103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1320 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  492  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  89.41 
 
 		 243 aa  442  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  88.24 
 
 		 238 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  51.98 
 
 		 234 aa  255  3e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  39.75 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  35.68 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  34.45 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  36.25 
 
 		 250 aa  141  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  34.19 
 
 		 241 aa  136  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  33.06 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  36.17 
 
 		 264 aa  135  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  34.03 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  34.96 
 
 		 257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  35.19 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  132  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 241 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  34.01 
 
 		 258 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  32.77 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  33.19 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  32.77 
 
 		 250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  34.58 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  33.05 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  33.33 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  32.64 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  32.74 
 
 		 246 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  32.84 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  32.28 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  37.5 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  31 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  33.2 
 
 		 258 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  34.48 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  27.73 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  28.57 
 
 		 250 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  30.88 
 
 		 236 aa  89  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  28.8 
 
 		 244 aa  88.6  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  28.63 
 
 		 285 aa  85.9  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  28.02 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  28.18 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  28.78 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  25.88 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  36.67 
 
 		 94 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  36.67 
 
 		 94 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  28.04 
 
 		 570 aa  47  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  36.67 
 
 		 94 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7287  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron (III) dicitrate)  28.74 
 
 		 264 aa  47  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  27.27 
 
 		 344 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  29.48 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  29.07 
 
 		 256 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0115  ABC transporter related  28.99 
 
 		 208 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0572361 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3889  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  25.12 
 
 		 278 aa  45.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2667  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  26.74 
 
 		 262 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1540  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  26.74 
 
 		 262 aa  45.4  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.311202 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2749  ABC transporter related  26.74 
 
 		 262 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.750799  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3805  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  24.64 
 
 		 278 aa  45.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5948  ABC transporter related  26.35 
 
 		 330 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.119388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2757  ABC transporter related  30.77 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.268133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4414  phosphate transporter ATP-binding protein  31.71 
 
 		 276 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0281  ABC transporter related  25.75 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  28.8 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1238  ABC transporter related protein  29.24 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0584  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  25.7 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  25.7 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.37672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0528  iron(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  25.7 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0618  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  25.7 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  26.98 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0295  ABC transporter related  25.65 
 
 		 249 aa  43.5  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.852806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0532  ABC transporter related  25.7 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.969378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0655  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  25.7 
 
 		 273 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3037  ABC transporter related  29.24 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4683  ABC sugar transporter, ATPase subunit  28.49 
 
 		 517 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.532161  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  25.14 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0014346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4682  ferric enterobactin transport ATP-binding protein FepC  25.7 
 
 		 273 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.207042  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1757  ABC transporter related  24.31 
 
 		 538 aa  43.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0110812  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  27.13 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5743  ABC transporter related  22.55 
 
 		 516 aa  42.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2972  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  30.71 
 
 		 515 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1873  sugar transport ATP-binding protein  30.71 
 
 		 515 aa  42.7  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3044  ABC transporter related  30.71 
 
 		 515 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0673  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  25.14 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2296700000000006e-24 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  26.8 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1384  ABC transporter related protein  26.2 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0283767 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0686  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  25.7 
 
 		 273 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2784  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  28.05 
 
 		 359 aa  42.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000880352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4117  hypothetical protein  33.33 
 
 		 441 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2643  ABC transporter related  27.06 
 
 		 489 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.031019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0333  ABC transporter related  27.27 
 
 		 282 aa  42.4  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  27.51 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1049  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  25.75 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1063  ABC transporter related  28.49 
 
 		 517 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1543  ABC transporter related  28.49 
 
 		 517 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0849155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  25.27 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  27.51 
 
 		 257 aa  42  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0799  ABC transporter related  30.12 
 
 		 260 aa  42  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.694735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  34.55 
 
 		 429 aa  42  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1696  ABC transporter related  26.14 
 
 		 269 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  26.63 
 
 		 244 aa  42  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  28.49 
 
 		 517 aa  41.6  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  29.78 
 
 		 258 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>