169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1795 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  100 
 
 		 279 aa  567  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  53.44 
 
 		 250 aa  249  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  55.95 
 
 		 247 aa  249  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  40.52 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  42.15 
 
 		 236 aa  149  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  42.79 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  39.42 
 
 		 244 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  38.12 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  35.69 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  35.9 
 
 		 242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  39.81 
 
 		 246 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  35.32 
 
 		 250 aa  122  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  32.3 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  37.55 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  31.91 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  32.2 
 
 		 241 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  33.47 
 
 		 250 aa  118  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  33.07 
 
 		 249 aa  118  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  31.78 
 
 		 241 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  35.09 
 
 		 264 aa  116  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  34.31 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  30.93 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  30.65 
 
 		 250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  30.65 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  32.86 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  32.86 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  30.24 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  30.24 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  33.33 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  29.8 
 
 		 250 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  35.04 
 
 		 249 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  29.03 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  29.47 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  33.07 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  29.82 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  30.09 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  30.41 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  30.61 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  28.18 
 
 		 238 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  30.7 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  23.91 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  26.18 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1212  ABC transporter related  30.95 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2191  ABC transporter related  28.64 
 
 		 313 aa  53.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12190  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28.35 
 
 		 516 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  29.52 
 
 		 326 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  28.57 
 
 		 503 aa  50.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  29.35 
 
 		 1108 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2995  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  27.22 
 
 		 522 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5973  ABC transporter related  27.81 
 
 		 516 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07731  ABC transporter ATPase  22.28 
 
 		 268 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  28.92 
 
 		 316 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3568  ABC transporter related  28.22 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2876  ABC transporter  26.63 
 
 		 523 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0988  ABC transporter-like  25.6 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0162069  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  26.46 
 
 		 508 aa  48.1  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6460  ABC transporter related  28.07 
 
 		 516 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121658  normal  0.108747 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  26.84 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1949  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  32.91 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0406982 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0465  ABC-type transport systems, ATPase components  28.05 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  25.51 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  22.56 
 
 		 258 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08928  ATP-binding cassette multidrug transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78576]  24.26 
 
 		 1466 aa  47  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0515148 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4652  ABC transporter, ATP-binding protein  27.81 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4672  ABC transporter, ATP-binding protein  27.81 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5049  ABC transporter, ATP-binding protein  27.81 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  27.49 
 
 		 493 aa  47  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2499  ABC transporter related  22.56 
 
 		 566 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119731  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.1 
 
 		 648 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  28.32 
 
 		 499 aa  46.6  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  30.1 
 
 		 648 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24710  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  25.12 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2581  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  30.46 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00566513  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4466  ABC transporter related  28.19 
 
 		 506 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.1 
 
 		 648 aa  46.2  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.1 
 
 		 648 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  30.1 
 
 		 648 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5078  ABC transporter, ATP-binding protein  27.04 
 
 		 219 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1515  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.74 
 
 		 262 aa  45.8  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.118951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4810  ABC transporter ATP-binding protein  27.81 
 
 		 219 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  25 
 
 		 529 aa  45.8  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5175  ABC transporter ATP-binding protein  27.81 
 
 		 219 aa  45.8  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0005  ABC transporter related  26.74 
 
 		 269 aa  45.8  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.964795  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.1 
 
 		 648 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2120  putative ABC transporter, ATP-binding protein  26.54 
 
 		 249 aa  45.8  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.100016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0162  ABC transporter, ATP-binding protein  28.27 
 
 		 219 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.1 
 
 		 648 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5520  ABC transporter related  27.89 
 
 		 261 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293027  normal  0.195209 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  30.1 
 
 		 648 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1121  ABC transporter related  26.26 
 
 		 539 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0474016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  29.88 
 
 		 334 aa  45.8  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3457  ABC transporter-related protein  27.49 
 
 		 519 aa  45.8  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.244648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  30.06 
 
 		 903 aa  45.4  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0527  ABC transporter related  31.18 
 
 		 348 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5080  ABC transporter, ATP-binding protein  28.34 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57529  ATP dependent transporter multidrug resistance (SNQ2)  27.07 
 
 		 1455 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.088165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  27.32 
 
 		 770 aa  45.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  25.82 
 
 		 506 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1948  ABC transporter related  31.36 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.200483  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1471  ABC transporter related  33.85 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.51412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>