More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1369 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1369  ABC transporter related  100 
 
 		 240 aa  451  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141351  normal  0.11041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2334  ABC transporter related protein  55.66 
 
 		 232 aa  206  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00373453  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2303  ABC transporter related protein  56.56 
 
 		 228 aa  205  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  hitchhiker  0.00211545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1601  ABC transporter related  51.68 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23410  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.14 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.166652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3779  ABC transporter related  52.22 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4898  ABC transporter related  43.24 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000896239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4423  ABC transporter related  43.02 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.993853  normal  0.857227 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  30.95 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1506  ABC transporter related protein  45.18 
 
 		 258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4328  ABC transporter related  36.6 
 
 		 318 aa  111  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.786292 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2278  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  27.62 
 
 		 256 aa  111  9e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2062  heme exporter protein CcmA  47.15 
 
 		 205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569996  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  39.36 
 
 		 360 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0373  ABC transporter, ATP-binding protein  29.05 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1924  ABC transporter related  27.01 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1890  ABC transporter related  27.01 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.670859  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1745  ABC transporter, ATPase subunit  37.71 
 
 		 322 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0815  ABC transporter-related protein  28.42 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04080  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  35.85 
 
 		 316 aa  107  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1152  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  29.47 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0963  ABC transporter related  29.47 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0979  ABC transporter ATP-binding protein EcsA  29.47 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0968  ABC transporter, ATP-binding protein  29.47 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0958  ABC transporter, ATP-binding protein  29.47 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  35.98 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1048  ABC transporter ATP-binding protein  29.47 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1213  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  29.47 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4163  ABC transporter related  35.75 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  0.351966 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1125  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  29.47 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1084  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  29.47 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3690  ABC transporter related  35.75 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4220  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  29.47 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.183421  normal  0.0669124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2050  ABC transporter related  37.57 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.492019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1861  ABC transporter related  35.35 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00288336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0253  ABC transporter related  29.72 
 
 		 288 aa  105  5e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  35.55 
 
 		 312 aa  105  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.22 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  37.55 
 
 		 832 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  36.65 
 
 		 345 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  39.69 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  39.69 
 
 		 309 aa  105  7e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1372  ABC transporter, ATP-binding protein  25.12 
 
 		 246 aa  105  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00133001  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0053  ABC transporter related  35.75 
 
 		 326 aa  105  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  29.52 
 
 		 288 aa  105  9e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0056  ABC transporter related  36 
 
 		 326 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6773  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.41 
 
 		 363 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78331  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  30.52 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2546  ABC transporter related  37.44 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587605  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  33.53 
 
 		 340 aa  104  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1262  ABC transporter related  28.91 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000313912  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3724  ABC transporter related  35.42 
 
 		 328 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  33.64 
 
 		 339 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  35.92 
 
 		 365 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  35.84 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3424  ABC transporter related  34.9 
 
 		 328 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  36.21 
 
 		 315 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  38.33 
 
 		 355 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1566  ABC transporter related  32.42 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000343962  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3307  ABC transporter related  37.37 
 
 		 350 aa  102  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  36.7 
 
 		 344 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0320  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 382 aa  102  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  35.58 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1530  ABC transporter related  28.08 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.653437  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  38.97 
 
 		 357 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  34.47 
 
 		 303 aa  102  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  32.34 
 
 		 323 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0375  sugar ABC transporter ATP-binding protein  36.41 
 
 		 364 aa  102  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.445668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2188  ABC transporter related  35.45 
 
 		 331 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321359  normal  0.0854414 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  36.7 
 
 		 328 aa  102  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  32.99 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0160  ABC transporter related  31.34 
 
 		 272 aa  101  8e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.609677 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0645  ABC transporter related  26.67 
 
 		 245 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2055  export ABC transporter ATP-binding protein  31.09 
 
 		 312 aa  101  9e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.35923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  31.22 
 
 		 294 aa  101  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  36.7 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0147  ABC transporter, ATP-binding protein  31.09 
 
 		 309 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000626362  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1075  ATPase  40.31 
 
 		 324 aa  100  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.243658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  35.92 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  34.1 
 
 		 308 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  35.92 
 
 		 342 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  36.7 
 
 		 326 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  31.45 
 
 		 323 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.12 
 
 		 337 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.36 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  36.7 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  34.1 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  33.64 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0339  ABC transporter related  35.44 
 
 		 364 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.835031  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.07 
 
 		 354 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2873  ABC transporter related  39.51 
 
 		 353 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.204327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  33.82 
 
 		 326 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  36.55 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3901  ABC transporter related  31.28 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.292154  normal  0.145575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  39.61 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  31.75 
 
 		 398 aa  99.8  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  34.47 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3136  ABC transporter related  33.64 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  35.79 
 
 		 691 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>