More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1297 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1297  ABC transporter related  100 
 
 		 238 aa  483  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0328127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0329  ABC transporter related  32.91 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  36.51 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0699  ABC transporter related  31.31 
 
 		 356 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0789  ABC transporter related  30.58 
 
 		 360 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0872  ABC transporter related  32.99 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0610304 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  32.56 
 
 		 306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3258  ABC transporter related protein  29.65 
 
 		 307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335184  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3024  ABC transporter related  30.81 
 
 		 338 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851155  normal  0.0538989 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2329  ABC transporter-like protein  25 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.613206 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  33.17 
 
 		 273 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  34.6 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2275  ABC transporter related protein  29.8 
 
 		 371 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  32.24 
 
 		 325 aa  112  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  30.19 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  32.09 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  29.87 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1335  ABC transporter related  31.98 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.434396  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  30.66 
 
 		 243 aa  111  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  32.09 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  30.04 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  29.64 
 
 		 289 aa  109  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4339  ABC-type transport system, ATPase component  27.4 
 
 		 305 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  27.97 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  29.72 
 
 		 336 aa  108  8.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  30.2 
 
 		 295 aa  106  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  27.01 
 
 		 305 aa  105  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  28.9 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  29.25 
 
 		 292 aa  105  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  27.01 
 
 		 326 aa  105  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  29 
 
 		 241 aa  105  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  31.13 
 
 		 321 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4939  ABC transporter related  28.21 
 
 		 334 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0242124 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  31.51 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0435  ABC transporter related  26.81 
 
 		 328 aa  103  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.490211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  29.76 
 
 		 296 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2612  ABC transporter related protein  29.03 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.472941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  30.7 
 
 		 328 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3142  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  28.44 
 
 		 361 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  29.57 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_002950  PG0628  ABC transporter, ATP-binding protein  31.22 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.263801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  27.83 
 
 		 298 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1523  ABC transporter related  31.43 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.667428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  33.17 
 
 		 286 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1845  ABC transporter related  31.36 
 
 		 220 aa  102  8e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.115233  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0320  ABC transporter related protein  28.17 
 
 		 382 aa  101  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.362306  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  27.08 
 
 		 253 aa  100  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  30.38 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  29.39 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  26.58 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  25.94 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  28.44 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1499  ABC transporter related  31.79 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  24.07 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  27.96 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  30.09 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0763  ABC transporter related  29.38 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1733  ABC transporter, ATP-binding protein  27.36 
 
 		 337 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000359777 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  28.05 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  26.78 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  28.3 
 
 		 311 aa  99.4  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  27.01 
 
 		 302 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  28.05 
 
 		 294 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0784  ABC transporter related protein  39.01 
 
 		 285 aa  99.4  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.217947  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  24.68 
 
 		 326 aa  99  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  28.37 
 
 		 308 aa  99.4  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  28.63 
 
 		 304 aa  99  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  30.77 
 
 		 305 aa  99  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0667  ABC transporter related  35.08 
 
 		 317 aa  99  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.747248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  28.11 
 
 		 294 aa  98.6  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1454  ABC transporter related  31.28 
 
 		 238 aa  99  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  29.36 
 
 		 305 aa  98.6  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  30.26 
 
 		 667 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2112  ABC transporter related protein  29.83 
 
 		 275 aa  98.6  9e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.702727  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  26.54 
 
 		 302 aa  98.6  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  30.64 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  28.02 
 
 		 292 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  27.65 
 
 		 308 aa  97.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1620  ABC transporter, ATP-binding protein  26.89 
 
 		 337 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  30.09 
 
 		 328 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  27.62 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  30.05 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2046  ABC transporter, ATP-binding protein  26.89 
 
 		 337 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000987436 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2127  ABC transporter related  28.97 
 
 		 337 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0500595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  28.31 
 
 		 321 aa  98.2  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01398  predicted spermidine/putrescine transporter subunit  26.89 
 
 		 337 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2205  ABC transporter related protein  26.89 
 
 		 337 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0635476  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1021  ABC transporter related  26.96 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00128788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  28.51 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0350  ABC transporter related  29.2 
 
 		 303 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  27.62 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  28.32 
 
 		 651 aa  97.1  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  28.05 
 
 		 294 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1525  ABC transporter, ATP-binding protein  26.89 
 
 		 337 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01409  hypothetical protein  26.89 
 
 		 337 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2218  ABC transporter related  26.89 
 
 		 337 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  29.17 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1233  ABC transporter related  29.03 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.954644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1694  ABC transporter related  29.86 
 
 		 299 aa  96.7  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  28.05 
 
 		 294 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>