More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4599 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4599  ABC transporter related  100 
 
 
282 aa  555  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.530303 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1538  ABC transporter related  69.17 
 
 
260 aa  296  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2321  ABC transporter related  69.1 
 
 
284 aa  292  4e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2318  ABC transporter related  48.67 
 
 
247 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0847  ABC transporter related  48.93 
 
 
246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2175  ABC transporter, ATPase subunit  47.81 
 
 
246 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.358112  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2003  ABC transporter related  48.02 
 
 
266 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213252  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3289  ABC transporter related  40.38 
 
 
222 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.830794  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5031  ABC transporter related  36 
 
 
269 aa  152  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134731  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3661  ABC transporter related  39 
 
 
226 aa  148  9e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2313  ABC-type cobalt transport system ATPase component  38.22 
 
 
227 aa  145  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3686  ABC transporter related  35.24 
 
 
221 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1731  ABC transporter related protein  40.83 
 
 
224 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2912  ABC transporter related  46.3 
 
 
221 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.483465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4655  ABC transporter related  38.39 
 
 
226 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1066  ABC transporter related  37.74 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2112  ABC transporter related  42.72 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0676664  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1195  putative biotin ABC transporter, ATP-binding protein BioM  37.17 
 
 
226 aa  135  9e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3688  ABC transporter component  40.09 
 
 
233 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.296687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5457  cobalt import ATP-binding protein CbiO  37.09 
 
 
224 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00770643  normal  0.0928666 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0503  ABC transporter related  39.27 
 
 
226 aa  132  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.182722  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1331  ABC transporter component  36.67 
 
 
226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1854  ABC transporter related  40.58 
 
 
248 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000267672 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01750  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.38 
 
 
230 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1158  ABC transporter related  38.46 
 
 
238 aa  127  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  39.7 
 
 
243 aa  126  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21850  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.45 
 
 
246 aa  126  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0432737  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 
284 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4130  ABC transporter related protein  38.03 
 
 
233 aa  123  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.85696  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0583  ABC transporter related  35.5 
 
 
224 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331667  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3350  ABC transporter related  36.32 
 
 
230 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5659  ABC transporter related  38.38 
 
 
232 aa  118  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0624  ABC transporter related  33.66 
 
 
224 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.693625  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0505  ABC transporter related protein  37.32 
 
 
226 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5280  ABC transporter related  39.36 
 
 
232 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.312044  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1007  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (cobalt)  36.36 
 
 
226 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.76 
 
 
276 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5369  ABC transporter related  39.36 
 
 
232 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2019  ABC transporter-related protein  39.78 
 
 
242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000148673  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3227  ABC transporter-related protein  35.24 
 
 
231 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4179  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.91 
 
 
282 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.968728  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0540  cobalt import ATP-binding protein CbiO  31.25 
 
 
215 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.76 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0161  ABC transporter related  35.27 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.486582  normal  0.131526 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  32.43 
 
 
250 aa  113  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0475  cobalt transport protein ATP-binding subunit  35.59 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  35.18 
 
 
593 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3889  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 
278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.92 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  36.87 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.98 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.51 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  36.74 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3805  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3823  ABC transporter related  37.62 
 
 
284 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20550  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.3 
 
 
253 aa  109  6e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  34.51 
 
 
568 aa  108  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.93 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.13 
 
 
285 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0650  ABC transporter related protein  27.14 
 
 
277 aa  108  9.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.39 
 
 
277 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1680  ABC transporter related protein  39.6 
 
 
245 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1548  ABC transporter related  33.33 
 
 
280 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  33.33 
 
 
605 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0930  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.36 
 
 
272 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.064976  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  28.84 
 
 
271 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3463  ABC transporter related  33.79 
 
 
231 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.5 
 
 
259 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.38 
 
 
277 aa  106  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0336  ABC transporter related  32.09 
 
 
228 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0600592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.37 
 
 
277 aa  106  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.23 
 
 
310 aa  105  6e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.74 
 
 
456 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  32.51 
 
 
574 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.27 
 
 
281 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  29.67 
 
 
278 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  28.29 
 
 
278 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6066  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.24 
 
 
381 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0507  ABC transporter related  34.42 
 
 
234 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3074  ABC transporter related protein  34.11 
 
 
228 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0347  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  28.63 
 
 
568 aa  103  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  28.78 
 
 
281 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.45 
 
 
243 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  38.95 
 
 
271 aa  103  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  32.88 
 
 
497 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 
253 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  29.13 
 
 
276 aa  102  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0055  ATPase of ABC-type transport systems  33.82 
 
 
810 aa  102  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.165072  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.62 
 
 
276 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1255  ABC transporter related  31.53 
 
 
250 aa  102  6e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000209406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0608  ABC transporter related  31.48 
 
 
483 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1706  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  28.79 
 
 
267 aa  102  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.04 
 
 
250 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.45 
 
 
270 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  32.14 
 
 
288 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.02 
 
 
590 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2780  ABC transporter related  33.85 
 
 
244 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.410215  decreased coverage  0.00175924 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.35 
 
 
254 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  31.96 
 
 
628 aa  102  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  31.19 
 
 
239 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>