More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4909 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  74.95 
 
 		 507 aa  746    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  74.55 
 
 		 507 aa  744    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  100 
 
 		 505 aa  1009    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  60.2 
 
 		 500 aa  609  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  60.2 
 
 		 500 aa  609  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.57 
 
 		 500 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.2 
 
 		 500 aa  606  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  61.93 
 
 		 506 aa  604  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  60 
 
 		 500 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  60.57 
 
 		 500 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  59.68 
 
 		 501 aa  601  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  60.16 
 
 		 500 aa  600  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4228  ABC transporter related protein  61.52 
 
 		 506 aa  598  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  59.55 
 
 		 500 aa  598  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  63.92 
 
 		 516 aa  595  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  59.41 
 
 		 512 aa  592  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0148  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  60.29 
 
 		 496 aa  592  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0476  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  60.08 
 
 		 496 aa  592  1e-168  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0969  ABC transporter related  59.07 
 
 		 500 aa  593  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4067  ABC transporter related  60.08 
 
 		 496 aa  592  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1417  ABC transporter related  62.48 
 
 		 515 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441776  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4767  ABC transporter-related protein  58.76 
 
 		 503 aa  561  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.883977 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0767  putative sugar uptake ABC transporter ATP-binding protein  54.4 
 
 		 501 aa  536  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  52.17 
 
 		 510 aa  531  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  53.83 
 
 		 499 aa  529  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  52.74 
 
 		 523 aa  525  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  53.82 
 
 		 500 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  53.82 
 
 		 499 aa  526  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  53.24 
 
 		 499 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  53.82 
 
 		 499 aa  523  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  56.93 
 
 		 503 aa  518  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  55.94 
 
 		 507 aa  511  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  55.8 
 
 		 525 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  55.8 
 
 		 525 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  53.31 
 
 		 504 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  53.31 
 
 		 504 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  53.31 
 
 		 504 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  54.64 
 
 		 506 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5962  ABC transporter related  54.25 
 
 		 503 aa  501  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0248969 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6194  ABC transporter related  53.74 
 
 		 504 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  52.97 
 
 		 504 aa  499  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5925  ABC transporter related  53.74 
 
 		 504 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737944  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  55.79 
 
 		 505 aa  495  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5517  ABC transporter related  51.09 
 
 		 516 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422457  normal  0.0683787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4809  ABC transporter related  53.32 
 
 		 549 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173038  hitchhiker  0.00297179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  54.83 
 
 		 511 aa  488  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2343  ATP binding protein of ABC transporter  54.6 
 
 		 502 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  53.63 
 
 		 529 aa  481  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  49.1 
 
 		 513 aa  480  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  50.2 
 
 		 526 aa  460  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01030  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  47.36 
 
 		 522 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  46.65 
 
 		 544 aa  438  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  46.45 
 
 		 544 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  49.49 
 
 		 499 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  48.16 
 
 		 519 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  46.25 
 
 		 497 aa  418  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01050  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  48.57 
 
 		 526 aa  411  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.552248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  42.83 
 
 		 585 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 		 508 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  42.91 
 
 		 495 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  42.65 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  44.53 
 
 		 501 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 494 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 494 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.42 
 
 		 512 aa  385  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 494 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  42.52 
 
 		 494 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.79 
 
 		 494 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  44.86 
 
 		 518 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0277  ABC transporter related  45.82 
 
 		 511 aa  382  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.277921  normal  0.268674 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.45 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  41.72 
 
 		 494 aa  381  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  42.03 
 
 		 514 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.24 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  42.41 
 
 		 504 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  41.99 
 
 		 504 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  42.59 
 
 		 512 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1580  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 		 505 aa  378  1e-103  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.598954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  43.34 
 
 		 523 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  42.39 
 
 		 513 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  42.59 
 
 		 512 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  42.39 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  41.72 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  42.51 
 
 		 525 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  41.12 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 		 496 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  44.13 
 
 		 519 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  41.03 
 
 		 494 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  41.85 
 
 		 513 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  40.34 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  38.77 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1711  ABC transporter related  41.83 
 
 		 517 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318504 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  40.86 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  43.68 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  40.86 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  46.33 
 
 		 509 aa  372  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  45.47 
 
 		 504 aa  371  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  40.89 
 
 		 502 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  43.55 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>