More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2934 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  100 
 
 		 299 aa  608  1e-173  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  59.43 
 
 		 281 aa  346  2e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  60.24 
 
 		 303 aa  335  5e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  55.16 
 
 		 281 aa  328  5.0000000000000004e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  56.23 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  54.91 
 
 		 273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  54.91 
 
 		 273 aa  303  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0225  ABC transporter related  50.91 
 
 		 282 aa  290  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.758643 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  52.42 
 
 		 272 aa  280  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  47.5 
 
 		 277 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1419  ABC transporter related  47.08 
 
 		 273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.54 
 
 		 280 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000287993  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0288  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.44 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  46.57 
 
 		 278 aa  258  7e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.01 
 
 		 280 aa  256  5e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.14 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.14 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.14 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0136  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.37 
 
 		 279 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.14 
 
 		 280 aa  252  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.14 
 
 		 280 aa  252  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.14 
 
 		 300 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.14 
 
 		 300 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.14 
 
 		 300 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  48.85 
 
 		 276 aa  250  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.19 
 
 		 276 aa  250  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.97 
 
 		 280 aa  249  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.97 
 
 		 280 aa  248  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24060  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  46.33 
 
 		 278 aa  246  2e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.569983  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.04 
 
 		 279 aa  244  9e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0999  ABC transporter related  47.15 
 
 		 273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0187687  normal  0.71455 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  46.04 
 
 		 277 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1153  ABC transporter related protein  48.13 
 
 		 277 aa  236  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00125653  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0318  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.25 
 
 		 285 aa  235  7e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.84205e-21 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  41.75 
 
 		 290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  44.98 
 
 		 276 aa  233  3e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.86 
 
 		 277 aa  233  4.0000000000000004e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  41.05 
 
 		 283 aa  232  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.21 
 
 		 285 aa  232  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  41.05 
 
 		 283 aa  232  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2472  ABC transporter related  43.88 
 
 		 284 aa  231  9e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324345  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12560  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  44.7 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.01 
 
 		 278 aa  227  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1962  ABC transporter, ATPase subunit  46.25 
 
 		 269 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.91 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.64 
 
 		 286 aa  222  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.96 
 
 		 278 aa  221  8e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2302  putative ABC transporter  41.37 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0179898  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0225  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.14 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0585  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.98 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.64 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.43 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  42.58 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.96 
 
 		 267 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1700  ABC transporter related  46.06 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  43.19 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0246  ABC transporter related  44.62 
 
 		 283 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2249  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.7 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.284628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2290  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.7 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  40.52 
 
 		 286 aa  206  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.5 
 
 		 277 aa  205  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 398 aa  205  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2428  ABC transporter related  38.08 
 
 		 283 aa  205  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.5 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.52 
 
 		 284 aa  202  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.86 
 
 		 285 aa  202  4e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.86 
 
 		 285 aa  203  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.07 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  38.79 
 
 		 288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.57 
 
 		 280 aa  200  3e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0830  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.81 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1418  ABC transporter related  39.72 
 
 		 287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0137  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.15 
 
 		 290 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.25 
 
 		 281 aa  198  7e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.68 
 
 		 288 aa  198  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  41.6 
 
 		 605 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  37.54 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.31 
 
 		 440 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0631  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.83 
 
 		 294 aa  196  5.000000000000001e-49  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.103866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0141  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.83 
 
 		 291 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000352159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0317  ABC transporter related  39.05 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000872921  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2150  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.43 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl152  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.4 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  38.97 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  39.72 
 
 		 574 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  38.87 
 
 		 568 aa  192  8e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.54 
 
 		 402 aa  192  8e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.06 
 
 		 395 aa  192  8e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1803  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.34 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  42.08 
 
 		 630 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.13 
 
 		 284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.86 
 
 		 456 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.37 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0829  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.37 
 
 		 292 aa  189  7e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.773526  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  48.56 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.62 
 
 		 281 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 		 257 aa  186  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  39.08 
 
 		 380 aa  185  7e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 279 aa  185  9e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>