More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1103 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1814  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
493 aa  981    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.325907  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2571  ABC transporter  69.31 
 
 
495 aa  681    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22100  ABC transporter protein  69.84 
 
 
497 aa  690    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0812  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  99.8 
 
 
505 aa  982    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2046  ABC transporter related  67.48 
 
 
489 aa  648    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.470002 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1103  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
493 aa  981    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0455  ABC-type sugar transport system, ATPase component  99.39 
 
 
493 aa  975    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0360  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  99.39 
 
 
493 aa  975    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2076  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
493 aa  981    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4583  ABC transporter related  66.33 
 
 
500 aa  617  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1397  ABC transporter related  54.29 
 
 
492 aa  503  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0472986  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4065  ABC transporter related  54.08 
 
 
505 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0517348  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1632  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  53.31 
 
 
486 aa  487  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1576  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  53.06 
 
 
492 aa  486  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.369158  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2284  ABC transporter related  46.84 
 
 
494 aa  457  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0966  ABC transporter related  48.78 
 
 
502 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0912  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  48.78 
 
 
502 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3881  sugar transport ATP-binding protein  48.78 
 
 
502 aa  452  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0578526 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0249  ABC transporter component  50 
 
 
493 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0268324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  44.49 
 
 
494 aa  422  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 
525 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  45.01 
 
 
525 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  44.79 
 
 
523 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  42.91 
 
 
494 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  44.49 
 
 
513 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  44.51 
 
 
510 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  44.29 
 
 
513 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  45.23 
 
 
513 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  45.64 
 
 
520 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.02 
 
 
497 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  39.47 
 
 
496 aa  396  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  44.87 
 
 
514 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
499 aa  395  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  44.67 
 
 
512 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  43.88 
 
 
521 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  40.78 
 
 
492 aa  392  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  44.67 
 
 
512 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  44.38 
 
 
524 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.76 
 
 
512 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  41.84 
 
 
512 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  46.2 
 
 
508 aa  391  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  46.01 
 
 
512 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  44.53 
 
 
514 aa  386  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  43.27 
 
 
516 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  42.24 
 
 
513 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  44.53 
 
 
513 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  43.99 
 
 
518 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  40.29 
 
 
494 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.29 
 
 
494 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 
494 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  39.67 
 
 
496 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  39.67 
 
 
496 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.29 
 
 
494 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  44.9 
 
 
515 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 
494 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.88 
 
 
494 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 
494 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  42.2 
 
 
511 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  39.02 
 
 
501 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  43.94 
 
 
519 aa  380  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  44.72 
 
 
517 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.24 
 
 
524 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  41.31 
 
 
519 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  41.84 
 
 
524 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  41.58 
 
 
511 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  41.39 
 
 
510 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  41.73 
 
 
501 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  44.22 
 
 
511 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 
494 aa  377  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  40.52 
 
 
501 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  39.55 
 
 
497 aa  378  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  41.48 
 
 
500 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  42.45 
 
 
524 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  42.13 
 
 
585 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  41.3 
 
 
524 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  44.13 
 
 
513 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  41.3 
 
 
524 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  45.14 
 
 
514 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  43.18 
 
 
505 aa  378  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  41.46 
 
 
500 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  43.12 
 
 
511 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  39.47 
 
 
506 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  40.49 
 
 
503 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.47 
 
 
506 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  41.43 
 
 
501 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  41.09 
 
 
524 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  40.77 
 
 
515 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  41.06 
 
 
501 aa  372  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  43.56 
 
 
498 aa  373  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  39.72 
 
 
495 aa  374  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  44.76 
 
 
499 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  45.93 
 
 
515 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  39.68 
 
 
506 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  39.67 
 
 
494 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  40.89 
 
 
501 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  43.67 
 
 
503 aa  375  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  40.12 
 
 
501 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  41.39 
 
 
509 aa  375  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  42.66 
 
 
508 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02037  hypothetical protein  39.47 
 
 
506 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>