More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1577 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1577  histidine kinase  100 
 
 		 750 aa  1423    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.348656  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5292  ABC transporter-related protein  41.06 
 
 		 260 aa  163  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.688621  normal  0.0485107 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3702  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.73 
 
 		 265 aa  157  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3437  ABC transporter related  40.73 
 
 		 265 aa  157  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196667  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4592  ABC transporter related  39.25 
 
 		 273 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2813  ABC transporter related  38.65 
 
 		 276 aa  156  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7377  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (xylose)  38.19 
 
 		 277 aa  155  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1125  ABC transporter related protein  39.33 
 
 		 266 aa  155  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13168  normal  0.0632249 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0241  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  38.13 
 
 		 288 aa  155  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1033  ABC transporter related  42.31 
 
 		 265 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2273  ABC transporter-like protein  39.42 
 
 		 257 aa  154  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0986317 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6322  ABC transporter related  38.19 
 
 		 273 aa  154  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.645186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24380  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  41 
 
 		 275 aa  152  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.446861  normal  0.0741452 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4237  ABC transporter related  39.33 
 
 		 271 aa  150  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.413873  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1131  ABC transporter related  39.18 
 
 		 261 aa  150  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0806733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5347  ABC transporter related  38.91 
 
 		 261 aa  150  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0260  ABC transporter related  39.84 
 
 		 260 aa  150  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.469491  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3847  ABC transporter related  39.33 
 
 		 271 aa  150  7e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1921  ABC-type sugar transport system ATPase component  38.52 
 
 		 261 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1693  ABC transporter-like protein  35.92 
 
 		 280 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.564915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5948  ABC transporter related  40 
 
 		 313 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1719  ABC transporter related  34.66 
 
 		 262 aa  148  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0707224  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4211  ABC transporter related protein  39.06 
 
 		 276 aa  148  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2673  ABC transporter related protein  38.08 
 
 		 261 aa  148  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00128124  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0266  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.74 
 
 		 286 aa  147  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.079938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6740  ABC transporter related protein  37.24 
 
 		 254 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  35.68 
 
 		 513 aa  147  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  39.75 
 
 		 252 aa  144  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6694  ABC transporter related  38.93 
 
 		 262 aa  145  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.356782  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5342  ABC transporter  36.51 
 
 		 249 aa  144  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0692  ABC transporter related  37.13 
 
 		 271 aa  144  7e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2601  ABC transporter related  37.17 
 
 		 258 aa  144  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2583  ABC transporter-like protein  39.58 
 
 		 254 aa  144  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1998  ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 		 248 aa  144  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0341354  normal  0.212812 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3176  ABC transporter related  35 
 
 		 263 aa  143  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.430068  normal  0.827076 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27990  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  39.18 
 
 		 252 aa  143  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2840  ABC transporter related  34.84 
 
 		 260 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.3845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2692  ABC transporter related protein  35.22 
 
 		 264 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2703  ABC transporter-related protein  36.55 
 
 		 258 aa  142  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.787131  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1187  ABC transporter related  41 
 
 		 264 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.401309  normal  0.155677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1504  ABC transporter related  38.08 
 
 		 257 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2511  ABC transporter related protein  40.17 
 
 		 276 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1178  ABC sugar (xylose) transporter, ATPase subunit  34.43 
 
 		 260 aa  142  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0548  ABC transporter related  37.99 
 
 		 266 aa  142  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3969  ABC transporter related  38.3 
 
 		 254 aa  141  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349444  normal  0.0435922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2994  ABC transporter related  39.3 
 
 		 263 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1574  ABC transporter related  36.76 
 
 		 261 aa  140  7.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.266375  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5022  ABC transporter related  33.88 
 
 		 258 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5339  ABC transporter related protein  38.43 
 
 		 278 aa  140  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5293  ABC transporter related  31.95 
 
 		 266 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0740635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1364  ABC transporter related  42.04 
 
 		 278 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.113543  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3425  ABC transporter related  35.54 
 
 		 246 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1753  ABC transporter-like protein  34.16 
 
 		 257 aa  139  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0987723  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  36.03 
 
 		 265 aa  139  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2943  ABC transporter related  34.3 
 
 		 247 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  35.68 
 
 		 539 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1274  ABC transporter-like protein  36.4 
 
 		 244 aa  139  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4284  ABC transporter related protein  37.2 
 
 		 260 aa  138  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2617  ABC transporter related  34.73 
 
 		 260 aa  138  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4228  ABC transporter related protein  36.07 
 
 		 506 aa  138  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0995  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.59 
 
 		 502 aa  137  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1713  ABC transporter-like protein  35.95 
 
 		 260 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2447  ABC transporter related protein  33.2 
 
 		 495 aa  137  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000548266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  41.82 
 
 		 505 aa  137  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4929  ABC transporter related  35.12 
 
 		 246 aa  136  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.663119 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01030  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  35.47 
 
 		 522 aa  137  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2671  ABC transporter related protein  37.55 
 
 		 269 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000816223  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1427  ABC transporter related  33.33 
 
 		 266 aa  136  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000710187  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  35.66 
 
 		 506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0992  ABC transporter related  42.34 
 
 		 257 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1600  ABC transporter related  36.59 
 
 		 260 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3341  ABC transporter related  32.5 
 
 		 262 aa  135  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00439567  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0037  ABC transporter related protein  35.68 
 
 		 247 aa  135  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1854  ABC transporter related  35.08 
 
 		 259 aa  135  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4067  ABC transporter related  37.61 
 
 		 496 aa  135  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0476  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  37.61 
 
 		 496 aa  135  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0148  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  37.61 
 
 		 496 aa  135  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361964  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6849  ABC transporter related  37.13 
 
 		 255 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.603639  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3112  ABC transporter related  33.33 
 
 		 261 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.856974  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4993  ABC transporter related protein  39.33 
 
 		 283 aa  134  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4851  ABC transporter related  29.08 
 
 		 262 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.782543  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1210  ABC transporter  34.85 
 
 		 261 aa  134  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.986169  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3594  ABC transporter related  35.19 
 
 		 266 aa  134  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4339  ABC transporter related  37.78 
 
 		 263 aa  134  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1857  sugar ABC transporter ATPase  37.1 
 
 		 288 aa  134  6.999999999999999e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0183  ABC transporter related protein  35.24 
 
 		 285 aa  134  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2473  ABC transporter related protein  37.2 
 
 		 258 aa  134  7.999999999999999e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200808  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1833  ABC transporter related  33.75 
 
 		 259 aa  134  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1972  ABC transporter related  37.34 
 
 		 269 aa  134  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5969  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  35.53 
 
 		 268 aa  133  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.354097  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0842  ABC transporter-related protein  35.8 
 
 		 271 aa  133  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2607  ABC transporter related  35.93 
 
 		 260 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143234  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  39.25 
 
 		 529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0885  ABC transporter related  38.07 
 
 		 245 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800857 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  36.44 
 
 		 519 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3128  ABC transporter related protein  36.96 
 
 		 275 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  hitchhiker  0.00266425 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1808  ABC transporter related  35.68 
 
 		 294 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.976965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2408  ABC transporter-related protein  32.08 
 
 		 267 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0345  ABC transporter related  35.2 
 
 		 271 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0802428 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  39.15 
 
 		 526 aa  132  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.552248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>