More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1066 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  77.38 
 
 		 222 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1195  putative biotin ABC transporter, ATP-binding protein BioM  48.17 
 
 		 226 aa  217  1e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0503  ABC transporter related  48.2 
 
 		 226 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.182722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  47.73 
 
 		 226 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3686  ABC transporter related  47.71 
 
 		 221 aa  204  8e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3688  ABC transporter component  48.9 
 
 		 233 aa  202  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296687  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0583  ABC transporter related  48.2 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1007  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (cobalt)  48.88 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4655  ABC transporter related  46.64 
 
 		 226 aa  195  7e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  48.31 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1731  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0624  ABC transporter related  47.75 
 
 		 224 aa  188  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693625  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3227  ABC transporter-related protein  45.95 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1331  ABC transporter component  48.77 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0505  ABC transporter related protein  45.83 
 
 		 226 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5457  cobalt import ATP-binding protein CbiO  47.62 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00770643  normal  0.0928666 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1854  ABC transporter related  45.61 
 
 		 248 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000267672 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2112  ABC transporter related  46.7 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0676664  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3463  ABC transporter related  43.95 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5280  ABC transporter related  46.64 
 
 		 232 aa  174  8e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5369  ABC transporter related  46.64 
 
 		 232 aa  174  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5659  ABC transporter related  46.19 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2313  ABC-type cobalt transport system ATPase component  41.26 
 
 		 227 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01750  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  45.7 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3074  ABC transporter related protein  43.27 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21850  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  43 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0432737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1680  ABC transporter related protein  47.37 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2318  ABC transporter related  41.55 
 
 		 247 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2175  ABC transporter, ATPase subunit  41.94 
 
 		 246 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.358112  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4130  ABC transporter related protein  40.69 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85696  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0847  ABC transporter related  41.01 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1158  ABC transporter related  41.07 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.66 
 
 		 281 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2003  ABC transporter related  42.2 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.95 
 
 		 277 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3350  ABC transporter related  44 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.93 
 
 		 284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4599  ABC transporter related  37.74 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530303 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0631  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.65 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.103866  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  37.39 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2126  ABC transporter related  45.86 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0584803  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.89 
 
 		 281 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.89 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  40.72 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0692  ABC transporter related  36.79 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0161  ABC transporter related  40.33 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  45.4 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.56 
 
 		 403 aa  135  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  35.94 
 
 		 278 aa  135  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  37.06 
 
 		 398 aa  135  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1938  ABC transporter related  42.47 
 
 		 273 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0572135 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.5 
 
 		 402 aa  135  8e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.92 
 
 		 278 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  41.79 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2912  ABC transporter related  43.66 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  35.58 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.44 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2321  ABC transporter related  39.81 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.89 
 
 		 277 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.05 
 
 		 270 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  36.62 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  36.45 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1538  ABC transporter related  39.35 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0887  ABC transporter related protein  37.17 
 
 		 241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.754579  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1368  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  35 
 
 		 303 aa  132  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1324  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1193  ATPase  38.89 
 
 		 243 aa  132  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.076328  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  36.5 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.1 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.96 
 
 		 310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0830  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.45 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11110  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.89 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0035018  normal  0.0238039 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.81 
 
 		 277 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.69 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5031  ABC transporter related  34.7 
 
 		 269 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  38.1 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.5 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.56 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1153  ABC transporter related protein  37.69 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00125653  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.69 
 
 		 253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.29 
 
 		 267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2633  ABC transporter component  43.56 
 
 		 218 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3433  hypothetical protein  46.63 
 
 		 214 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.629193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  36.6 
 
 		 593 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1756  cobalt transport protein ATP-binding subunit  34.2 
 
 		 274 aa  128  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3138  ABC transporter related  42.94 
 
 		 221 aa  128  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227859  normal  0.759811 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0225  ABC transporter related  38.5 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.758643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.98 
 
 		 403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  33.04 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3137  ABC transporter related  42.39 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2472  ABC transporter related  38.69 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  36.59 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0288  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.11 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337056  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0650  ABC transporter related protein  33.01 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  37.86 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2019  ABC transporter-related protein  40.31 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000148673  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  39.15 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0499  ABC transporter related  42.11 
 
 		 271 aa  126  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.594452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>