More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2149 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
453 aa  922    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  66.13 
 
 
440 aa  616  1e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  63.62 
 
 
456 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.6 
 
 
395 aa  385  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
411 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  41.81 
 
 
398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.84 
 
 
403 aa  333  4e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.09 
 
 
402 aa  332  1e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  40.75 
 
 
380 aa  313  5.999999999999999e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.85 
 
 
403 aa  311  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  53.41 
 
 
281 aa  300  4e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  55.34 
 
 
278 aa  299  8e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  57.77 
 
 
281 aa  295  9e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  56.35 
 
 
278 aa  295  1e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  53.75 
 
 
281 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.91 
 
 
283 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  47.76 
 
 
284 aa  273  5.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.79 
 
 
276 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.77 
 
 
541 aa  269  7e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  46.86 
 
 
283 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2734  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.55 
 
 
285 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  50.42 
 
 
285 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  50 
 
 
285 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.99 
 
 
271 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.53 
 
 
277 aa  243  5e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.75 
 
 
277 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.97 
 
 
277 aa  239  9e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.5 
 
 
288 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.08 
 
 
285 aa  236  9e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.92 
 
 
284 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.75 
 
 
310 aa  232  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.39 
 
 
276 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0930  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.93 
 
 
272 aa  226  9e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.064976  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 
284 aa  225  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.47 
 
 
286 aa  223  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.54 
 
 
281 aa  223  6e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 
249 aa  223  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 
249 aa  223  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000284786  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  43.62 
 
 
249 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.37 
 
 
271 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.39 
 
 
250 aa  221  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  39.62 
 
 
291 aa  218  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.22 
 
 
243 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.62 
 
 
266 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  42.39 
 
 
252 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.19 
 
 
252 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.93 
 
 
270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.37 
 
 
270 aa  212  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  39.75 
 
 
263 aa  212  1e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.6 
 
 
257 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  46.4 
 
 
271 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1706  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.2 
 
 
267 aa  210  4e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.25 
 
 
243 aa  209  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.29 
 
 
279 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.6 
 
 
253 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  42.15 
 
 
254 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1548  ABC transporter related  38.37 
 
 
280 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472949  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.77 
 
 
255 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.02 
 
 
259 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.62 
 
 
273 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1756  cobalt transport protein ATP-binding subunit  39.43 
 
 
274 aa  206  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.15 
 
 
254 aa  206  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2132  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.84 
 
 
261 aa  204  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  40.34 
 
 
258 aa  204  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.18 
 
 
250 aa  203  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.35 
 
 
277 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  39 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 
259 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0289  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.49 
 
 
288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0412656  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.28 
 
 
244 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2790  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.4 
 
 
305 aa  200  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  41.92 
 
 
299 aa  201  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.08 
 
 
274 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  37.31 
 
 
288 aa  199  6e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  42.44 
 
 
246 aa  199  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1273  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.66 
 
 
247 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.34 
 
 
246 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.72 
 
 
283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.201845  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3889  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.74 
 
 
278 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1759  ABC transporter related  41.67 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.807562  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0475  cobalt transport protein ATP-binding subunit  41.8 
 
 
280 aa  197  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  41.67 
 
 
283 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  41.67 
 
 
283 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.56 
 
 
244 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2150  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.07 
 
 
280 aa  196  7e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  40.17 
 
 
242 aa  196  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3805  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.32 
 
 
278 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4179  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.85 
 
 
282 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.968728  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0715  ABC transporter related  40.59 
 
 
237 aa  194  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.33 
 
 
264 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  40.57 
 
 
325 aa  193  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  40.51 
 
 
277 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  41.47 
 
 
272 aa  192  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.62 
 
 
270 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  39.71 
 
 
276 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  42.97 
 
 
281 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  39.57 
 
 
273 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.41 
 
 
285 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0540  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.85 
 
 
279 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.85 
 
 
280 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>