More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0987 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0987  ABC transporter-like protein  100 
 
 		 305 aa  618  1e-176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.488285  normal  0.723293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2329  ABC transporter-like protein  39.87 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.613206 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1335  ABC transporter related  36.21 
 
 		 316 aa  192  8e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.434396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4339  ABC-type transport system, ATPase component  37.06 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2612  ABC transporter related protein  39.74 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.472941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2275  ABC transporter related protein  40.17 
 
 		 371 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4939  ABC transporter related  35.43 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0242124 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0699  ABC transporter related  35.99 
 
 		 356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  40.19 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  41.15 
 
 		 328 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.1 
 
 		 305 aa  155  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1411  ABC-type transport system, ATPase component  29.49 
 
 		 317 aa  155  8e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000715833  unclonable  3.14e-28 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  33.11 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0869  ABC transporter related  37.17 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.348691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  38.5 
 
 		 314 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  37.3 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.44 
 
 		 305 aa  149  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  35.57 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  36.89 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  37.33 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3024  ABC transporter related  36.82 
 
 		 338 aa  146  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0851155  normal  0.0538989 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  34.01 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  35.94 
 
 		 306 aa  143  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  31.7 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2832  ABC transporter, ATPase subunit  34.22 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1004  ABC transporter, ATP-binding protein  30.79 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  35.29 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  35.32 
 
 		 307 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0789  ABC transporter related  30.99 
 
 		 360 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  34.26 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.44 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.59 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  37.44 
 
 		 338 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  36.6 
 
 		 309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.31 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1079  ABC transporter related protein  34.27 
 
 		 325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03556  ABC transporter, ATP-binding protein  33 
 
 		 310 aa  139  6e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.333209  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  37.39 
 
 		 293 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0217  ABC transporter related  31.93 
 
 		 310 aa  139  7.999999999999999e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.701871 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  35.51 
 
 		 305 aa  138  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0458  ABC transporter related protein  34.82 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0455  hypothetical protein  33.55 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0431  hypothetical protein  33.55 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  37.95 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3141  ABC transporter-related protein  33.89 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  34.39 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3258  ABC transporter related protein  34.31 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335184  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  36.77 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  26.67 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10190  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.84 
 
 		 310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086698  normal  0.0445434 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1983  ABC transporter related  33.45 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.063118  normal  0.0186324 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  31.76 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  27.62 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  33.18 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  34.96 
 
 		 252 aa  136  5e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  26.67 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  26.86 
 
 		 312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  32.91 
 
 		 300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  26.67 
 
 		 312 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  26.67 
 
 		 312 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  32.64 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  32.46 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  30.18 
 
 		 312 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  26.67 
 
 		 312 aa  135  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  28.43 
 
 		 311 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  30.18 
 
 		 312 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3927  ABC transporter related  32.89 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  33.33 
 
 		 241 aa  135  9e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  32.77 
 
 		 312 aa  135  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  32.57 
 
 		 319 aa  135  9e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3855  ABC transporter, ATP-binding protein  31.67 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  32.27 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  34.54 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  30.38 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3736  Na+ extrusion transport system ATP-binding protein  35.44 
 
 		 249 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  38.24 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  36.8 
 
 		 320 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1806  ABC transporter related  41.63 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.802258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  34.21 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0848  ABC-type multidrug transport system, ATP-binding protein  29.7 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.652188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  36.87 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1919  ABC transporter related  34.6 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00224779  normal  0.302439 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3909  ABC transporter-related protein  32.78 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  35.04 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  36.28 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  34.98 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  33.88 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  31.95 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  39.9 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  32.27 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  35.11 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  37.09 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  31.07 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  30.41 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1024  ABC transporter related  32.24 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.258701  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.07 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  31.82 
 
 		 243 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>