More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1331 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1331  ABC transporter component  100 
 
 		 226 aa  448  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  61.43 
 
 		 226 aa  274  8e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1195  putative biotin ABC transporter, ATP-binding protein BioM  56 
 
 		 226 aa  261  4.999999999999999e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  57.92 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4655  ABC transporter related  54.87 
 
 		 226 aa  238  5.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.221845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1731  ABC transporter related protein  52.29 
 
 		 224 aa  221  9e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3227  ABC transporter-related protein  55.05 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5457  cobalt import ATP-binding protein CbiO  52.25 
 
 		 224 aa  218  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00770643  normal  0.0928666 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3686  ABC transporter related  52.2 
 
 		 221 aa  215  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0505  ABC transporter related protein  50 
 
 		 226 aa  211  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2313  ABC-type cobalt transport system ATPase component  52.68 
 
 		 227 aa  211  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5659  ABC transporter related  57.64 
 
 		 232 aa  208  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  50.48 
 
 		 222 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3463  ABC transporter related  52.8 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1680  ABC transporter related protein  59.02 
 
 		 245 aa  204  7e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5280  ABC transporter related  56.65 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5369  ABC transporter related  56.65 
 
 		 232 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0503  ABC transporter related  49.02 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.182722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0583  ABC transporter related  49.08 
 
 		 224 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1854  ABC transporter related  51.23 
 
 		 248 aa  190  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000267672 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1007  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (cobalt)  50.24 
 
 		 226 aa  189  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21850  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  50 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0432737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3688  ABC transporter component  51.72 
 
 		 233 aa  187  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296687  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  48.77 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0624  ABC transporter related  50 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693625  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2112  ABC transporter related  48.13 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0676664  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3350  ABC transporter related  50.25 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4130  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85696  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  48.17 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3074  ABC transporter related protein  43.69 
 
 		 228 aa  172  5e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.83 
 
 		 277 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  45.1 
 
 		 273 aa  170  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  45.1 
 
 		 273 aa  170  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01750  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  51.47 
 
 		 230 aa  167  9e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  43.43 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  42.21 
 
 		 278 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0585  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.41 
 
 		 274 aa  162  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  42.63 
 
 		 303 aa  161  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  46.32 
 
 		 277 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.68 
 
 		 281 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1700  ABC transporter related  45.24 
 
 		 272 aa  158  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  44.34 
 
 		 276 aa  156  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2318  ABC transporter related  44.28 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  44.68 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1158  ABC transporter related  45.1 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2912  ABC transporter related  48.7 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.4 
 
 		 253 aa  154  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  42.63 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  39.91 
 
 		 497 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.72 
 
 		 284 aa  152  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 		 249 aa  148  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  39.73 
 
 		 568 aa  148  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2175  ABC transporter, ATPase subunit  42.21 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.358112  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0847  ABC transporter related  42.71 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1153  ABC transporter related protein  44.97 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00125653  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2003  ABC transporter related  44.78 
 
 		 266 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.54 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  41.35 
 
 		 252 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.71 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24060  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.38 
 
 		 278 aa  143  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.569983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.32 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.22 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.64 
 
 		 277 aa  143  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  37.67 
 
 		 593 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  39.8 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.52 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000287993  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.85 
 
 		 248 aa  141  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0225  ABC transporter related  42.44 
 
 		 282 aa  141  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.758643 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.91 
 
 		 280 aa  141  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  39.78 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.03 
 
 		 276 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.91 
 
 		 266 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.71 
 
 		 280 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.24 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.24 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5031  ABC transporter related  38.16 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  40.2 
 
 		 288 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.94 
 
 		 280 aa  139  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.75 
 
 		 280 aa  138  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.75 
 
 		 280 aa  138  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.02 
 
 		 277 aa  138  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.75 
 
 		 300 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.75 
 
 		 300 aa  138  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0999  ABC transporter related  42.05 
 
 		 273 aa  138  7e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0187687  normal  0.71455 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0318  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.47 
 
 		 285 aa  138  7e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.84205e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.38 
 
 		 300 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12810  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.85 
 
 		 280 aa  138  7.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.92 
 
 		 440 aa  137  8.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.2 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  36.4 
 
 		 605 aa  136  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  42.16 
 
 		 277 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  39.62 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1419  ABC transporter related  37.43 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0005  ABC transporter related  41.4 
 
 		 269 aa  136  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.964795  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0136  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.05 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2126  ABC transporter related  45.86 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0584803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.24 
 
 		 288 aa  135  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0288  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.11 
 
 		 277 aa  135  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337056  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  38.57 
 
 		 290 aa  135  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12560  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.46 
 
 		 283 aa  135  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>