More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2848 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2848  ABC transporter related protein  100 
 
 
367 aa  753    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1389  ABC transporter related  68.27 
 
 
368 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0535  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  54.18 
 
 
376 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0477  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  53.3 
 
 
376 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  53.58 
 
 
376 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0566  glycerol-3-phosphate ABC transporter ATP-binding protein  54.18 
 
 
376 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0622  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  53.43 
 
 
365 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4736  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  53.12 
 
 
365 aa  363  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925673  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0480  ABC transporter related  53.01 
 
 
365 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0603  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  52.71 
 
 
365 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0697  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  53.12 
 
 
365 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0629  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  53.58 
 
 
376 aa  360  3e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  48.37 
 
 
370 aa  332  7.000000000000001e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1353  ABC transporter related  48.16 
 
 
344 aa  332  9e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.275168  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  47.77 
 
 
367 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  46.17 
 
 
366 aa  329  6e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.17 
 
 
366 aa  329  6e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.17 
 
 
366 aa  329  6e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  47.25 
 
 
366 aa  329  6e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  46.17 
 
 
366 aa  329  6e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4035  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.17 
 
 
366 aa  329  6e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4141  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.9 
 
 
366 aa  328  7e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000074393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.9 
 
 
366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4122  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.9 
 
 
366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0138965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1117  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.88 
 
 
366 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000190219  normal  0.407597 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  46.69 
 
 
367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  46.69 
 
 
367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  45.88 
 
 
366 aa  326  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  48.56 
 
 
352 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  49.01 
 
 
330 aa  325  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  46.61 
 
 
367 aa  320  3e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  46.61 
 
 
367 aa  320  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0907  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 
375 aa  319  5e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0858146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0204  ABC transporter related  46.74 
 
 
365 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0198  ABC transporter related  46.74 
 
 
365 aa  318  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0274814  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  46.85 
 
 
369 aa  316  4e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  46.83 
 
 
370 aa  315  7e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  47.11 
 
 
356 aa  315  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  48.45 
 
 
361 aa  315  7e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 
360 aa  315  8e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  45.36 
 
 
374 aa  315  9e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0430  ABC transporter related protein  46.96 
 
 
359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  48.3 
 
 
426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 
360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  46.07 
 
 
367 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 
360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  50.32 
 
 
363 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.61 
 
 
349 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  46.78 
 
 
360 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  46.78 
 
 
360 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  46.78 
 
 
360 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3157  ABC transporter related  48.44 
 
 
331 aa  311  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  46.32 
 
 
370 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  46.5 
 
 
360 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  46.85 
 
 
366 aa  311  1e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  48.61 
 
 
350 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  46.01 
 
 
370 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  44.7 
 
 
404 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  45.68 
 
 
357 aa  310  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1763  ABC-type sugar transport systems ATPase components  44 
 
 
410 aa  309  4e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0592656  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  46.81 
 
 
363 aa  310  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2017  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein  47.74 
 
 
333 aa  309  5e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0462  ABC transporter related  48.73 
 
 
365 aa  309  5e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1739  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.35 
 
 
359 aa  309  5.9999999999999995e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.11345  hitchhiker  0.00063526 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1631  ABC transporter related  46.35 
 
 
359 aa  308  8e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1524  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.35 
 
 
359 aa  308  8e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  48.3 
 
 
356 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  48.33 
 
 
355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3980  ABC transporter related  44.56 
 
 
405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  45.66 
 
 
359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4054  ABC transporter related  44.56 
 
 
405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.955986 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  45.14 
 
 
370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.62 
 
 
363 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  48.9 
 
 
360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  46.41 
 
 
364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  46.15 
 
 
357 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.33 
 
 
349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3994  ABC transporter related  44.61 
 
 
405 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.73747  normal  0.280943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  45.13 
 
 
353 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  48.42 
 
 
360 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  45.58 
 
 
372 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  47.59 
 
 
361 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  46.33 
 
 
349 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  45.51 
 
 
364 aa  305  6e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  46.65 
 
 
364 aa  305  7e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0279  ABC transporter, ATPase subunit  43.96 
 
 
386 aa  305  7e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.213397  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  46.41 
 
 
364 aa  305  7e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1888  ABC transporter related  46.11 
 
 
359 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.2512 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  46.39 
 
 
352 aa  305  8.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5593  ABC transporter related  47.63 
 
 
352 aa  305  9.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4710  ABC transporter related  45.43 
 
 
380 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  45.88 
 
 
364 aa  305  9.000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0359  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sn-Glycerol-3-phosphate)  46.2 
 
 
368 aa  304  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2660  ABC transporter related  47.75 
 
 
346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0625705  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  45.2 
 
 
353 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3556  ABC transporter related  47.91 
 
 
370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0802709  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2845  ABC transporter related  46.43 
 
 
379 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.649643  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  47.63 
 
 
358 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3307  ABC transporter related  47.75 
 
 
346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  44.73 
 
 
355 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>