43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0602 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 94 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 94 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 94 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  67.44 
 
 		 250 aa  120  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  62.65 
 
 		 250 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  57.83 
 
 		 241 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  56.63 
 
 		 250 aa  110  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  62.03 
 
 		 249 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  57.83 
 
 		 250 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  55.42 
 
 		 250 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 		 250 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  55.42 
 
 		 241 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  55.42 
 
 		 250 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  55.42 
 
 		 241 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  55.42 
 
 		 241 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  55.42 
 
 		 241 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  56.79 
 
 		 249 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  61.25 
 
 		 250 aa  104  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  54.88 
 
 		 242 aa  100  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  50.57 
 
 		 253 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  52.33 
 
 		 246 aa  97.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  45.54 
 
 		 264 aa  96.7  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  53.85 
 
 		 264 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  47.62 
 
 		 242 aa  72  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  59.65 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  44.58 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  42.86 
 
 		 256 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  50.85 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  42.25 
 
 		 258 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  43.94 
 
 		 236 aa  60.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  45.71 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  39.18 
 
 		 250 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  53.33 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  43.1 
 
 		 263 aa  53.9  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  40 
 
 		 244 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  35 
 
 		 238 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  46.43 
 
 		 247 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  36.67 
 
 		 238 aa  47  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  45.28 
 
 		 241 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  36.67 
 
 		 243 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  36.67 
 
 		 238 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  43.75 
 
 		 279 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  35.59 
 
 		 269 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>