279  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1668  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  60.26 
 
 
262 aa  278  6e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01360  hypothetical protein  57.46 
 
 
262 aa  275  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72580  zinc transporter  60.35 
 
 
269 aa  271  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705546  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6301  zinc transport protein ZnuC  60.35 
 
 
269 aa  271  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4497  ABC transporter related  59.47 
 
 
262 aa  271  7e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0061  ABC transporter-like  58.85 
 
 
261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5110  ABC transporter related  59.29 
 
 
257 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155841 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0277  ABC transporter  57.96 
 
 
262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0133  ABC transporter related  59.29 
 
 
257 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.875214  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0135  ABC transporter related  59.29 
 
 
257 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0118  zinc ABC transporter ATP-binding protein  58.59 
 
 
257 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.550689  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5266  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  57.71 
 
 
264 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1696  ABC transporter related  52.07 
 
 
301 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1711  ABC transporter related protein  51.87 
 
 
276 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.234929  normal  0.636239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00850  zinc ABC transporter, ATP binding protein  55.86 
 
 
257 aa  261  8.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2717  ABC transporter related  50.21 
 
 
304 aa  259  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426936  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1037  high-affinity zinc uptake system, ATP-binding protein  56.89 
 
 
264 aa  260  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4177  ABC transporter related  50.21 
 
 
293 aa  259  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.788551  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2383  ABC transporter related  50.21 
 
 
303 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.8611  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1028  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  49 
 
 
298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0576  ABC transporter related  49.8 
 
 
258 aa  252  3e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.925588  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1123  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  49 
 
 
298 aa  252  5.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  54.51 
 
 
261 aa  251  9.000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3181  ABC transporter related  51.75 
 
 
260 aa  245  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3776  ABC transporter related  56.89 
 
 
257 aa  245  6e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2750  high-affinity zinc uptake system ATP-binding protein ZnuC  52.63 
 
 
265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0314  ABC transporter related  48.9 
 
 
243 aa  243  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  51.54 
 
 
244 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  50.66 
 
 
243 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2185  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (zinc)  50.21 
 
 
316 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.287969  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  50.66 
 
 
243 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  50.88 
 
 
249 aa  233  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1702  zinc import ATP-binding protein  49.34 
 
 
247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00101285  normal  0.0355653 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1196  ABC transporter related  49.36 
 
 
259 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.769825  normal  0.124489 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4005  ABC transporter related  48.58 
 
 
283 aa  222  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.694858  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  46.75 
 
 
256 aa  214  9e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  47.21 
 
 
260 aa  211  7.999999999999999e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  47.39 
 
 
254 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2034  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  44.39 
 
 
243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  43.64 
 
 
248 aa  195  6e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0183  ABC transporter related  43.91 
 
 
275 aa  186  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00385632  hitchhiker  0.00108332 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0841  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 
242 aa  176  4e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.230766  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0249  ABC transporter  36.92 
 
 
217 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0938  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.49 
 
 
231 aa  153  2e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.226725  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  39.04 
 
 
269 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4438  ABC transporter-like  35.52 
 
 
257 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657591  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0823  ABC transporter related  35.19 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0800  ABC transporter related  35.19 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0223  ABC transporter-like  36.22 
 
 
254 aa  145  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1009  ABC transporter related  38.39 
 
 
308 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  36.94 
 
 
257 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1214  ABC transporter related protein  36.77 
 
 
245 aa  142  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  34.38 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  32.35 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  34.91 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1914  ABC transporter related  36.33 
 
 
254 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  36.15 
 
 
257 aa  139  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  35.14 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  33.59 
 
 
266 aa  136  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4569  ABC transporter-like protein protein  34.35 
 
 
267 aa  135  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198016  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  36.36 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  33.63 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  38.46 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  38.53 
 
 
250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  28.69 
 
 
254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2845  ABC transporter related  35.11 
 
 
288 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  34.38 
 
 
249 aa  132  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  35.95 
 
 
250 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  33.49 
 
 
259 aa  131  9e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2614  ABC transporter related  34.18 
 
 
273 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.781657  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  32.09 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0605  ABC transporter related  36.84 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0434  ABC transporter related  31.22 
 
 
240 aa  129  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0169075  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  34.5 
 
 
251 aa  129  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>