More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0414 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0414  ABC transporter related protein  100 
 
 
283 aa  548  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  43.95 
 
 
269 aa  207  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  40.39 
 
 
266 aa  193  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  44.06 
 
 
264 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  39.84 
 
 
275 aa  185  7e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  36.4 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  38.4 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  39.04 
 
 
275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  36.47 
 
 
262 aa  181  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  38.91 
 
 
409 aa  181  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  39.44 
 
 
274 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  39.44 
 
 
274 aa  181  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3549  ABC transporter-related protein  43.23 
 
 
271 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0341647  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  41.34 
 
 
536 aa  175  6e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3617  ABC transporter related  42.7 
 
 
270 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  36.08 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.3 
 
 
625 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3639  ABC transporter related  38.34 
 
 
269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395378  normal  0.0643524 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3466  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  43.08 
 
 
269 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39496  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0427  ABC transporter related  39.84 
 
 
285 aa  172  7.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0556  ABC transporter related  36.48 
 
 
264 aa  171  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2494  ABC transporter related  39.04 
 
 
268 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.347402 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  37.04 
 
 
405 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  34.63 
 
 
268 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  34.09 
 
 
269 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  34.09 
 
 
269 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  32.78 
 
 
268 aa  169  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  38.91 
 
 
285 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  45.68 
 
 
271 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  37.25 
 
 
261 aa  168  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  33.73 
 
 
418 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  41.98 
 
 
260 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  40.31 
 
 
270 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3732  ABC transporter related protein  36.51 
 
 
276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2511  ABC transporter related  45.19 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  32.42 
 
 
253 aa  166  5e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3149  ABC transporter related  41.11 
 
 
271 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0281771  hitchhiker  0.00000000506205 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1324  ABC transporter related  37.7 
 
 
265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.179649  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  32.42 
 
 
253 aa  165  9e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  29.96 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  37.55 
 
 
264 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  41.2 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  45.31 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  44.44 
 
 
271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1495  ABC transporter related  37.2 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1762  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  32.42 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  38.93 
 
 
255 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  37.65 
 
 
255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  38.55 
 
 
255 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  38.04 
 
 
269 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  34.98 
 
 
268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20790  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  39.13 
 
 
258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.465505  normal  0.0251989 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  35.32 
 
 
266 aa  162  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  36.05 
 
 
268 aa  162  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  38.78 
 
 
261 aa  161  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.61 
 
 
253 aa  161  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  34.42 
 
 
267 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5078  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.9 
 
 
270 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04610  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  38.31 
 
 
253 aa  160  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.280453 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  41.46 
 
 
260 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  30.53 
 
 
260 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  42.08 
 
 
271 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  35.77 
 
 
424 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  38.02 
 
 
256 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2417  ABC transporter-like protein  34.12 
 
 
274 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1512  ABC transporter-related protein  36.47 
 
 
419 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  29.96 
 
 
266 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  39.06 
 
 
266 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 
259 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6474  ABC transporter related  37.08 
 
 
269 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.820871  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  38.28 
 
 
490 aa  159  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  42.86 
 
 
260 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  37.73 
 
 
272 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  38.82 
 
 
418 aa  159  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  39.77 
 
 
414 aa  159  5e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2816  ABC transporter related protein  39.2 
 
 
263 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5504  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.1 
 
 
270 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  34.31 
 
 
255 aa  158  7e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5447  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.1 
 
 
270 aa  158  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.753542  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2188  ABC transporter related  38.52 
 
 
257 aa  158  8e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  38.17 
 
 
255 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.11 
 
 
258 aa  158  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0840  ABC transporter related  41.22 
 
 
271 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5510  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.1 
 
 
270 aa  158  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5230  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  35.1 
 
 
270 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5061  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.1 
 
 
270 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2174  ABC transporter related protein  40.23 
 
 
279 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0314438  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4781  ABC cobalamin/Fe3+- siderophore transporter, ATPase subunit  40.61 
 
 
282 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124562  normal  0.330442 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  36.92 
 
 
260 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6719  ABC transporter related  35.95 
 
 
259 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000596509  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5629  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  35.1 
 
 
270 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5559  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.1 
 
 
270 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3932  ABC transporter related  35.8 
 
 
271 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1142  ABC transporter related  38.91 
 
 
255 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5473  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.1 
 
 
270 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  34.85 
 
 
266 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  34.85 
 
 
266 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4042  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
257 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  34.85 
 
 
266 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5174  ABC transporter related  35.1 
 
 
270 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>