More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0995 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0995  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
502 aa  1003    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6383  ABC transporter related  73.74 
 
 
504 aa  723    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.446216  normal  0.131089 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40.37 
 
 
497 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  40.6 
 
 
503 aa  376  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  43.7 
 
 
500 aa  363  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.38 
 
 
492 aa  363  5.0000000000000005e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  38.24 
 
 
493 aa  359  6e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  39.64 
 
 
501 aa  355  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.09 
 
 
494 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  38.09 
 
 
494 aa  354  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.09 
 
 
494 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3109  ABC transporter related  39.36 
 
 
500 aa  354  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00977673  hitchhiker  0.0000567489 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  37.07 
 
 
492 aa  354  2e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  38.88 
 
 
501 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2524  ABC transporter related  40.32 
 
 
505 aa  353  5e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  41.32 
 
 
506 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.88 
 
 
494 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  41.63 
 
 
508 aa  350  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  40.49 
 
 
504 aa  351  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.68 
 
 
494 aa  349  7e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.8 
 
 
494 aa  348  9e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  41.26 
 
 
509 aa  348  9e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.46 
 
 
516 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  37.68 
 
 
496 aa  348  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  38.6 
 
 
501 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  39.23 
 
 
495 aa  348  2e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  37.4 
 
 
496 aa  348  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  40.82 
 
 
499 aa  347  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3766  ABC transporter related  38.54 
 
 
492 aa  347  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0098796  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  40.45 
 
 
505 aa  347  4e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  39.92 
 
 
544 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  40.37 
 
 
501 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  39.56 
 
 
507 aa  345  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0711  ABC transporter related  43.18 
 
 
495 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109933  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  38.08 
 
 
501 aa  344  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 
494 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  40.4 
 
 
513 aa  343  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 
540 aa  343  5.999999999999999e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  39.39 
 
 
544 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 
507 aa  342  5.999999999999999e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5167  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  41.1 
 
 
517 aa  342  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 
494 aa  342  9e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  39.69 
 
 
512 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  38.48 
 
 
507 aa  341  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  40 
 
 
495 aa  342  1e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  40.85 
 
 
516 aa  342  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  39.36 
 
 
507 aa  341  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3182  ABC transporter related  40.64 
 
 
518 aa  341  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.868778  normal  0.140125 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  40.28 
 
 
505 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  40.4 
 
 
519 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3707  ABC transporter related  39.36 
 
 
508 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.934804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  39.39 
 
 
517 aa  340  4e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  41.08 
 
 
514 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0757  ABC transporter related protein  42.65 
 
 
525 aa  339  5.9999999999999996e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0933075  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0839  ABC transporter related  39.76 
 
 
515 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  40.57 
 
 
508 aa  339  8e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  38.41 
 
 
501 aa  338  9e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3174  ABC transporter related  39.44 
 
 
512 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  40.65 
 
 
511 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.4 
 
 
515 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.4 
 
 
515 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.4 
 
 
515 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0391  ABC transporter related protein  37.8 
 
 
499 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.302991  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1425  ABC transporter related  38.87 
 
 
530 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577416  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  40.85 
 
 
515 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.4 
 
 
522 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  37.55 
 
 
516 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0614  ABC transporter related  40.56 
 
 
511 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  37.55 
 
 
516 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2246  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.28 
 
 
511 aa  337  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000548441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12280  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  40.71 
 
 
505 aa  337  2.9999999999999997e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171798  normal  0.428152 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  37.2 
 
 
501 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2913  ABC transporter related  39.04 
 
 
512 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169153  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4850  ABC transporter related  40.08 
 
 
503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.616228  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  37.55 
 
 
516 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4656  ABC transporter related protein  39.36 
 
 
506 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479751 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  37.55 
 
 
501 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  37.55 
 
 
516 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  38.96 
 
 
504 aa  337  3.9999999999999995e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.17 
 
 
519 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  38.23 
 
 
507 aa  336  5e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  37.2 
 
 
501 aa  336  7e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  37.2 
 
 
501 aa  336  7e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  38.37 
 
 
506 aa  336  7e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  39.43 
 
 
519 aa  336  7e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  37.2 
 
 
501 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  37.2 
 
 
501 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  37.2 
 
 
501 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  38.6 
 
 
506 aa  335  9e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4263  ABC transporter related  38.55 
 
 
508 aa  335  9e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208543  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  39.53 
 
 
535 aa  335  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  37.93 
 
 
499 aa  335  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  38.34 
 
 
497 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1825  ABC transporter related  38.89 
 
 
505 aa  335  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0788496  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.75 
 
 
515 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  37.8 
 
 
501 aa  335  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  38.8 
 
 
506 aa  335  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3409  ABC transporter related  39.17 
 
 
508 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  41.25 
 
 
861 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  40.2 
 
 
503 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>