More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2120 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2120  putative ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
249 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.100016  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1751  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 
221 aa  145  5e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1931  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 
221 aa  145  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1657  nickel import ATP-binding protein NikE  40.2 
 
 
219 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1565  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
221 aa  139  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5672  ABC transporter related  32.1 
 
 
314 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2181  ABC transporter related  36.49 
 
 
543 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5120  dipeptide transporter ATP-binding subunit  29.44 
 
 
323 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58490  dipeptide transporter ATP-binding subunit  29.44 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0921  dipeptide transporter ATP-binding subunit  29.66 
 
 
322 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  0.93527 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4300  dipeptide transporter ATP-binding subunit  29.66 
 
 
322 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0878  dipeptide transporter ATP-binding subunit  29.44 
 
 
322 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0809  dipeptide transporter ATP-binding subunit  29.03 
 
 
326 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0917  dipeptide transporter ATP-binding subunit  29.66 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400518  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1823  ABC transporter related  37.5 
 
 
545 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0401601  normal  0.812901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0412  ABC transporter related  36.28 
 
 
530 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.572296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0837  dipeptide transporter ATP-binding subunit  29.91 
 
 
323 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4500  ABC transporter related  34.84 
 
 
543 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.670508  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2576  ABC transporter related protein  28.74 
 
 
601 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0615694 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6423  ABC transporter related  34.89 
 
 
543 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0849413  normal  0.0525416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.62 
 
 
323 aa  129  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  29.77 
 
 
593 aa  129  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1667  ABC transporter related  31.65 
 
 
283 aa  129  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3078  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  31.43 
 
 
338 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.111325  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3307  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  32.89 
 
 
349 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.595916  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5352  ABC transporter related  31.36 
 
 
544 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.692209 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5262  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  36.28 
 
 
335 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1447  ABC transporter related  35.83 
 
 
342 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513841  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  32.34 
 
 
547 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12480  Oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding component  30.47 
 
 
319 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0130592  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1552  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.62 
 
 
324 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3165  ABC transporter related  34.09 
 
 
540 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4242  dipeptide transporter ATP-binding subunit  29.02 
 
 
324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.410741  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0025  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.05 
 
 
347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.408235  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02945  hypothetical protein  33.48 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  29.62 
 
 
547 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4180  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  30.08 
 
 
346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5512  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  32.34 
 
 
366 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.312894 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0857  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
558 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0251  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  36.06 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  29.73 
 
 
593 aa  126  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3520  peptide ABC transporter ATPase  34.09 
 
 
540 aa  126  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206923  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002963  oligopeptide transport ATP-binding protein OppF  33.8 
 
 
331 aa  126  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1732  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.48 
 
 
321 aa  126  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.561922  hitchhiker  0.00101303 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7026  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  34.43 
 
 
326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2606  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.17 
 
 
619 aa  125  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.865206  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0561  ABC transporter for peptide ATP-binding protein  30.25 
 
 
566 aa  125  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0613  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  33.05 
 
 
336 aa  125  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0573  ABC transporter related  33.48 
 
 
308 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0563  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.24 
 
 
322 aa  125  7e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000751323 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3768  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  35.51 
 
 
331 aa  125  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227967  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0063  ABC transporter related  29.86 
 
 
282 aa  125  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0307573  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0728  hypothetical protein  31.8 
 
 
603 aa  125  9e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1292  ABC transporter related  33.94 
 
 
282 aa  125  9e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0488564  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  31.13 
 
 
669 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3267  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  28.51 
 
 
339 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.231305  normal  0.0278452 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 
339 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 
339 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 
339 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2968  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  29.72 
 
 
328 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129298  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2847  ABC transporter related  33.18 
 
 
540 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.300943  normal  0.170999 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  31.9 
 
 
549 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1062  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.56 
 
 
322 aa  124  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 
339 aa  123  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3945  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.56 
 
 
611 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0762521 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0672  ABC transporter related  31.25 
 
 
261 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.92463  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  35.98 
 
 
339 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 
339 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2191  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.42 
 
 
334 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00505633  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2298  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.51 
 
 
334 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.322598  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0065  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  33.75 
 
 
335 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  35.98 
 
 
339 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 
339 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1950  oligopeptide transport ATP-binding protein F  32.64 
 
 
330 aa  123  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0347  ABC transporter related  33.62 
 
 
320 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 
339 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  34.35 
 
 
575 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0788  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 
308 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0634106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 
308 aa  123  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  32.7 
 
 
623 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0626  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  34.11 
 
 
308 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1585  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein OppF  31.51 
 
 
334 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0569  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 
308 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187494  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0747  hypothetical protein  31.8 
 
 
602 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4734  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.31 
 
 
339 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0119  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  28.45 
 
 
339 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0814918  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0659  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  34.11 
 
 
308 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.575275  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1403  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein OppF  31.51 
 
 
334 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5322  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  29.31 
 
 
339 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3930  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  34.56 
 
 
611 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3024  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  29.88 
 
 
346 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1870  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein OppF  31.51 
 
 
334 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332373  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5538  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  29.31 
 
 
339 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00809075  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1933  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein OppF  31.51 
 
 
334 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0322405 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1876  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein OppF  31.51 
 
 
334 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.650916  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0716  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 
308 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000233806 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4004  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  34.56 
 
 
611 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1711  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  33.04 
 
 
325 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  35.35 
 
 
335 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2066  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  31.42 
 
 
333 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.652526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>