More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2571 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_22100  ABC transporter protein  77.24 
 
 		 497 aa  774    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1814  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  69.31 
 
 		 493 aa  681    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.325907  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2571  ABC transporter  100 
 
 		 495 aa  1000    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0812  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  69.31 
 
 		 505 aa  681    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1103  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  69.31 
 
 		 493 aa  681    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0455  ABC-type sugar transport system, ATPase component  69.31 
 
 		 493 aa  678    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0360  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  69.31 
 
 		 493 aa  678    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2076  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  69.31 
 
 		 493 aa  681    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2046  ABC transporter related  62.45 
 
 		 489 aa  613  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.470002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4583  ABC transporter related  58.16 
 
 		 500 aa  561  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4065  ABC transporter related  52.12 
 
 		 505 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0517348  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1397  ABC transporter related  52.34 
 
 		 492 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0472986  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_004310  BR1632  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  51.75 
 
 		 486 aa  481  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1576  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  51.42 
 
 		 492 aa  480  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.369158  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2284  ABC transporter related  48.19 
 
 		 494 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0249  ABC transporter component  48.09 
 
 		 493 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0268324  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0912  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  47.17 
 
 		 502 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0966  ABC transporter related  47.17 
 
 		 502 aa  432  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3881  sugar transport ATP-binding protein  46.96 
 
 		 502 aa  431  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0578526 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  45.16 
 
 		 494 aa  413  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  45.12 
 
 		 525 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  43.61 
 
 		 513 aa  411  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  43.46 
 
 		 524 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 		 525 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  44.29 
 
 		 494 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  43.26 
 
 		 523 aa  400  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  42.16 
 
 		 524 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  42.16 
 
 		 524 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  42.14 
 
 		 524 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  44.4 
 
 		 513 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  43.5 
 
 		 521 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  42.28 
 
 		 524 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  43.79 
 
 		 513 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  42.02 
 
 		 524 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  41.88 
 
 		 524 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  42.97 
 
 		 512 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  42.63 
 
 		 513 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  43.58 
 
 		 518 aa  391  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  42.6 
 
 		 510 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.26 
 
 		 527 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  43.15 
 
 		 514 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  42.36 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  42.02 
 
 		 515 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  43.62 
 
 		 512 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  43.62 
 
 		 512 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  42.94 
 
 		 511 aa  388  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  41.35 
 
 		 496 aa  384  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  41.7 
 
 		 497 aa  385  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  38.71 
 
 		 501 aa  385  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  41.51 
 
 		 494 aa  385  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  43.81 
 
 		 514 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  43.62 
 
 		 512 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.91 
 
 		 512 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  42.65 
 
 		 498 aa  376  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  42.54 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40.57 
 
 		 497 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  43.09 
 
 		 503 aa  378  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  43.06 
 
 		 520 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 		 515 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2326  ABC transporter related protein  38.03 
 
 		 501 aa  375  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  41.09 
 
 		 537 aa  375  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  43.72 
 
 		 511 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  42.51 
 
 		 514 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  40.4 
 
 		 500 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  40.62 
 
 		 510 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  40.94 
 
 		 496 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  42.48 
 
 		 513 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  40.69 
 
 		 502 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  39.96 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  41.87 
 
 		 505 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.57 
 
 		 522 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 525 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  42.45 
 
 		 515 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.36 
 
 		 515 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.57 
 
 		 515 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.77 
 
 		 519 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.57 
 
 		 515 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  42.05 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  43.41 
 
 		 516 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  41.45 
 
 		 513 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  42.48 
 
 		 503 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  42.51 
 
 		 508 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  40.85 
 
 		 504 aa  368  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  42.89 
 
 		 520 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1060  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.92 
 
 		 506 aa  368  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  41.99 
 
 		 514 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  39.88 
 
 		 501 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  42.68 
 
 		 517 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  41.99 
 
 		 514 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3418  ABC transporter related  42.51 
 
 		 526 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.247847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  41.78 
 
 		 501 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  40.04 
 
 		 511 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  41.99 
 
 		 514 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  39.1 
 
 		 496 aa  365  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  41.3 
 
 		 499 aa  364  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39.92 
 
 		 503 aa  364  2e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  41.3 
 
 		 499 aa  364  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2996  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  38.32 
 
 		 506 aa  363  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.1 
 
 		 494 aa  363  3e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>