More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1255 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1255  ABC transporter related  100 
 
 
250 aa  502  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000209406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  40.24 
 
 
593 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  38.8 
 
 
282 aa  186  4e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  38.56 
 
 
571 aa  182  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1895  ABC transporter related  38.84 
 
 
574 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0190897  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  39.41 
 
 
254 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.74 
 
 
257 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.68 
 
 
254 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.97 
 
 
250 aa  168  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  36.69 
 
 
605 aa  168  9e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  39.92 
 
 
568 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 
249 aa  165  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  36.33 
 
 
548 aa  165  8e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.48 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0225  ABC transporter related  37.25 
 
 
571 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.18 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0707  ABC transporter related  37.4 
 
 
568 aa  162  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0149651 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.93 
 
 
277 aa  162  6e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.39 
 
 
310 aa  161  7e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1105  ABC transporter related  33.74 
 
 
541 aa  161  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.78 
 
 
243 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0681  ABC transporter related  33.74 
 
 
641 aa  158  8e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000207792  normal  0.178275 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  38.72 
 
 
501 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  34.69 
 
 
246 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2703  ABC transporter related  34.18 
 
 
576 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.8 
 
 
256 aa  156  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.4 
 
 
270 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.77 
 
 
281 aa  155  4e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3450  ABC transporter related  34.15 
 
 
582 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0164337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  37.45 
 
 
271 aa  155  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  33.33 
 
 
283 aa  155  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0005  ABC transporter related  36.89 
 
 
269 aa  155  8e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.964795  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  39.81 
 
 
509 aa  155  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 
277 aa  154  9e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  35.48 
 
 
574 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35 
 
 
244 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.42 
 
 
252 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05108  ATP-binding ABC transporter  35.51 
 
 
593 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4409  ABC transporter related  32.51 
 
 
568 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.466878  normal  0.0210144 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.55 
 
 
281 aa  152  5e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.17 
 
 
259 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5235  ABC transporter related  34.45 
 
 
581 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1303  ABC transporter related  40.28 
 
 
481 aa  150  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0918882  normal  0.057241 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  34.18 
 
 
252 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.39 
 
 
278 aa  150  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.87 
 
 
264 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.44 
 
 
266 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
259 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
249 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000284786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.39 
 
 
270 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.23 
 
 
277 aa  148  7e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.02 
 
 
273 aa  148  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.92 
 
 
249 aa  148  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  33.61 
 
 
258 aa  148  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1048  ABC transporter, ATP-binding protein  32.47 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  31.3 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.64 
 
 
402 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  33.6 
 
 
453 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  35.94 
 
 
497 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.38 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.39 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0490  ABC transporter related  31.67 
 
 
239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  35.57 
 
 
272 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  33.86 
 
 
398 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.94 
 
 
541 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.47 
 
 
252 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0613  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 
627 aa  144  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2007  ABC transporter related  32.49 
 
 
239 aa  143  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0936195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.92 
 
 
276 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12810  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  33.06 
 
 
280 aa  142  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.56 
 
 
271 aa  142  5e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001242  ABC transporter ATP-binding protein  33.47 
 
 
579 aa  142  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  35.71 
 
 
557 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.71 
 
 
395 aa  142  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.32 
 
 
250 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  32.95 
 
 
287 aa  142  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1555  ABC transporter  33.88 
 
 
568 aa  141  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.100882  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  33.99 
 
 
456 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.93 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0484  ABC transporter related  32.92 
 
 
240 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0692  ABC transporter related  32.51 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  34.27 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1548  ABC transporter related  31.85 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472949  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1835  putative cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  33.47 
 
 
568 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197968  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.45 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1609  ABC transporter related  41.4 
 
 
478 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 
279 aa  138  6e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.22 
 
 
283 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1540  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.55 
 
 
562 aa  138  7e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1528  ABC transporter related protein  32.58 
 
 
243 aa  138  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.87 
 
 
276 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.61 
 
 
270 aa  138  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.68 
 
 
281 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf376  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.57 
 
 
267 aa  137  2e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0109258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.75 
 
 
280 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1653  ABC transporter related  37.91 
 
 
524 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.264706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0563  ABC transporter related  34.08 
 
 
581 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000790645  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  30.65 
 
 
291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.27 
 
 
280 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  33.06 
 
 
283 aa  135  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>