97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1380 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  493  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  51.98 
 
 		 238 aa  255  3e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  51.53 
 
 		 238 aa  255  4e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  51.1 
 
 		 243 aa  247  1e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  40 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  38.53 
 
 		 241 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  37.61 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  38.1 
 
 		 241 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  37.79 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  38.1 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  38.1 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  38.14 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  37.02 
 
 		 250 aa  148  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  39.41 
 
 		 249 aa  148  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  37.66 
 
 		 241 aa  148  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  37.02 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  37.02 
 
 		 250 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  37.02 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  37.23 
 
 		 249 aa  144  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  36.91 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  40.93 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  38.49 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  37.77 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  38.68 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  33.19 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  36.77 
 
 		 246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  36.61 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  33.48 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  37.96 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  33.63 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  32.5 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  29.75 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  32.72 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  32.39 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  31.16 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  29.02 
 
 		 285 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  29.24 
 
 		 250 aa  88.6  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  32.47 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  26.4 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  28.94 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  30.7 
 
 		 279 aa  75.1  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  27.62 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  53.33 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  53.33 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  53.33 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  25.27 
 
 		 899 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0452  ABC transporter related protein  25.13 
 
 		 305 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2295  ABC transporter related  27.91 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2406  ABC transporter-related protein  25 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  27.17 
 
 		 274 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  24.73 
 
 		 903 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0309  putative ATPase RIL  27.23 
 
 		 609 aa  45.4  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0748  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  30.32 
 
 		 264 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0629  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  30.32 
 
 		 264 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.781197  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  27.06 
 
 		 311 aa  44.7  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00544  hypothetical protein  28.39 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  28.39 
 
 		 271 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0686  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  29.03 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.926109 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0702  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  29.03 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3038  ABC transporter related protein  28.39 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  25.39 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0639  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  28.39 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0607  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  28.39 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3056  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  28.39 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00555  iron-enterobactin transporter subunit  28.39 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0489  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  28.03 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0643  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  29.03 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0306  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  24.57 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  31.48 
 
 		 567 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  25.42 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0333  putative ATPase RIL  24.75 
 
 		 610 aa  43.5  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  25.77 
 
 		 268 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3503  ABC transporter related  24.34 
 
 		 273 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  22.75 
 
 		 1004 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1750  ABC transporter related  24.55 
 
 		 226 aa  43.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.465278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3492  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  25.79 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3864  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  23.81 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0003  recombination protein F  44.83 
 
 		 373 aa  42.7  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5326  ABC transporter-related protein  26.01 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  28.02 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3834  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  25.79 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.860088  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3480  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  25.79 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3784  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  25.79 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0409851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3580  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  23.81 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.961054  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3768  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  24.34 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3746  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  23.81 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000209969 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1465  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  25.79 
 
 		 273 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310402 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3805  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  23.36 
 
 		 278 aa  42.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1087  ATP-dependent OLD family endonuclease  45.45 
 
 		 616 aa  42.4  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.14427  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  24.16 
 
 		 321 aa  42.4  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4655  ABC transporter related  26.14 
 
 		 238 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000808014  hitchhiker  0.00473023 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0215  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  27.43 
 
 		 259 aa  42  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1735  AAA ATPase  38.24 
 
 		 484 aa  42.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5171  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  28.05 
 
 		 329 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  25.88 
 
 		 319 aa  42  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1872  hypothetical protein  41.67 
 
 		 585 aa  41.6  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1807  ABC transporter related  26.26 
 
 		 233 aa  42  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.820748  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>