More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4939 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4939  ABC transporter related  100 
 
 		 334 aa  661    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0242124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4339  ABC-type transport system, ATPase component  55.37 
 
 		 305 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2612  ABC transporter related protein  56.05 
 
 		 314 aa  301  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.472941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3024  ABC transporter related  42.21 
 
 		 338 aa  218  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851155  normal  0.0538989 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0292  ABC transporter related  32.7 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.274701  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2275  ABC transporter related protein  38.08 
 
 		 371 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2329  ABC transporter-like protein  43.14 
 
 		 301 aa  193  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.613206 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0699  ABC transporter related  37.22 
 
 		 356 aa  189  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.81 
 
 		 309 aa  189  5e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0789  ABC transporter related  35.4 
 
 		 360 aa  189  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1335  ABC transporter related  35.28 
 
 		 316 aa  189  8e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.434396  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  38.49 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3629  ABC transporter related  37.97 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00141619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.45 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  37.26 
 
 		 316 aa  176  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  38.34 
 
 		 314 aa  175  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3258  ABC transporter related protein  40.17 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335184  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  35.47 
 
 		 334 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  36.93 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  37.78 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0632  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.94 
 
 		 318 aa  170  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0872  ABC transporter related  44.76 
 
 		 229 aa  169  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0610304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  32.9 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  38.06 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0987  ABC transporter-like protein  35.43 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.488285  normal  0.723293 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0458  ABC transporter related protein  33.54 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.3 
 
 		 321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  35.78 
 
 		 306 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  35.78 
 
 		 306 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  35.99 
 
 		 314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  33.12 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0667  ABC transporter related  30.51 
 
 		 317 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.747248  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.03 
 
 		 312 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1145  ABC transporter related protein  31.21 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  40.98 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  36.43 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  35.12 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  33.55 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  34.52 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.49 
 
 		 334 aa  159  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0329  ABC transporter related  35.04 
 
 		 242 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  34.95 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  35.27 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1715  ABC transporter related  35.53 
 
 		 308 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.409646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  34.25 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  34.48 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  33.23 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  32.92 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0477  ABC transporter related  35.78 
 
 		 308 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330496  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  36 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.27 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.17 
 
 		 313 aa  157  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.87 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  33.86 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  35.56 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  36.33 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4410  ABC transporter related  34.08 
 
 		 307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.84 
 
 		 330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.49 
 
 		 338 aa  155  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  32.05 
 
 		 327 aa  156  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.89 
 
 		 337 aa  155  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  36.02 
 
 		 252 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 318 aa  155  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  31.51 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.95 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  34.41 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  34.63 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0869  ABC transporter related  36.12 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.348691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4655  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.82 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  31.51 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0638  ABC-A-subfamily transporter  38.34 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.541118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03370  ABC transporter, ATP binding component  41.04 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372663  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2020  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.54 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  33.76 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  33.11 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.33 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  32.79 
 
 		 305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  34.73 
 
 		 319 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  32.46 
 
 		 305 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0448  ABC transporter related  33.33 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.27 
 
 		 324 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  32.26 
 
 		 304 aa  152  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  31.4 
 
 		 321 aa  152  7e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  31.89 
 
 		 305 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  34.16 
 
 		 318 aa  152  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  33.76 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0862  ABC transporter related  34.39 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0153083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.66 
 
 		 345 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  34.5 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  34.5 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  35.2 
 
 		 316 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  33.76 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  34.47 
 
 		 295 aa  152  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  35.24 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  41.01 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  35.33 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.57 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1123  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.22 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0523  ABC transporter, ATP-binding protein  38.18 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000509478 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.09 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>