More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1007 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1007  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (cobalt)  100 
 
 		 226 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0583  ABC transporter related  62.05 
 
 		 224 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0503  ABC transporter related  55.31 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.182722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0624  ABC transporter related  61.33 
 
 		 224 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693625  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  48.88 
 
 		 254 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1331  ABC transporter component  50.24 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1195  putative biotin ABC transporter, ATP-binding protein BioM  45.41 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  47.27 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  43.64 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  46.33 
 
 		 243 aa  191  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3686  ABC transporter related  44.5 
 
 		 221 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0505  ABC transporter related protein  42.53 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4655  ABC transporter related  42.01 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1731  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2313  ABC-type cobalt transport system ATPase component  39.91 
 
 		 227 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2112  ABC transporter related  43.75 
 
 		 256 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0676664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5457  cobalt import ATP-binding protein CbiO  43.9 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00770643  normal  0.0928666 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1854  ABC transporter related  39.91 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000267672 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21850  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  43.27 
 
 		 246 aa  167  8e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0432737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3350  ABC transporter related  41.52 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3227  ABC transporter-related protein  40.72 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3688  ABC transporter component  42.65 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296687  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5280  ABC transporter related  40.81 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5369  ABC transporter related  40.81 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5659  ABC transporter related  39.91 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3463  ABC transporter related  38.46 
 
 		 231 aa  155  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1680  ABC transporter related protein  44.13 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4130  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85696  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01750  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.26 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1158  ABC transporter related  38.79 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.91 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  35.59 
 
 		 278 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  37.33 
 
 		 258 aa  139  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  40.2 
 
 		 288 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.56 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2175  ABC transporter, ATPase subunit  33.79 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.358112  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0847  ABC transporter related  34.25 
 
 		 246 aa  134  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  37.68 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  35.71 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2003  ABC transporter related  42.5 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.4 
 
 		 281 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.32 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.53 
 
 		 257 aa  132  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2318  ABC transporter related  34.39 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  34.65 
 
 		 272 aa  131  7.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.63 
 
 		 277 aa  128  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.63 
 
 		 284 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  37.02 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.25 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4599  ABC transporter related  36.36 
 
 		 282 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.530303 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  32.71 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0585  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.11 
 
 		 274 aa  125  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  33.19 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  32.26 
 
 		 303 aa  124  9e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.79 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.78 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0161  ABC transporter related  37.77 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  33.8 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3074  ABC transporter related protein  36.23 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  35.24 
 
 		 281 aa  122  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11110  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.65 
 
 		 238 aa  122  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0035018  normal  0.0238039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  34.1 
 
 		 255 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  34.16 
 
 		 299 aa  122  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  33.94 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5031  ABC transporter related  35.41 
 
 		 269 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20550  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.94 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12810  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.35 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.48 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.79 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  33.49 
 
 		 242 aa  121  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0542  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.31 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.17 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  33.49 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  34.13 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.16 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1963  ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 268 aa  119  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2049  ABC transporter related  33.98 
 
 		 251 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2066  ABC transporter related  33.98 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0721765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2112  ABC transporter related  33.98 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.703459  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2019  ABC transporter-related protein  38.04 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000148673  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1962  ABC transporter related  39.63 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  33.66 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.56 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.49 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0507  ABC transporter related  36.36 
 
 		 234 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1193  ATPase  39.52 
 
 		 243 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.076328  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  32.86 
 
 		 568 aa  118  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0225  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.28 
 
 		 272 aa  118  6e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  32.64 
 
 		 286 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.3 
 
 		 280 aa  118  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000287993  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  32.69 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0005  ABC transporter related  35.14 
 
 		 269 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.964795  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.47 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.68 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  31.63 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.65 
 
 		 256 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1419  ABC transporter related  31.63 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.83 
 
 		 402 aa  116  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>