More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01050 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 526 aa  1014    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.552248  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  50.2 
 
 		 513 aa  506  9.999999999999999e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  52.09 
 
 		 526 aa  489  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0277  ABC transporter related  52.69 
 
 		 511 aa  491  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.277921  normal  0.268674 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01030  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  48.93 
 
 		 522 aa  482  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  52.99 
 
 		 507 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  52.86 
 
 		 505 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  48.69 
 
 		 503 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 529 aa  428  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  41.92 
 
 		 510 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5962  ABC transporter related  48.29 
 
 		 503 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0248969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  45.47 
 
 		 504 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5925  ABC transporter related  48.29 
 
 		 504 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737944  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  47.48 
 
 		 504 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6194  ABC transporter related  48.29 
 
 		 504 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  47.48 
 
 		 504 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5517  ABC transporter related  45.4 
 
 		 516 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422457  normal  0.0683787 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  47.48 
 
 		 504 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  47.51 
 
 		 506 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  48.57 
 
 		 505 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2343  ATP binding protein of ABC transporter  48.59 
 
 		 502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4809  ABC transporter related  45.27 
 
 		 549 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173038  hitchhiker  0.00297179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  47.22 
 
 		 507 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  45.81 
 
 		 511 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  43.11 
 
 		 512 aa  402  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  44.13 
 
 		 500 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.46 
 
 		 516 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  43.72 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 500 aa  393  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  43.72 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.93 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  43.72 
 
 		 500 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  46.39 
 
 		 507 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  43.32 
 
 		 500 aa  395  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.93 
 
 		 500 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  43.52 
 
 		 501 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0969  ABC transporter related  42.19 
 
 		 500 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  42.86 
 
 		 500 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  42.86 
 
 		 499 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  42.66 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  41.37 
 
 		 499 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  41.63 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  43.75 
 
 		 525 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  43.75 
 
 		 525 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  41.85 
 
 		 499 aa  378  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0148  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  41.32 
 
 		 496 aa  373  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0476  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  41.52 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4067  ABC transporter related  41.52 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4228  ABC transporter related protein  41.44 
 
 		 506 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1417  ABC transporter related  44.09 
 
 		 515 aa  364  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441776  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  40.36 
 
 		 523 aa  361  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0767  putative sugar uptake ABC transporter ATP-binding protein  41.08 
 
 		 501 aa  355  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  39.57 
 
 		 544 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  41.82 
 
 		 522 aa  344  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  39.17 
 
 		 544 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4767  ABC transporter-related protein  40.81 
 
 		 503 aa  343  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.883977 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  39.27 
 
 		 497 aa  343  5e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 504 aa  338  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  41.09 
 
 		 503 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  43.1 
 
 		 508 aa  336  5e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  44.14 
 
 		 585 aa  336  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  36.38 
 
 		 494 aa  335  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  42.02 
 
 		 514 aa  334  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  41.94 
 
 		 505 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  40.08 
 
 		 514 aa  332  8e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12280  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  42.35 
 
 		 505 aa  332  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171798  normal  0.428152 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.56 
 
 		 518 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  40.47 
 
 		 504 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  40.57 
 
 		 501 aa  331  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.32 
 
 		 505 aa  330  3e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  37.95 
 
 		 503 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  41.7 
 
 		 519 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  34.12 
 
 		 498 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  39.48 
 
 		 513 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  40.29 
 
 		 514 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  35.47 
 
 		 501 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  40.04 
 
 		 503 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.08 
 
 		 512 aa  326  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  33.2 
 
 		 504 aa  326  6e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  40.12 
 
 		 512 aa  326  7e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  40.12 
 
 		 512 aa  326  7e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  37.45 
 
 		 506 aa  325  9e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  36.21 
 
 		 501 aa  325  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  40.37 
 
 		 507 aa  324  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  36.23 
 
 		 500 aa  324  3e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  38.74 
 
 		 497 aa  324  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  37.65 
 
 		 507 aa  323  5e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2447  ABC transporter related protein  37.19 
 
 		 495 aa  323  5e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000548266  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  38.18 
 
 		 506 aa  322  7e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.39 
 
 		 515 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  39.47 
 
 		 513 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.01 
 
 		 519 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  39.18 
 
 		 503 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  37.45 
 
 		 507 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4172  ABC transporter related  38.97 
 
 		 504 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.78 
 
 		 515 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.57 
 
 		 515 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.57 
 
 		 515 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  34.99 
 
 		 496 aa  319  6e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  40.46 
 
 		 520 aa  319  9e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>