More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1417 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  63.96 
 
 
507 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1417  ABC transporter related  100 
 
 
515 aa  1034    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441776  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  63.56 
 
 
507 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  62.48 
 
 
505 aa  606  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  58.88 
 
 
516 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  58.43 
 
 
506 aa  589  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0148  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  57.72 
 
 
496 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4067  ABC transporter related  57.52 
 
 
496 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0476  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  57.52 
 
 
496 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4228  ABC transporter related protein  58.23 
 
 
506 aa  580  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  56.83 
 
 
500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  56.83 
 
 
500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.03 
 
 
500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  57.03 
 
 
500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  56.83 
 
 
500 aa  569  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  56.83 
 
 
500 aa  571  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  56.63 
 
 
500 aa  568  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  56.59 
 
 
500 aa  567  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4767  ABC transporter-related protein  58.94 
 
 
503 aa  555  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.883977 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0969  ABC transporter related  55.08 
 
 
500 aa  557  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  54.88 
 
 
501 aa  558  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  56.49 
 
 
512 aa  552  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  54.34 
 
 
499 aa  530  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  53.94 
 
 
499 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  54.14 
 
 
499 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  54.14 
 
 
499 aa  525  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  54.14 
 
 
500 aa  525  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  53.22 
 
 
503 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0767  putative sugar uptake ABC transporter ATP-binding protein  52.43 
 
 
501 aa  499  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.162932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  51.79 
 
 
505 aa  492  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  51 
 
 
523 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  52.78 
 
 
504 aa  492  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  50.6 
 
 
507 aa  490  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  49.09 
 
 
510 aa  489  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  52.17 
 
 
525 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  52.17 
 
 
525 aa  485  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  51.07 
 
 
511 aa  472  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  51.2 
 
 
506 aa  468  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  49.11 
 
 
526 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01030  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  47.9 
 
 
522 aa  464  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  46.52 
 
 
513 aa  463  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  49.02 
 
 
529 aa  461  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5962  ABC transporter related  48.69 
 
 
503 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0248969 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4809  ABC transporter related  48.62 
 
 
549 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173038  hitchhiker  0.00297179 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  48.19 
 
 
504 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5517  ABC transporter related  48.7 
 
 
516 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422457  normal  0.0683787 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6194  ABC transporter related  48.79 
 
 
504 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  48.39 
 
 
504 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  48.19 
 
 
504 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5925  ABC transporter related  48.59 
 
 
504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737944  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2343  ATP binding protein of ABC transporter  48.89 
 
 
502 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  46.49 
 
 
499 aa  429  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  43.68 
 
 
544 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  43.48 
 
 
544 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  45.86 
 
 
497 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  45.31 
 
 
519 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  39.64 
 
 
585 aa  392  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  44.09 
 
 
526 aa  381  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.552248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  39.6 
 
 
497 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  44.05 
 
 
509 aa  373  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  43.84 
 
 
504 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  42.8 
 
 
519 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  40.85 
 
 
508 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.44 
 
 
518 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  40.45 
 
 
506 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  40.41 
 
 
494 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0277  ABC transporter related  42.35 
 
 
511 aa  366  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.277921  normal  0.268674 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  38.87 
 
 
496 aa  365  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  39.43 
 
 
510 aa  364  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  41.94 
 
 
504 aa  364  2e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6710  ABC transporter, ATP binding subunit (putative high-affinity D-ribose transport)  42.32 
 
 
507 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.11533  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 
496 aa  364  3e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  39.96 
 
 
508 aa  363  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  38.92 
 
 
513 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.96 
 
 
496 aa  363  6e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  39.96 
 
 
496 aa  363  6e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  38.7 
 
 
504 aa  360  3e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  39.29 
 
 
513 aa  360  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  40.32 
 
 
501 aa  360  4e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  39.71 
 
 
503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  40.25 
 
 
495 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  38.57 
 
 
512 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  41.07 
 
 
514 aa  357  3.9999999999999996e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  38.87 
 
 
513 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  38.4 
 
 
514 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  40.82 
 
 
513 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  38.59 
 
 
512 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1134  ABC transporter related  37.3 
 
 
506 aa  355  1e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000497905  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  38.59 
 
 
512 aa  355  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  39.8 
 
 
517 aa  354  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  41.14 
 
 
497 aa  355  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  40 
 
 
507 aa  354  2e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  40.71 
 
 
521 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2010  ABC transporter related  37.22 
 
 
500 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2863  ABC transporter related  40.52 
 
 
518 aa  353  5e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  40.24 
 
 
495 aa  353  5e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 
494 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  38.83 
 
 
512 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  40.25 
 
 
861 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1653  ABC transporter related  41.63 
 
 
519 aa  352  7e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0555167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>