More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1219 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
456 aa  925    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  63.62 
 
 
453 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  59.82 
 
 
440 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.88 
 
 
395 aa  372  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.92 
 
 
403 aa  349  5e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.98 
 
 
402 aa  334  2e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  41.45 
 
 
398 aa  330  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.32 
 
 
411 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  39.58 
 
 
380 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.88 
 
 
403 aa  302  9e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  53.15 
 
 
278 aa  290  3e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  54.07 
 
 
281 aa  285  9e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  54.47 
 
 
281 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  51.97 
 
 
278 aa  282  9e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  54.15 
 
 
281 aa  276  5e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  48.33 
 
 
284 aa  272  9e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.97 
 
 
276 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.39 
 
 
283 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.8 
 
 
541 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.53 
 
 
277 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  46.13 
 
 
283 aa  244  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2734  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  50.6 
 
 
285 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  46.99 
 
 
271 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.58 
 
 
277 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.14 
 
 
277 aa  234  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.28 
 
 
285 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.87 
 
 
285 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.71 
 
 
284 aa  231  3e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.58 
 
 
310 aa  230  3e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.91 
 
 
288 aa  229  8e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.81 
 
 
285 aa  225  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.83 
 
 
284 aa  223  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.75 
 
 
273 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.82 
 
 
286 aa  219  7e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.48 
 
 
276 aa  218  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.67 
 
 
281 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  44.96 
 
 
243 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.6 
 
 
257 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  40.32 
 
 
291 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.34 
 
 
270 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.21 
 
 
266 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  39.75 
 
 
263 aa  210  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0930  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.3 
 
 
272 aa  210  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.064976  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
259 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  40.15 
 
 
279 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1548  ABC transporter related  36.53 
 
 
280 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472949  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  45.31 
 
 
281 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  45.87 
 
 
271 aa  206  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  41.56 
 
 
252 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.51 
 
 
252 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  41.42 
 
 
242 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.18 
 
 
253 aa  203  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.16 
 
 
271 aa  202  7e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0475  cobalt transport protein ATP-binding subunit  40 
 
 
280 aa  202  9e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3805  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.02 
 
 
278 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3889  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.15 
 
 
278 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 
249 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.3 
 
 
243 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.91 
 
 
254 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  39.5 
 
 
258 aa  201  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.15 
 
 
249 aa  199  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.77 
 
 
274 aa  199  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1756  cobalt transport protein ATP-binding subunit  38.46 
 
 
274 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.33 
 
 
250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.74 
 
 
264 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2790  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.9 
 
 
305 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.49 
 
 
250 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4179  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 
282 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.968728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  40.5 
 
 
254 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.83 
 
 
270 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  36.33 
 
 
283 aa  196  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  36.33 
 
 
283 aa  196  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41 
 
 
259 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2132  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.34 
 
 
261 aa  196  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1706  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.8 
 
 
267 aa  195  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0646  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.17 
 
 
244 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.67 
 
 
248 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.6 
 
 
246 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  40.76 
 
 
246 aa  194  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 
249 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000284786  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1759  ABC transporter related  36.98 
 
 
291 aa  193  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.807562  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41 
 
 
244 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.97 
 
 
277 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.22 
 
 
286 aa  190  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  40.86 
 
 
299 aa  190  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  39.42 
 
 
255 aa  189  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1205  ABC transporter related protein  43.4 
 
 
251 aa  188  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00143482  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0289  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.44 
 
 
288 aa  188  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0412656  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1453  ATPase  39 
 
 
269 aa  187  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0819756  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.13 
 
 
255 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.93 
 
 
283 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.201845  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1861  ABC transporter related  40.87 
 
 
265 aa  187  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00288336  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1273  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.52 
 
 
247 aa  186  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  39.78 
 
 
273 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  39.78 
 
 
273 aa  184  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3823  ABC transporter related  34.88 
 
 
284 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  41.39 
 
 
276 aa  184  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.37 
 
 
277 aa  184  3e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0715  ABC transporter related  41.84 
 
 
237 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 
280 aa  183  5.0000000000000004e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>