More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1455 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  100 
 
 
275 aa  551  1e-156  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0225  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  49.63 
 
 
272 aa  263  3e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0288  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.69 
 
 
277 aa  260  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337056  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  47.04 
 
 
277 aa  255  6e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.27 
 
 
280 aa  254  8e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.27 
 
 
280 aa  254  8e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.27 
 
 
279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0318  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.96 
 
 
285 aa  252  5.000000000000001e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.84205e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.86 
 
 
300 aa  251  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.86 
 
 
300 aa  252  6e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.9 
 
 
280 aa  251  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.9 
 
 
280 aa  251  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0830  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  47.57 
 
 
280 aa  251  9.000000000000001e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.9 
 
 
280 aa  250  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.49 
 
 
300 aa  249  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  47.23 
 
 
272 aa  249  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.9 
 
 
280 aa  249  5e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.52 
 
 
280 aa  248  7e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.78 
 
 
280 aa  247  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0136  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.63 
 
 
279 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.15 
 
 
280 aa  244  9e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000287993  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.83 
 
 
276 aa  242  6e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.56 
 
 
267 aa  241  1e-62  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.76 
 
 
277 aa  237  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  44.78 
 
 
276 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl152  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.28 
 
 
406 aa  226  2e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  44.32 
 
 
273 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  44.32 
 
 
273 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0631  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.8 
 
 
294 aa  223  2e-57  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.103866  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2249  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 
269 aa  222  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2290  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 
269 aa  222  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  42.65 
 
 
277 aa  221  8e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1803  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 
269 aa  219  3e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.24 
 
 
281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  43.53 
 
 
281 aa  218  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  42.58 
 
 
299 aa  216  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1419  ABC transporter related  40.67 
 
 
273 aa  211  9e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  41.7 
 
 
303 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.35 
 
 
286 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 
285 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  41.7 
 
 
278 aa  205  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0668  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.05 
 
 
408 aa  202  4e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1153  ABC transporter related protein  41.04 
 
 
277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00125653  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0225  ABC transporter related  41.7 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.758643 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.55 
 
 
310 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  37.5 
 
 
288 aa  194  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  34.83 
 
 
283 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  34.83 
 
 
283 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  39.46 
 
 
290 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12560  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.55 
 
 
283 aa  193  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2302  putative ABC transporter  42.8 
 
 
273 aa  192  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0179898  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0585  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.35 
 
 
274 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0623  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.78 
 
 
267 aa  186  3e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.924789  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.41 
 
 
281 aa  186  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  38.83 
 
 
277 aa  185  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0999  ABC transporter related  37.87 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0187687  normal  0.71455 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.04 
 
 
284 aa  183  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24060  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.91 
 
 
278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.569983  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  38.52 
 
 
398 aa  182  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0137  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.84 
 
 
290 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  37.82 
 
 
557 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.41 
 
 
244 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  39.23 
 
 
280 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  43.69 
 
 
250 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  36.78 
 
 
325 aa  179  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  37.25 
 
 
258 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  39.67 
 
 
254 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.68 
 
 
278 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0141  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.89 
 
 
291 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000352159  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  36.68 
 
 
286 aa  178  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0829  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.45 
 
 
292 aa  178  7e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.773526  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 
453 aa  178  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2150  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.79 
 
 
280 aa  177  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.79 
 
 
257 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.3 
 
 
285 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  37.45 
 
 
276 aa  176  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.36 
 
 
253 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24070  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.61 
 
 
305 aa  175  6e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.850026  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  37.19 
 
 
568 aa  175  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2428  ABC transporter related  36.17 
 
 
283 aa  174  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105598  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.9 
 
 
285 aa  175  9e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.69 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.17 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.89 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0171  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.98 
 
 
293 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000671668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0161  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.36 
 
 
293 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2472  ABC transporter related  35.42 
 
 
284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324345  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.29 
 
 
277 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  38.7 
 
 
246 aa  172  5.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  37.92 
 
 
574 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.98 
 
 
293 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0875323  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5165  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.6 
 
 
293 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000192836  hitchhiker  0.000000000000102962 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.6 
 
 
293 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.6 
 
 
293 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.168047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.6 
 
 
293 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000645208  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.77 
 
 
280 aa  171  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.51 
 
 
395 aa  170  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.52 
 
 
277 aa  169  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12570  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.59 
 
 
344 aa  169  4e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  37.39 
 
 
242 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>